LZE VYUŽÍT METABOLOMICKÉ PROFILOVÁNÍ PRO AUTENTICITU GENETICKY MODIFIKOVANÉ SÓJI?
Vědecké články | 2014 | Chemické listyInstrumentace
Geneticky modifikovaná sója je jednou z nejrozšířenějších plodin se specifickými vlastnostmi, jako je rezistence k herbicidům či vyšší výnosy. Vzhledem k rozdílným regulačním přístupům a povinnému značení GM potravin v EU je nezbytné vyvinout rychlé, spolehlivé a neinvazivní analytické metody pro ověření autenticity sójových výrobků. Metabolomické profilování umožňuje zachytit komplexní obraz nízkomolekulárních látek a poskytuje alternativu ke standardním DNA metodám.
Cílem studie bylo ověřit potenciál techniky Direct Analysis in Real Time – Mass Spectrometry (DART-MS) ve spojení s multivariační statistickou analýzou (PCA, OPLS-DA) pro diskriminaci geneticky modifikované a konvenční sóji. Ve studii bylo analyzováno 49 vzorků sóji (30 GM, 19 konvenčních) s potvrzením druhu pomocí real-time PCR.
Vzorky sóji byly homogenizovány a extrahovány 80% methanolem. Extrakty byly filtrovány a analyzovány DART-MS v pozitivním i negativním ionizačním módu za optimalizovaných podmínek (teplota plynu 450/400 °C, rozlišení 50000 FWHM, m/z 50–1000). Naměřená data byla zpracována softwarem Xcalibur a statisticky vyhodnocena pomocí PCA a OPLS-DA.
DART-MS fingerprint ukázal rozdíly v poměrech intenzit iontů a přítomnost charakteristických markerů. V pozitivním módu byl klíčový ion m/z 163 (1,6-anhydroglukosy), v negativním módu několik mastných kyselin (např. m/z 295, 311, 313, 327, 329). PCA modely již na počátku rozlišily GM a konvenční vzorky a OPLS-DA potvrdila robustní separaci. S-ploty identifikovaly ionty s nejvyšší diskriminační silou, které odpovídají flavonoidům a mastným kyselinám odlišným u GM sóji.
Metoda DART-MS může být rozšířena o tvorbu databází charakteristických markerů pro další GMO plodiny. Kombinace s dalšími omickými technikami (proteomika, lipidomika) a strojovým učením zvýší přesnost klasifikace. V budoucnu lze očekávat integraci přístrojů do mobilních jednotek pro terénní kontroly a rozvoj standardizovaných metodik pro regulatorní účely.
Studie prokázala, že metabolomické profilování pomocí DART-MS ve spojení s multivariační statistikou umožňuje rychlou a spolehlivou diskriminaci geneticky modifikované a konvenční sóji. Identifikované markerové ionty poskytují pevný základ pro další validaci a rozšíření metody v potravinářské praxi.
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, DART
ZaměřeníPotraviny a zemědělství
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Geneticky modifikovaná sója je jednou z nejrozšířenějších plodin se specifickými vlastnostmi, jako je rezistence k herbicidům či vyšší výnosy. Vzhledem k rozdílným regulačním přístupům a povinnému značení GM potravin v EU je nezbytné vyvinout rychlé, spolehlivé a neinvazivní analytické metody pro ověření autenticity sójových výrobků. Metabolomické profilování umožňuje zachytit komplexní obraz nízkomolekulárních látek a poskytuje alternativu ke standardním DNA metodám.
Cíle a přehled studie
Cílem studie bylo ověřit potenciál techniky Direct Analysis in Real Time – Mass Spectrometry (DART-MS) ve spojení s multivariační statistickou analýzou (PCA, OPLS-DA) pro diskriminaci geneticky modifikované a konvenční sóji. Ve studii bylo analyzováno 49 vzorků sóji (30 GM, 19 konvenčních) s potvrzením druhu pomocí real-time PCR.
Použitá instrumentace
- DART-SVP iontový zdroj (IonSense, USA)
- Orbitrapový hmotnostní analyzátor Exactive (Thermo Fisher Scientific, USA)
- Automatický podavač vzorků s posuvným dávkovačem
Použitá metodika
Vzorky sóji byly homogenizovány a extrahovány 80% methanolem. Extrakty byly filtrovány a analyzovány DART-MS v pozitivním i negativním ionizačním módu za optimalizovaných podmínek (teplota plynu 450/400 °C, rozlišení 50000 FWHM, m/z 50–1000). Naměřená data byla zpracována softwarem Xcalibur a statisticky vyhodnocena pomocí PCA a OPLS-DA.
Hlavní výsledky a diskuse
DART-MS fingerprint ukázal rozdíly v poměrech intenzit iontů a přítomnost charakteristických markerů. V pozitivním módu byl klíčový ion m/z 163 (1,6-anhydroglukosy), v negativním módu několik mastných kyselin (např. m/z 295, 311, 313, 327, 329). PCA modely již na počátku rozlišily GM a konvenční vzorky a OPLS-DA potvrdila robustní separaci. S-ploty identifikovaly ionty s nejvyšší diskriminační silou, které odpovídají flavonoidům a mastným kyselinám odlišným u GM sóji.
Přínosy a praktické využití metody
- Rychlá analýza bez chromatografické separace
- Minimální příprava vzorku a nízká spotřeba rozpouštědel
- Vysoká průchodnost („high-throughput“) pro kontrolní laboratoře
- Možnost integrace do pravidelných kontrol food-QA/QC
Budoucí trendy a možnosti využití
Metoda DART-MS může být rozšířena o tvorbu databází charakteristických markerů pro další GMO plodiny. Kombinace s dalšími omickými technikami (proteomika, lipidomika) a strojovým učením zvýší přesnost klasifikace. V budoucnu lze očekávat integraci přístrojů do mobilních jednotek pro terénní kontroly a rozvoj standardizovaných metodik pro regulatorní účely.
Závěr
Studie prokázala, že metabolomické profilování pomocí DART-MS ve spojení s multivariační statistikou umožňuje rychlou a spolehlivou diskriminaci geneticky modifikované a konvenční sóji. Identifikované markerové ionty poskytují pevný základ pro další validaci a rozšíření metody v potravinářské praxi.
Reference
- Nap J. P. et al.: Plant J. 33, 1 (2003)
- James C.: ISSA Briefs 2011, 42
- Phipps R. H., Park J. R.: J. Anim. Feed Sci. 11, 1 (2002)
- Cody R. B. et al.: Anal. Chem. 77, 2297 (2005)
- Vaclavik L. et al.: Anal. Chim. Acta 645, 56 (2009)
- Cajka T. et al.: J. Agric. Food Chem. 59, 5919 (2011)
- Hajslova J. et al.: Food Control 36, 138 (2014)
- Bylesjö M. et al.: J. Chemom. 20, 341 (2006)
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
VYUŽITÍ SUPERKRITICKÉ FLUIDNÍ CHROMATOGRAFIE PRO LIPIDOMICKÉ PROFILOVÁNÍ SÓJOVÉHO A KRAVSKÉHO MLÉKA: AUTENTICITA A DETEKCE FALŠOVÁNÍ
2015|Waters|Vědecké články
Chem. Listy 109, 518526(2015) Laboratorní přístroje a postupy LABORATORNÍ PŘÍSTROJE A POSTUPY VYUŽITÍ SUPERKRITICKÉ FLUIDNÍ CHROMATOGRAFIE PRO LIPIDOMICKÉ PROFILOVÁNÍ SÓJOVÉHO A KRAVSKÉHO MLÉKA: AUTENTICITA A DETEKCE FALŠOVÁNÍ Lipidomických profilů může být využíváno pro hodnocení autenticity potravin a detekci jejich falšování.…
Klíčová slova
laboratorní, laboratornípostupy, postupypřístroje, přístrojedat, datlineárně, lineárněsumární, sumárnívzorec, vzorecanalýzy, analýzysójového, sójovéhokravského, kravskéhomléka, mlékafalšování, falšováníidentifikace, identifikacepro, proanalýza
TECHNIKY METABOLOMIKY V BIOMEDICÍNĚ
2013||Vědecké články
Chem. Listy 107, 311 (2013) Referát TECHNIKY METABOLOMIKY V BIOMEDICÍNĚ PETR WOJTOWICZ, HANA JANEČKOVÁ, DAVID FRIEDECKÝ a TOMÁŠ ADAM mají na jeho genovou expresi malý vliv1. Jinými slovy lze s jistou nadsázkou říci, že genom říká, co by se v…
Klíčová slova
referát, referátpro, prometabolomických, metabolomickýchmetabolomika, metabolomikametabolomické, metabolomickénebo, nebolidských, lidskýchpak, pakčásti, částimetabolický, metabolickýmetabolomického, metabolomickéhometabolomiku, metabolomikupodnět, podnětmetabolomu, metabolomulidskou
ANALÝZA ORGANICKÝCH BARVIV A PIGMENTŮ POUŽÍVANÝCH V UMĚLECKÝCH DÍLECH POMOCÍ LASEROVÉ DESORPČNÍ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE
2014|Bruker|Vědecké články
Chem. Listy 108, 604609(2014) Laboratorní přístroje a postupy ANALÝZA ORGANICKÝCH BARVIV A PIGMENTŮ POUŽÍVANÝCH V UMĚLECKÝCH DÍLECH POMOCÍ LASEROVÉ DESORPČNÍ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE Nejpoužívanější organická barviva v oblasti výtvarného umění byla získávána z rostlin nebo živočichů. Podle chemické klasifikace můžeme tyto…
Klíčová slova
ldms, ldmsbarviv, barvivbarviva, barvivalak, laktempeře, tempeřemodelové, modelovévzorky, vzorkyorganických, organickýchlaků, lakůpigmenty, pigmentylaboratorní, laboratornímódu, módupostupy, postupypřístroje, přístrojenegativním
Abstrakty přednášek v sekci Mládí vpřed a plakátových sdělení 24. ročníku Školy hmotnostní spektrometrie Editoři: Josef Cvačka, Vladimír Vrkoslav, Martin Hubálek, Mikuláš Vlk Milovy, 11. - 15. září 2023 © Spektroskopická společnost Jana Marka Marci, Brno 2023 ISBN: 978-80-88195-43-6 Mládí…
Klíčová slova
hmotnostní, hmotnostnípomocí, pomocípro, provyužitím, využitímstanovení, stanoveníanalýza, analýzapylových, pylovýchpacientů, pacientůzrn, zrnbyla, bylaznaček, značekonemocnění, onemocněnílaserové, laserovélátek, látekanalýzy