Specialista laboratorní automatizace a AI pro high-throughput screening
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. (veřejná výzkumná instituce), je součástí Akademie věd České republiky. V současné době je vědecká činnost ústavu plně orientována na výzkum v oblasti molekulární, strukturní a buněčné biologie, imunologie, funkční genomiky a bioinformatiky.
Ústav byl založen v roce 1962 jako Ústav experimentální biologie a genetiky ČSAV (ÚEBG), který vzešel z bývalého Biologického ústavu ČSAV. V roce 1976 byl ÚEBG spojen s několika biochemickými laboratořemi ÚOCHB a přejmenován na Ústav molekulární genetiky ČSAV (IMG).
Výzkum na Ústavu molekulární genetiky stojí na čtyřech pilířích, které jsou tvořeny z 27 výzkumných a servisně-výzkumných skupin, které zajišťují základní výzkum, dále ze servisních skupin (nebo-li výzkumné servisy), které mj. provozují pokročilá zobrazovací a sekvenační zařízení, poskytují proteomické a cytometrické služby. Třetí pilíř představují 4 výzkumné infrastruktury, které najdete jak v Krči, tak v Centru BIOCEV ve Vestci a posledním důležitým pilířem je mezinárodní prostředí a spolupráce.
CZ-OPENSCREEN: Národní infrastruktura chemické biologie (Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.) hledá kvalifikovaného specialistu pro zajištění provozu a dalšího rozvoje automatizovaných HTS technologií s postupnou integrací nástrojů umělé inteligence do experimentálních a analytických workflow.
Specialista laboratorní automatizace a AI pro high-throughput screening
CZ-OPENSCREEN představuje národní výzkumnou infrastrukturu zapojenou do evropských výzkumných sítí v oblasti chemické biologie a vývoje léčiv. V rámci strategického rozvoje rozšiřujeme využití pokročilé datové analýzy, strojového učení a konceptu „AI-in-the-loop“ pro podporu návrhu experimentů, kontroly kvality dat a optimalizace screeningových kampaní. Pozice nabízí zapojení do interdisciplinárního prostředí na rozhraní laboratorní automatizace, datové vědy a biomedicínského výzkumu.
Náplň práce
- Pravidelná údržba a kalibrace špičkových automatizovaných HTS přístrojů
- Pokročilé řešení problémů a drobné opravy HTS zařízení pro přenos kapalin, robotických ramen a systémů, detekčních zařízení a integrovaných skladovacích systémů
- Návrh nových a optimalizace stávajících protokolů automatizace procesů
- Zajištění obousměrné komunikace jednotlivých zařízení s LIMS a databází
- Vypracování a implementace standardních pracovních postupů (SOP) pro jednotlivá zařízení
- Podpora a školení dalších členů týmu
- Komunikace a interakce s externími dodavateli technologií a jejich servisními týmy.
- Spolupráce na implementaci AI nástrojů do HTS workflow (např. analýza dat, optimalizace experimentů, prediktivní řízení procesů)
- Podpora a rozvoj „AI-in-the-loop“ přístupů, kde AI asistuje při návrhu experimentů, kontrole kvality dat a rozhodování během screeningu
- Spolupráce s bioinformatiky a datovými vědci na integraci modelů strojového učení do experimentálních pipeline
Požadavky
- Vysokoškolské vzdělání technického směru (např. mechanické inženýrství, biomedicínské inženýrství, kybernetika a robotika)
- Ochota učit se novým věcem, výborné organizační a komunikační schopnosti, samostatnost, flexibilita, schopnost týmové práce
- Dobrá znalost anglického jazyka slovem i písmem podmínkou
Výhodou
- Zkušenosti v oblasti elektrotechniky, robotiky, jemné mechaniky, programování (jazyk C#) a automatizace procesů
- Zkušenosti s analýzou experimentálních dat
- Orientace v oblasti machine learning/data science
- Zkušenost s Python ekosystémem (např. práce s daty, automatizace analýz, práce s API)
- Zkušenost s implementací nebo používáním AI nástrojů ve výzkumu nebo průmyslové automatizaci
Nabízíme
- Plný pracovní úvazek
- Platové podmínky odpovídající dané pozici, vzdělání a praxi
- Pracovní smlouva na dobu určitou (1 rok) s možností prodloužení.
- Počátek pracovního poměru dle dohody, možno od 1. 3. 2026
- Zkušební doba 4 měsíce
- Místo výkonu práce je Praha
- Jedinečná možnost pracovat ve špičkově vybavené výzkumné infrastruktuře a v dynamicky se rozvíjejícím multidisciplinárním týmu zahrnující specialisty z oborů chemické biologie, molekulární a buněčné biologie, biochemie, organické a medicinální chemie a cheminformatiky
6 týdnů dovolené - Příspěvek zaměstnavatele na závodní stravování a penzijní připojištění
- Možnost sportovního vyžití v krčském areálu Akademie věd (squash, volejbalový kurt, basketbal, posilovna)
V případě zájmu o tuto pozici zašlete motivační dopis a Váš profesní životopis na adresu Dr. Nataliya Romanyuk ([email protected]).
