Agilent MassHunter BioConfirm - Quick Start Guide

Význam tématu

Agilent MassHunter BioConfirm představuje klíčový nástroj pro potvrzení biomolekulární identity a kvantifikaci v rámci průmyslové i akademické analýzy proteomiky a glykomiky. Software nabízí automatizované zpracování dat z TOF a Q-TOF hmotnostních spektrometrů, čímž zefektivňuje validaci intact proteinů, peptidů po proteolytické digesci i uvolněných glykánů. Díky biomolekulocentrickému zobrazení a integrovaným algoritmům pro dekonvoluci, extrakci peptidových rysů a relativní kvantifikaci přináší robustní, reprodukovatelná a přizpůsobitelná řešení pro QA/QC procesy i výzkumné aplikace.

Cíle a přehled článku

Cílem shrnutí je seznámit čtenáře se základní funkcionalitou nástroje BioConfirm a popsat hlavní pracovní postupy: intact protein workflow, protein digest workflow a released glycans workflow. Dále jsou představeny možnosti přizpůsobení rozhraní, migrace metod a novinky verze 10.0.

Použitá metodika a instrumentace

Software je navržen pro spolupráci s daty z Agilent TOF a Q-TOF hmotnostních spektrometrů v kombinaci s chromatografickými systémy (LC-MS). Klíčové algoritmy:

• Protein Deconvolution (MaxEnt, pMod) pro převod vícenásobně nabitých spekter na nulově nabité spektrum.
• Peptide Feature Extractor (PFE) pro identifikaci peptidů ve složitých LC-MS/MS datech.
• Find Glycans pro detekci a kvantifikaci uvolněných glykánů, včetně RT porovnání.

Instrumentační požadavky:

• Agilent MassHunter Workstation s modulem BioConfirm ve verzi 10.0 nebo vyšší.
• TOF či Q-TOF hmotnostní spektrometr s připojením k LC.
• Microsoft Excel 2016 pro reporting.

Hlavní výsledky a diskuse

BioConfirm umožňuje:

• Automatizaci pracovních postupů prostřednictvím Method Automation (Workflow + Reports), včetně dávkového zpracování.
• Interaktivní přehled biomolekul: chromatogramy, spektra, dekonvoluční výsledky, zobrazení glykanových struktur.
• Biomolecule-centric navigaci mezi intact proteiny, peptidy a glykany, s workflow-specifickými záložkami v okně Results Compare.
• Promyšlené uživatelské rozhraní s možností přizpůsobení rozložení pro každý typ workflow (Intact Protein, Protein Digest, Released Glycans).
• Relativní kvantifikaci až pro 10 vzorků současně, s histogramy pro modifikace, proteiny i glykany.
• Podporu přenosu metod z předchozí verze B.09.00 včetně migrace vlastních modifikačních profilů.

Přínosy a praktické využití metody

BioConfirm významně zkracuje dobu analýzy od akvizice dat po finální zprávu. Díky možnosti snadného nasazení v rámci pracovních postupů či výrobního QA/QC zaručuje konzistentní výsledky, minimalizuje lidské chyby a podporuje dokumentaci v podobě tisknutelných či exportovaných reportů. Umožňuje srovnání dat mezi dávkami i mezi různými typy workflow, čímž usnadňuje rozhodování o kvalitě a charakteru analyzovaných vzorků.

Budoucí trendy a možnosti využití

Očekávané směry vývoje zahrnují:

• Integraci strojového učení pro prediktivní identifikaci modifikací a glykanů.
• Rozšíření podpory pro nativní spektrometrii a další biopolymery, např. oligonukleotidy.
• Propojení s platformami pro správu laboratorních dat (LIMS) a digitálními reportovacími nástroji.
• Cloudové řešení pro sdílení a porovnávání výsledků mezi pracovišti.

Závěr

Agilent MassHunter BioConfirm 10.0 představuje vyspělou, přesto uživatelsky přívětivou platformu pro potvrzení identity a kvantifikaci intact proteinů, peptidů a glykánů. Kombinace automatizace, interaktivního grafického prostředí a flexibilních reportovacích možností činí z BioConfirmu ideální nástroj pro moderní bioanalytické i průmyslové laboratoře.

Reference

• Agilent MassHunter BioConfirm Familiarization Guide
• Agilent MassHunter BioConfirm eFamiliarization Guide
• Agilent MassHunter BioConfirm Training Videos
• Online Help (Help menu nebo F1 v aplikaci)