Building a UNIFI Scientific Library for HRMS Screening Experiments
Aplikace | 2014 | WatersInstrumentace
Vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie (HRMS) se stala klíčovou technologií pro screening širokého spektra sloučenin v komplexních matricích. Pro efektivní detekci a minimalizaci falešně pozitivních i falešně negativních výsledků je nezbytné disponovat robustní a komplexní vědeckou knihovnou obsahující kritéria jako teoretické přesné hmoty, fragmentační ionty a retenční časy.
Studie demonstruje postup vytváření knihovny látek v softwaru UNIFI za použití dvou scénářů:
Analýza byla prováděna na systému ACQUITY UPLC I-Class vybaveném Xevo G2-S QTof. Hlavní parametry:
Před vlastní analýzou byla prověřena přesnost hmot a retenčních časů standardní pesticidní směsi. Následně byly za účelem stanovení citlivosti injektovány standardy nových látek v koncentracích 10 a 100 ppb. Identifikace proběhla na základě přesné hmoty a retenčního času; fragmentační ionty byly vybrány pomocí nástroje Fragment Match a ověřeny extrahovanými chromatogramy. Volitelná MS/MS analýza pak poskytla referenční spektra, která byla uložena do knihovny.
Popisovaný postup umožňuje:
Očekává se rozšiřování knihoven o nové kontaminanty, metabolity a emergentní látky. Další směřování zahrnuje integraci s veřejnými databázemi, automatizaci workflow a využití pokročilých algoritmů strojového učení pro zrychlení a zpřesnění identifikace.
UNIFI Scientific Library v kombinaci se systémem ACQUITY UPLC I-Class a Xevo G2-S QTof poskytuje efektivní a ucelené řešení pro HRMS screening. Metodika nabízí vysokou důvěryhodnost výsledků, flexibilitu při rozšiřování knihovny a snadnou správu souvisejících dat.
Software, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníVýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie (HRMS) se stala klíčovou technologií pro screening širokého spektra sloučenin v komplexních matricích. Pro efektivní detekci a minimalizaci falešně pozitivních i falešně negativních výsledků je nezbytné disponovat robustní a komplexní vědeckou knihovnou obsahující kritéria jako teoretické přesné hmoty, fragmentační ionty a retenční časy.
Cíle a přehled studie
Studie demonstruje postup vytváření knihovny látek v softwaru UNIFI za použití dvou scénářů:
- Scénář 1: použití kmenových standardů bez předchozích LC/MS znalostí.
- Scénář 2: použití standardů s existujícími MRM přechody.
Použitá metodika a instrumentace
Analýza byla prováděna na systému ACQUITY UPLC I-Class vybaveném Xevo G2-S QTof. Hlavní parametry:
- Kolona BEH C18 (1,7 µm, 2,1 × 100 mm), teplota 45 °C, průtok 0,45 mL/min.
- Mobilní fáze A: 10 mM octan amonný (pH 5) ve vodě, fáze B: 10 mM octan amonný (pH 5) v methanolu.
- MS akvizice: MSE v kladném i záporném režimu, rozmezí m/z 50–1200, rychlost 4 spektra/s, nízké CE 4 eV, vysoké CE rampy 10–45 eV.
- Software UNIFI: import .mol souborů, Fragment Match pro výpočet fragmentů, Send to MS/MS pro rychlé nastavení cílené MS/MS.
Hlavní výsledky a diskuse
Před vlastní analýzou byla prověřena přesnost hmot a retenčních časů standardní pesticidní směsi. Následně byly za účelem stanovení citlivosti injektovány standardy nových látek v koncentracích 10 a 100 ppb. Identifikace proběhla na základě přesné hmoty a retenčního času; fragmentační ionty byly vybrány pomocí nástroje Fragment Match a ověřeny extrahovanými chromatogramy. Volitelná MS/MS analýza pak poskytla referenční spektra, která byla uložena do knihovny.
Přínosy a praktické využití metody
Popisovaný postup umožňuje:
- Rychlé vytváření a rozšiřování screeningové knihovny.
- Zabezpečení kvality výsledků pomocí interní QC směsi.
- Vysokou spolehlivost identifikace díky kombinaci přesné hmoty, fragmentů, retenčního času a izotopových vzorců.
- Jednoduchou správu metadat, tagování sloučenin a připojování literatury.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšiřování knihoven o nové kontaminanty, metabolity a emergentní látky. Další směřování zahrnuje integraci s veřejnými databázemi, automatizaci workflow a využití pokročilých algoritmů strojového učení pro zrychlení a zpřesnění identifikace.
Závěr
UNIFI Scientific Library v kombinaci se systémem ACQUITY UPLC I-Class a Xevo G2-S QTof poskytuje efektivní a ucelené řešení pro HRMS screening. Metodika nabízí vysokou důvěryhodnost výsledků, flexibilitu při rozšiřování knihovny a snadnou správu souvisejících dat.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Qualitative Pesticide Screening of a Dried Cherry Sample Using HRMS
2015|Waters|Aplikace
Qualitative Pesticide Screening of a Dried Cherry Sample Using HRMS Gareth Cleland, Kendon Graham, Kenneth Rosnack, and Jennifer Burgess Waters Corporation, Milford, MA, USA A P P L I C AT I O N B E N E F I…
Klíčová slova
cherry, cherryyes, yesdried, driedscreening, screeningpesticide, pesticidehrms, hrmsqualitative, qualitativepsas, psasdata, dataunifi, unifiusing, usingwaters, waterssample, samplereview, reviewfragment
A Novel Approach Using UPLC-Tof MSE and the UNIFI Scientific Information System to Facilitate Impurity Profiling of Pharmaceuticals
2016|Waters|Aplikace
A Novel Approach Using UPLC-Tof MS E and the UNIFI Scientific Information System to Facilitate Impurity Profiling of Pharmaceuticals Jayne Kirk,1 Russell Mortishire-Smith,1 and Mark Wrona 2 1 Waters Corporation, Wilmslow, UK 2 Waters Corporation, Milford, MA, USA A P…
Klíčová slova
unifi, unifiuplc, uplcscientific, scientificnovel, noveltof, tofapproach, approachimpurity, impurityinformation, informationaripiprazole, aripiprazolesystem, systemapi, apiimpurities, impuritiestransformation, transformationusing, usingdataset
CASE STUDY 2: Qualitative Pesticide Screening and Binary Comparison of a Spinach Sample Using HRMS
2016|Waters|Aplikace
CASE STUDY 2: Qualitative Pesticide Screening and Binary Comparison of a Spinach Sample Using HRMS Gareth Cleland, Kendon Graham, Kenneth Rosnack, Adam Ladak, and Jennifer Burgess Waters Corporation, Milford, MA, USA A P P L I C AT I O…
Klíčová slova
spinach, spinachreported, reportedyes, yescomponentized, componentizeddata, dataunknown, unknownscreening, screeningtargeted, targetedinterest, interestreview, reviewnon, nonhrms, hrmsuser, usersample, samplemasses
Screening Environmental Samples for a Diverse Range of Compounds With Accurate Mass LC-MS and an Integrated Scientific Information System
2013|Waters|Aplikace
Screening Environmental Samples for a Diverse Range of Compounds With Accurate Mass LC-MS and an Integrated Scientific Information System Gareth Cleland, Claude Mallet, and Jennifer Burgess Waters Corporation, Milford, MA, USA A P P L I C AT I O…
Klíčová slova
screening, screeninganti, antidiverse, diversefalse, falseuplc, uplcbacterials, bacterialscompounds, compoundsdetects, detectsunifi, unifienvironmental, environmentaltoxicology, toxicologyaccurate, accuratenumber, numberacquity, acquitymass