Lipid Visualization and Identification Through Collisional Cross Section Aided Correlation of MS Imaging and Ex Situ MS Data for MS-MS Identification
Technické články | 2015 | WatersInstrumentace
Masová spektrometrie (MS) imaging se stala klíčovou metodou v lipidomice pro prostorovou vizualizaci lipidů v tkáňových řezech. Identifikace lipidů však často narazí na komplikace způsobené isobarickými a téměř isobarickými druhy. Začlenění oblasti kolizního průřezu (CCS) nabízí nový rozměr selektivity, který zvyšuje důvěru při přiřazování signálů z MSI k ex situ MS-MS datům.
Hlavním cílem je ukázat, jak lze CCS oblasti využít k propojení dat z MALDI MS imaging a extrahovaných lipidů analyzovaných ex situ MS-MS. Studie demonstruje zvýšenou jistotu identifikace lipidů díky porovnání hmotnostní přesnosti s iontovou mobilitou.
Pro akvizici MS imaging byla použita SYNAPT G2-Si HDMS s TriWave iontovým průvodcem a externím lock-massem pro zachování vysoké hmotnostní přesnosti.
Na základě hmotnostní přesnosti <±3 ppm bylo identifikováno 168 kandidátů. Porovnáním CCS oblastí mezi MSI a dvěma extrakčními datasetty (+/−0,5 %) bylo potvrzeno 50 společných signálů. MS-MS analýza 36 potenciálních glycerofosfolipidů odhalila 34 úspěšně identifikovaných druhů. Fragmentační vzory poskytly potvrzení druhu hlavičkové skupiny i délky acylových řetězců, ačkoli přesný sn1/sn2 orientace zůstala nejednoznačná.
Začlenění CCS oblastí do korelace MS imaging a ex situ MS-MS výrazně posiluje jistotu při identifikaci lipidů. Metoda představuje robustní nástroj pro rozlišení isobarických a téměř isobarických druhů a zlepšuje kvalitu dat v lipidomice.
Iontová mobilita, MS Imaging, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníLipidomika
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Masová spektrometrie (MS) imaging se stala klíčovou metodou v lipidomice pro prostorovou vizualizaci lipidů v tkáňových řezech. Identifikace lipidů však často narazí na komplikace způsobené isobarickými a téměř isobarickými druhy. Začlenění oblasti kolizního průřezu (CCS) nabízí nový rozměr selektivity, který zvyšuje důvěru při přiřazování signálů z MSI k ex situ MS-MS datům.
Cíle a přehled studie / článku
Hlavním cílem je ukázat, jak lze CCS oblasti využít k propojení dat z MALDI MS imaging a extrahovaných lipidů analyzovaných ex situ MS-MS. Studie demonstruje zvýšenou jistotu identifikace lipidů díky porovnání hmotnostní přesnosti s iontovou mobilitou.
Použitá metodika a instrumentace
Pro akvizici MS imaging byla použita SYNAPT G2-Si HDMS s TriWave iontovým průvodcem a externím lock-massem pro zachování vysoké hmotnostní přesnosti.
- Kalibrace iontové mobilitní buňky: poly-alanin + 9-aminoakridin (9-AA) matrix.
- MS imaging: negativní ionový režim, m/z 50–1150, rozlišení 45 µm, High Definition Imaging Software v1.3.
- Ex situ extrakce lipidů: dva protokoly – 2:1 chloroform:ethanol a 4:1 ethanol:voda.
- Analýza extrahovaných lipidů: MALDI MS, výpočet CCS podle kalibračních konstant.
Hlavní výsledky a diskuse
Na základě hmotnostní přesnosti <±3 ppm bylo identifikováno 168 kandidátů. Porovnáním CCS oblastí mezi MSI a dvěma extrakčními datasetty (+/−0,5 %) bylo potvrzeno 50 společných signálů. MS-MS analýza 36 potenciálních glycerofosfolipidů odhalila 34 úspěšně identifikovaných druhů. Fragmentační vzory poskytly potvrzení druhu hlavičkové skupiny i délky acylových řetězců, ačkoli přesný sn1/sn2 orientace zůstala nejednoznačná.
Přínosy a praktické využití metody
- Zvýšená spolehlivost identifikace lipidů v MS imaging pomocí komplementární CCS informace.
- Možnost rozlišení isobarických látek, které nelze oddělit pouhým měřením přesné hmotnosti.
- Efektivnější workflow pro laboratoře provádějící lipidomické mapování a kvalifikaci lipidových biomarkerů.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Integrace CCS databází a strojového učení pro automatizovanou identifikaci lipidů.
- Vývoj pokročilejších iontových mobilitních separátorů umožňujících lepší rozlišení kolizních průřezů.
- Aplikace metody v klinické metabolomice a farmaceutickém vývoji pro detailní mapování lipidových profilů.
Závěr
Začlenění CCS oblastí do korelace MS imaging a ex situ MS-MS výrazně posiluje jistotu při identifikaci lipidů. Metoda představuje robustní nástroj pro rozlišení isobarických a téměř isobarických druhů a zlepšuje kvalitu dat v lipidomice.
Reference
- Towers M., Claude E. Lipid Visualization and Identification Through Collisional Cross Section Aided Correlation of MS Imaging and Ex Situ MS Data for MS-MS Identification. Waters Corporation, 2015.
- Lipid Maps Database: www.lipidmaps.org.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
APPLICATION NOTEBOOK - MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS
2016|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTEBOOK ] MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS 1 This notebook is an excerpt from the larger Waters’ Application Notebook on Metabolomics and Lipidomics #720005245EN TABLE OF CONTENTS 3 Introduction 4 Biomarker Discovery Directly from…
Klíčová slova
imaging, imagingtissue, tissuemaldi, maldidesi, desihdi, hdimobility, mobilitysection, sectiondefinition, definitionion, ionhdms, hdmsbiomarker, biomarkerimage, imagedesorption, desorptionxenograph, xenographionization
CCS-aware SpatialOMx® enables highly confident and automatic lipid annotations with regiospecific context
2021|Bruker|Aplikace
Intensity (arb. unit) 132% 0% 100% PS 38:1 m/z 816.5747 ± 0.0122 1/K0 1.433 ± 0.01 Intensity (arb. unit) Mobility [1/K0] 136% 0% 100% PE 20:1_22:6 m/z 816.5517 ± 0.0122 1/K0 1.404 ± 0.01 m/z 1 mm CCS-aware SpatialOMx® enables…
Klíčová slova
ccs, ccsmaldi, maldispatialomx, spatialomximaging, imagingaware, awareannotation, annotationmobility, mobilitytims, timsannotated, annotatedannotations, annotationspasef, pasefbucket, bucketlipid, lipidsegmentation, segmentationlipids
MALDI Mass Spectrometry Imaging Reveals Distinct Spatio-Molecular Phospholipid Distributions in Mouse Lungs
2020|Bruker|Aplikace
MALDI Mass Spectrometry Imaging Reveals Distinct Spatio-Molecular Phospholipid Distributions in Mouse Lungs While phospholipids play key roles in lung physiology and pathology, the complex composition and function of the lipidome in the lungs is poorly understood. We applied MALDI mass…
Klíčová slova
imaging, imagingtissue, tissuelungs, lungsimages, imagesmaldi, maldiphospholipids, phospholipidsdistributions, distributionslung, lungwere, wereion, ionnegative, negativepositive, positivescils, scilsspatial, spatialbruker
DESI MS Imaging Using SONAR™: A Novel Method to Image Precursor Ions and Fragment Ions for Molecular Identification in a Single Experiment
2018|Waters|Technické články
[ APPLICATION NOTE ] DESI MS Imaging Using SONAR™: A Novel Method to Image Precursor Ions and Fragment Ions for Molecular Identification in a Single Experiment Emmanuelle Claude Waters Corporation, Milford, MA, USA APPLICATION BENEFITS ■■ ■■ INTRODUCTION DESI MS…
Klíčová slova
sonar, sonarimaging, imagingdesi, desiquad, quadscanning, scanningwindow, windowscan, scanprecursor, precursortissue, tissuenote, notemsi, msiapplication, applicationcorrelation, correlationbrain, brainrat