ŘEŠENÍ STRUKTUR CYKLOSPORINU METODOU HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE
Vědecké články | 1997 | Chemické listyInstrumentace
Hmotnostní spektrometrie (MS) představuje klíčovou metodu v organické chemii pro stanovení molekulové hmotnosti, elementárního složení a struktury složitých přírodních i syntetických peptidů. Cyklosporiny, významné imunosupresivní a antifungální undekapeptidy, vyžadují přesnou analýzu pro výzkum, klinickou praxi i vývoj nových derivátů.
Práce se zaměřuje na rozvoj metodických postupů MS pro detailní charakterizaci cyklosporinů a jejich směsí. Hlavním cílem je demonstrovat využití různých ionizačních technik a tandemové MS při určování molekulové hmotnosti, sekvencí aminokyselin, rozdílného chování izobarických zbytků a analýze komplexních reakcí.
Analýzy byly provedeny pomocí následujících technik:
MS spektra FAB prokázala molekulové ionty [M+H]+ a [M+Na]+ cyklosporinu A (m/z 1202,8/1224,8). Nízkohmotnostní oblast odhalila charakteristické imonní ionty aminokyselin (např. N-methyl-leucin m/z 100,1). MS/MS umožnila sekvenční analýzu lineárních fragmentů tubo-undekapeptidů, odhalení míst primárního otevírání kruhu a potvrzení pozice N-methyl-aminokyselin. Izobarické zbytky (Leu vs. Ile, Ala vs. Sar) byly rozlišeny pomocí deuterované matice a sledování hmotnostních posunů fragmentů. Metody HPLC-ESI/APCI-MS ukázaly selektivní detekci minoritních cyklosporinů a metabolitů v biologických vzorcích.
Moderní MS poskytuje vysokou citlivost (detekce femtomolů), rychlou analýzu a možnost kvantitativního stanovení cyklosporinů v biologických matricích. Tandemová MS výrazně zjednodušuje sekvenční analýzu cyklických peptidů, zatímco HPLC-MS usnadňuje profiling směsí a monitorování biotransformací.
Další rozvoj se očekává v miniaturizaci a automatizaci ionizačních zdrojů (nano-ESI), vylepšení rozlišení a rychlosti TOF analyzátorů, v integraci MS imaging pro prostorovou analýzu vzorků a ve využití vysokotlaké mikrofluidiky pro separaci peptidů v reálném čase. Rozšiřuje se aplikace v metabolomice a v klinickém monitoringu imunosuprese.
Synergické použití měkkých ionizačních technik, vysokorozlišovacího a tandemového MS spolu s chromatografickými separacemi nabírá na významu při strukturní analýze cyklosporinů. Metody přinášejí rychlé, citlivé a selektivní analýzy, které podporují výzkum, klinickou praxi i vývoj nových terapeutických derivátů.
LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníProteomika
VýrobceSouhrn
Význam tématu
Hmotnostní spektrometrie (MS) představuje klíčovou metodu v organické chemii pro stanovení molekulové hmotnosti, elementárního složení a struktury složitých přírodních i syntetických peptidů. Cyklosporiny, významné imunosupresivní a antifungální undekapeptidy, vyžadují přesnou analýzu pro výzkum, klinickou praxi i vývoj nových derivátů.
Cíle a přehled studie
Práce se zaměřuje na rozvoj metodických postupů MS pro detailní charakterizaci cyklosporinů a jejich směsí. Hlavním cílem je demonstrovat využití různých ionizačních technik a tandemové MS při určování molekulové hmotnosti, sekvencí aminokyselin, rozdílného chování izobarických zbytků a analýze komplexních reakcí.
Použitá metodika a instrumentace
Analýzy byly provedeny pomocí následujících technik:
- FAST ATOM BOMBARDMENT (FAB) a FAST ION BOMBARDMENT (FIB) pro měkkou ionizaci undekapeptidů
- TANDEMOVÁ hmotnostní spektrometrie (MS/MS) se dvěma spřaženými analyzátory pro kolizní fragmentaci
- HOŘEČNÉ sektorové přístroje s vysokým rozlišením (peak-matching) pro přesné měření elementárního složení
- HPLC spojená s ESI i APCI ionizací pro separaci a průběžnou kolizní fragmentaci eluovaných peptidů
- MALDI-TOF a CF-FAB pro kvantitativní stanovení a rychlou analýzu metabolitů
Hlavní výsledky a diskuse
MS spektra FAB prokázala molekulové ionty [M+H]+ a [M+Na]+ cyklosporinu A (m/z 1202,8/1224,8). Nízkohmotnostní oblast odhalila charakteristické imonní ionty aminokyselin (např. N-methyl-leucin m/z 100,1). MS/MS umožnila sekvenční analýzu lineárních fragmentů tubo-undekapeptidů, odhalení míst primárního otevírání kruhu a potvrzení pozice N-methyl-aminokyselin. Izobarické zbytky (Leu vs. Ile, Ala vs. Sar) byly rozlišeny pomocí deuterované matice a sledování hmotnostních posunů fragmentů. Metody HPLC-ESI/APCI-MS ukázaly selektivní detekci minoritních cyklosporinů a metabolitů v biologických vzorcích.
Přínosy a praktické využití metody
Moderní MS poskytuje vysokou citlivost (detekce femtomolů), rychlou analýzu a možnost kvantitativního stanovení cyklosporinů v biologických matricích. Tandemová MS výrazně zjednodušuje sekvenční analýzu cyklických peptidů, zatímco HPLC-MS usnadňuje profiling směsí a monitorování biotransformací.
Budoucí trendy a možnosti využití
Další rozvoj se očekává v miniaturizaci a automatizaci ionizačních zdrojů (nano-ESI), vylepšení rozlišení a rychlosti TOF analyzátorů, v integraci MS imaging pro prostorovou analýzu vzorků a ve využití vysokotlaké mikrofluidiky pro separaci peptidů v reálném čase. Rozšiřuje se aplikace v metabolomice a v klinickém monitoringu imunosuprese.
Závěr
Synergické použití měkkých ionizačních technik, vysokorozlišovacího a tandemového MS spolu s chromatografickými separacemi nabírá na významu při strukturní analýze cyklosporinů. Metody přinášejí rychlé, citlivé a selektivní analýzy, které podporují výzkum, klinickou praxi i vývoj nových terapeutických derivátů.
Reference
- Wenger R.M.: Prog. Chem. Org. Nat. Prod. 50, 123 (1986)
- Twentyman P.R.: Br. J. Cancer. 57, 254 (1988)
- Rosenwirth B. et al.: Antimicrob. Agents Chemother. 38, 1763 (1994)
- Henricsson S. et al.: Transplant. Proc. 27, 837 (1989)
- Kalinoski H.T. et al.: Biomed. Environ. Mass Spectrom. 15, 239 (1988)
- Cotter R.J., Tabet J.-C.: Int. J. Mass Spectrom. Ion Phys. 53, 151 (1983)
- Traber R. et al.: Helv. Chim. Acta 70, 13 (1987)
- Orlando R. et al.: Org. Mass Spectrom. 24, 1033 (1989)
- de Pauw E.: Mass Spectrom. Rev. 5, 191 (1986)
- Roepstorff P., Fohlman J.: Biomed. Mass Spectrom. 11, 601 (1984)
- Hartman N.R. et al.: Biochem. Biophys. Res. Commun. 133, 964 (1985)
- Biemann K., Scoble H.A.: Science 237, 992 (1987)
- Havlíček V. et al.: Org. Mass Spectrom. 28, 1440 (1993)
- Sedmera P. et al.: Tetrahedron Lett. 36, 6953 (1995)
- Havlíček V.: Disertační práce, VŠCHT Praha (1995)
- Havlíček V. et al.: J. Mass Spectrom. 30, 940 (1995)
- Cordero M.M. et al.: Anal. Chem. 65, 1594 (1993)
- Havlíček V. et al.: Rapid Commun. Mass Spectrom. 9, S158 (1995)
- Jegorov A. et al.: Amino Acids 10, 145 (1996)
- Muddiman D.C. et al.: Anal. Chem. 66, 2362 (1994)
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE NÁMELOVÝCH ALKALOIDŮ
1998||Vědecké články
Chem. Listy 92, 538 - 547 (1998) HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE NÁMELOVÝCH ALKALOIDŮ 1. Uvod PETR HALADA3, ALEXANDR JEGOROV b , MIROSLAV RYSKAC a VLADIMÍR HAVLÍČEK 3 Námelové alkaloidy představují skupinu přírodních látek se širokým spektrem biologických aktivit podmíněných interakcí s různými…
Klíčová slova
alkaloidy, alkaloidyalkaloidů, alkaloidůnámelové, námelovénámelových, námelovýchspektrech, spektrechpři, přiionizací, ionizacíjsou, jsouionty, iontypředevším, předevšímstruktur, strukturdosud, dosudpřírodních, přírodníchergoliny, ergolinyergopeptinů
ZÁKLADY INTERPRETACE HMOTNOSTNÍCH SPEKTER
2020||Vědecké články
Chem. Listy 114, 145−154 (2020) Referát ZÁKLADY INTERPRETACE HMOTNOSTNÍCH SPEKTER Ludovít Škultéty, Jiří Novák a Vladimír Havlíček analýza střevní mikroflóry, která je doménou molekulárních sekvenačních technik. Jinou, pro hmotnostní spektrometrii komplikovanou problematikou, je rozlišení některých typů izomerů či nestabilních látek.…
Klíčová slova
referát, referátspekter, spektertabulka, tabulkakamenů, kamenůstavebních, stavebníchlátek, látekhmotnost, hmotnostatomů, atomůpočtem, počtemaminokyselin, aminokyselininterpretace, interpretacehmotností, hmotnostípeptidů, peptidůzávisí, závisíhmotnosti
ŘEŠENÉ PŘÍKLADY INTERPRETACE PRODUKTOVÝCH SPEKTER PEPTIDŮ
2020||Vědecké články
Chem. Listy 114, 200−208 (2020) Referát ŘEŠENÉ PŘÍKLADY INTERPRETACE PRODUKTOVÝCH SPEKTER PEPTIDŮ tidů2. Spektrum neznámého lineárního peptidu, jehož sekvence je řešena v kap. 2, bylo naměřeno s nízkým rozlišením. Ostatní příklady pak zahrnují hmotnostní spektra s vysokým rozlišením. Profil kolizního…
Klíčová slova
peptid, peptidcyklického, cyklickéhopeptidu, peptidureferát, referátpeptidů, peptidůřetězcem, řetězcemcyklický, cyklickýneribozomálních, neribozomálníchpostranním, postrannímlineárního, lineárníhosekvencí, sekvencípíky, píkydatabáze, databázelineární, lineárnípřípadě
HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE VE STRUKTURNÍ BIOLOGII: URČOVÁNÍ VYŠŠÍ STRUKTURY PROTEINŮ A PROTEINOVÝCH KOMPLEXŮ
2020||Vědecké články
Chem. Listy 114, 187−199 (2020) Referát HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE VE STRUKTURNÍ BIOLOGII: URČOVÁNÍ VYŠŠÍ STRUKTURY PROTEINŮ A PROTEINOVÝCH KOMPLEXŮ Tomáš Vaisar určenou strukturou. Tento dynamický charakter proteinových struktur představuje podstatnou překážku pro určení struktury pomocí rentgenové krystalografie nebo NMR, neboť v…
Klíčová slova
proteinů, proteinůproteinu, proteinuhmotnostní, hmotnostníreferát, referátkomplexů, komplexůjsou, jsouspektrometrie, spektrometriezesítění, zesítěníproteinových, proteinovýchtak, takpak, pakčinidla, činidlasíťovací, síťovacízesítěných, zesítěnýchnebo