Milí zákazníci,
k Vánocům pro vás máme dárek s názvem FreeLAB - inovativní open source projekt pro vaši laboratoř umožňující automatický sběr dat nejen z přístrojů Agilent Technologies. Chceme vám umožnit lépe nahlížet na vaše data, odhalit souvislosti, dát možnost zapomenout na psaní laboratorního deníku a získat statistické údaje o analýzách napříč laboratoří. Pomocí automatického parseru lze importovat také konečné analytické výsledky. A to není zdaleka vše!
FreeLAB, je open source webová aplikace provozována v interní síti laboratoře, která se primárně zaměřuje na sběr dat z různých laboratorních softwarů s cílem umožnit uživatelům přístup k přehledné statistice analýz a dalším užitečným funkcím poptávaným přímo analytiky v laboratořích. Je vytvořena společností HPST, s.r.o., a je distribuována pod licencí GNU GPL.
<h3>Funkce:</h3>
<ul>
<li>Statistika analýz pro přístroje a projekty</li>
<li>Interní publikační systém (Wiki)</li>
<li>Inventář chemikálií, standardů, kolon a vybavení</li>
<li>Sdílený laboratorní kalendář</li>
<li>Automatický parser dat txt, csv, xml,...</li>
<li>Neomezené možnosti customizace</li>
</ul>
Více informací, demo a možnost stažení naleznete na na <a href="https://freelab.hpst.cz">webu freelab</a>
<h3>Výchozí podpora SW</h3>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/648938502b2c47d9a2c609955dad5259/obrazek.png" alt="Open Source LIMS FreeLAB"/>
<ul>
<li>OpenLAB CDS 2.x</li>
<li>OpenLAB ChemStation</li>
<li>MassHunter for GCMS</li>
<li>Third Party SW (via Automatic Parser)</li>
</ul>
Případné dotazy nám prosím napište na <a href="https://community.hpst.cz/t/freelab-general">forum</a> projektu FreeLAB nebo emailem na michal.novotny@hpst.cz
Tým HPST, s.r.o.
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/f2744a456ff346ac933abf0c1fb8bad2/obrazek.png" alt="HPST: Open Source LIMS FreeLAB - Example Network Scheme"/>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/056eb8bc84d84342b049ea70b627a5d1/obrazek.png" alt="HPST: Open Source LIMS FreeLAB - Basic Administration"/>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/608ee2c12c8842139b317bfa5017bb38/obrazek.png" alt="HPST: Open Source LIMS FreeLAB - Basic Administration"/>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/9022a774c97142b2b6fa1684a0fc9f5c/obrazek.png" alt="HPST: Open Source LIMS FreeLAB - Basic Administration"/>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/15c967ad6e4b4d8398f591f5a0270386/obrazek.png" alt="HPST: Open Source LIMS FreeLAB - Basic Administration"/>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/23f6f26c3dc5455faf3f30f7643551ea/obrazek.png" alt="HPST: Open Source LIMS FreeLAB - Basic Administration"/>
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/9c512f0d098945b18ea9f303a06a70c0/obrazek.png" alt="HPST: Open Source LIMS FreeLAB - Basic Administration"/>

Open Source LIMS od HPST, s.r.o.

Software, který pomáhá vědcům z celého světa urychlit práci a usnadnit cestu k vlastním objevům, expanduje z badatelské do komerční sféry. <a href="https://lcms.cz/articles?search=Tom%C3%A1%C5%A1+Pluskal">Dr. Tomáš Pluskal</a>, který vede v <a href="https://lcms.cz/companies/62">ÚOCHB</a> vlastní <a href="https://pluskal.group.uochb.cz/cs">vědeckou skupinu</a>, spolu s dalšími kolegy založili firmu mzio. Navazují tím na velmi úspěšný a dosud dobrovolnický projekt MZmine, který urychluje a zjednodušuje interpretaci biologických a chemických analýz a do něhož přispívají výzkumníci z celého světa.
Společnost <a href="https://mzio.io/">mzio</a> nabízí software, který dokáže najednou zpracovat data ze všech typů přístrojů využívaných v laboratořích hmotnostní spektrometrie. V současnosti se tyto technologie rozvíjejí raketovým tempem a dat získaných jejich prostřednictvím přibývá. Využít tyto informace je ovšem čím dál složitější. Každý přístroj totiž pracuje s jiným formátem a uspořádáním dat a výzkumné týmy tak musejí pochopit a zvládnout řadu softwarových nástrojů pro jejich interpretaci. Projekt mzio s nabídkou jediného univerzálního nástroje pro ně proto znamená významné ulehčení.
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Od_vedeckeho_projektu_ke_globalnimu_byznysu_Firma_mzio_se_snazi_zlepsit_analyzu_dat_v_laboratorich_hmotnostni_spektrometrie_Tym_mzio_zleva_Dr_Tomas_Pluskal_Dr_Robin_Schmid_ed2f73c896.jpg" alt="ÚOCHB: Tým *mzio* (zleva): Dr.Tomáš Pluskal, Dr. Robin Schmid, Dr. Ansgar Korf, Dr. Steffen Heuckeroth a Ludger Rothues."/>
Vedení mzio má k dispozici analýzy, ze kterých vyplývá, že celosvětově vydávají pracoviště hmotnostní spektrometrie za software zhruba 300 milionů dolarů ročně. Podle Tomáše Pluskala je reálné, že si jejich firma z tohoto koláče ukousne nezanedbatelnou část.
„Naše firma je ukázkou úspěšného propojení akademického prostředí a komerce. Vývoj softwaru MZmine průběžně publikovaly renomované vědecké časopisy, včetně Nature Biotechnology a Nature Communications. S orientací v biotechnologickém byznyse nám zase hodně pomohlo inovativní centrum při ÚOCHB i&amp;i Prague, které pomáhá nadějným vědeckým objevům na svět,“ říká Tomáš Pluskal.
<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Od_vedeckeho_projektu_ke_globalnimu_byznysu_Firma_mzio_se_snazi_zlepsit_analyzu_dat_v_laboratorich_hmotnostni_spektrometrie_mzio_6727f00493.jpg" alt="ÚOCHB: Od vědeckého projektu ke globálnímu byznysu. Firma *mzio* se snaží zlepšit analýzu dat v laboratořích hmotnostní spektrometrie."/>
<a href="https://mzio.io/">Společnost mzio</a> kromě něj zakládají další tři kolegové. Robin Schmid a Steffen Heuckeroth přicházejí přímo z akademického prostředí, zatímco výkonný ředitel mzio Ansgar Korf přišel z firmy vyrábějící hmotnostní spektrometry. Kromě toho vstoupil do vedení firmy i hlavní investor, německý obchodník s realitami Ludger Rothues.
V rámci svých služeb nabízí mzio kromě samotného softwaru MZmine i uživatelskou podporu a konzultace. Pro zákazníky z akademického prostředí je ovšem celý balíček stále zdarma a také zdrojové kódy softwaru zůstávají otevřené průběžným úpravám nadšených dobrovolníků. Vědci z celého světa tak mají i dál šanci využívat tento nástroj ke zpracování, analyzování a porovnávání gigabajtů dat o molekulách naměřených pomocí hmotnostní spektrometrie.
<blockquote>
Web společnosti mzio: <a href="https://mzio.io/">mzio.io</a>
</blockquote>

Od vědeckého projektu ke globálnímu byznysu. Firma mzio se snaží zlepšit analýzu dat v laboratořích hmotnostní spektrometrie

DataApex Clarity <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/1009">PDA modul</a> je volitelné rozšíření, které se používá ke zpracování dat získaných z vybraných detektorů fotodiodového pole (DAD/PDA). Spektrální data spolu s chromatogramy dodávají analýze analytických dat třetí rozměr. Toto rozšíření rozšiřuje možnosti software Clarity tím, že poskytuje interaktivní spektrální analýzu, analýzu čistoty píků a identifikaci sloučenin, která je založena na vyhledávání ve spektrální knihovně. Data PDA lze zobrazit v sadě volitelných zobrazení včetně 3D vykreslení.Všechna data jsou uložena v jediném souboru; chromatogram při libovolné vlnové délce nebo dokonce jen spektrum lze po analýze jednoduše vyvolat k přezkoumání. UV-VIS spektra, získaná pomocí PDA detektoru, lze interaktivně vybrat ze signálu chromatogramu pro vizuální kontrolu a porovnání. Spektra lze také použít pro stanovení čistoty píků, optimalizaci vlnových délek a identifikaci složek prostřednictvím spektrálních knihoven.<ul><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/library?manufacturerItems=58&amp;search=pda+extension">Modul PDA</a> je volitelný, plně integrovaný doplněk <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/305">softwaru Clarity</a>.</li><li>Lze jej objednat jako součást nového softwaru nebo jako rozšíření stávajícího softwaru.</li><li>Režim LC-PDA lze zvolit pro jakýkoli LC přístroj v rámci stanice.</li><li>Rozšíření PDA je rovněž kompatibilní se softwarem Clarity Offline.</li></ul><figure class="image"><img style="aspect-ratio:1206/534;" src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Data_Apex_PDA_Extension_776dbd48dd.jpg" alt="DataApex - PDA rozšíření pro software Clarity" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Data_Apex_PDA_Extension_776dbd48dd.jpg 245w," sizes="100vw" width="1206" height="534"></figure><h4>Funkce</h4><ul><li>Data z PDA detektoru: data z analýzy jsou uložena do jednoho souboru; může být uložen chromatogram s libovolnou vlnovou délkou nebo pouze spektrum. UV-VIS spektra, získaná pomocí PDA detektoru, lze interaktivně vybrat ze signálu chromatogramu pro vizuální kontrolu a porovnání. Spektra lze také použít pro stanovení čistoty píků, optimalizaci vlnových délek a identifikaci složek prostřednictvím spektrálních knihoven.</li><li>Zobrazení PDA: Zobrazení PDA je přizpůsobitelné; najednou lze zobrazit až čtyři zobrazení (možná zobrazení: Isoplot, Chromatogram, Spektra, 3D zobrazení, Peak Purity, Peak Purity Spectra, Library Spectra Search a Spectral Library). Uživatel může snadno extrahovat chromatografické signály z dat PDA a určit optimální vlnovou délku detekce pro každý pík.</li><li>Metoda PDA: Metoda Clarity PDA zahrnuje možnost vyhledávání spektrální knihovny a analýzu čistoty píků.</li><li>Čistota píku: Tato analýza pomáhá odhalit skryté nečistoty. Čistota se vypočítá z 5 nebo všech spekter v rámci píku. Křivka podobnosti se zobrazí v okně PDA. Analýzu Peak Purity lze optimalizovat nastavením vlastních preferencí týkajících se prahu čistoty, omezení vlnové délky a prahu absorbance.</li><li>Spektrální knihovna: Software Clarity porovnává spektra píků se spektry neomezeného počtu spektrálních knihoven. Spektra uložená ve spektrální knihovně obsahují retenční časy a parametry analýzy. Vyhledávání ve spektrální knihovně může provádět automatickou identifikaci integrovaných/kalibrovaných složek (píků). Vyhledávání v knihovně lze omezit pomocí okna RT a rozsahu vlnových délek. K dispozici je také možnost korekce pozadí.</li><li>Import/export dat: Spektrální data lze importovat/exportovat v textových formátech ASCII do softwaru Clarity nebo z něj.</li><li>Přehledy: Uživatelé mohou snadno zahrnout možnosti PDA, jako jsou data 3D Display, Isoplot, Spektra, Peak Purity a výsledky vyhledávání v knihovně, do zpráv pomocí intuitivního dialogového okna Report Setup.</li><li>Ovládání přístroje: K dispozici jsou řídicí moduly (p/n A24) pro přístroje Agilent, Shimadzu, Knauer a Duratec DAD (od května 2007). Další řídicí moduly pro jiné detektory PDA lze vyvinout na vyžádání.</li></ul><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Data_Apex_The_PDA_Window_displays_four_views_organized_in_splitters_8c614fb6f0.jpg" alt="DataApex - Náhled rozšíření PDA - čtyři různá zobrazení" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Data_Apex_The_PDA_Window_displays_four_views_organized_in_splitters_8c614fb6f0.jpg 191w," sizes="100vw" width="1098" height="896"><h4>Specifikace</h4><ul><li>Číslo modulu: A29</li><li>Příbuzné produkty:&nbsp;<ul><li>Clarity (p/n C50) - vyžadováno</li><li>Clarity offline (p/n C59)</li><li>LC Control (p/n A24) - viz seznam dostupných detektorů PDA na www.dataapex.com.</li></ul></li></ul>

DataApex PDA - rozšíření o modul detektorů s fotodiodovým polem pro software Clarity

Výrobky z akrylového skla se staly nedílnou součástí našeho každodenního života - od sklíček hodinek až po tlakové trupy ponorek. Doufejme, že tyto průhledné přepážky z období pandemie jsou navždy minulostí. Podle toho, zda je požadován křišťálově průzračný pohled, nebo matné sklo: zakalení akrylátového skla se definuje jako tzv. „hodnota zákalu“, nebo-li turbidita, která se určuje podle normy ASTM D 1003. Hodnotu zákalu lze určit pomocí <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://icpms.cz/products?category=219&amp;distributorItems=43&amp;manufacturerItems=1">UV-Vis spektrofotometru</a> (nebo zkráceně „spektrometru“). Proces měření je však zdlouhavý a při každodenní laboratorní práci není dostatek času na ruční analýzu požadovaných údajů. Proto bylo nutné tento proces automatizovat a zároveň mít na paměti požadavky normy.Akrylátové sklo je plast, který se od svého vynálezu používá v široké škále aplikací. A není divu, nejenže je tento materiál lehký, ale lze jej také bez problémů tepelně tvarovat. Ve většině případů plastové sklo nahrazuje sklo minerální, což znamená, že by mělo být stejně průhledné. Průsvitné akrylátové sklo se však někdy používá také, například v LED panelech nebo pro účely soukromého osvětlení (obrázek 1). Stupeň zakalení akrylátového skla je proto důležitou specifikací pro jeho budoucí použití a musí být kontrolován při kontrole kvality.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Shimadzu_Obrazek_1_Srovnani_pruhledneho_a_prusvitneho_akrylatoveho_skla_Cim_vyssi_je_transmitance_tim_rozmazaneji_se_obrysy_skrze_sklo_jevi_352413d398.jpg" alt="Shimadzu: Obrázek 1 - Srovnání průhledného a průsvitného akrylátového skla. Čím vyšší je difúzní transmitance, tím rozmazaněji se obrysy skrze sklo jeví" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Shimadzu_Obrazek_1_Srovnani_pruhledneho_a_prusvitneho_akrylatoveho_skla_Cim_vyssi_je_transmitance_tim_rozmazaneji_se_obrysy_skrze_sklo_jevi_352413d398.jpg 245w," sizes="100vw" width="1431" height="556">Podle normy ASTM D 1003 se optická kvalita plastového skla udává jako hodnota zákalu. Ten je definován jako procentuální poměr rozptýleného a celkově prošlého viditelného světla vzorkem. Zjednodušeně řečeno, čím nižší je hodnota zakalení, tím je materiál více čirý.Hodnoty propustnosti světla (transmitance) potřebné k výpočtu hodnoty zákalu se buď měří speciálním měřičem zákalu, který je podrobně popsán v normě, nebo se vypočítávají ze spekter pořízených UV-Vis spektrometrem.<h4>Měřiče zákalu vs. spektrometry</h4>Obě zařízení používají zabudovanou kouli mezi vzorkem a detektorem ke sběru difuzně procházejícího světla. Jedná se o dutou kouli s vysoce reflexním vnitřním povrchem, která shromažďuje světlo jako velký trychtýř. Specifikace této koule je popsána v normě a splňují ji zabudované koule Shimadzu s vnitřním průměrem 150 mm (ISR-1503 a ISR-1053F). V aplikačním listu A525A jsou vysvětleny technické podrobnosti.Největším rozdílem mezi měřičem zákalu a spektrometrem je monochromátor. Ten je ve spektrometru umístěn mezi zdrojem světla a vzorkem a rozkládá bílé světlo ze zdroje na různé vlnové délky - v případě viditelného světla od 380 nm do 780 nm (obrázek 2).<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Shimadzu_Obrazek_2_Schema_merice_zakalu_podle_normy_ASTM_D_1003_nahore_a_spektrometru_dole_Oba_pristroje_obsahuji_zdroj_svetla_1_vzorek_2_a_detektor_3_ale_spektrometr_ma_navic_monochromator_4_f8e7cb9a11.jpg" alt="Shimadzu: Obrázek 2 - Schéma měřiče zákalu podle normy ASTM D 1003 (nahoře) a spektrometru (dole). Oba přístroje obsahují zdroj světla (1), vzorek (2) a detektor (3), ale spektrometr má navíc monochromátor (4)" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Shimadzu_Obrazek_2_Schema_merice_zakalu_podle_normy_ASTM_D_1003_nahore_a_spektrometru_dole_Oba_pristroje_obsahuji_zdroj_svetla_1_vzorek_2_a_detektor_3_ale_spektrometr_ma_navic_monochromator_4_f8e7cb9a11.jpg 245w," sizes="100vw" width="1448" height="785">Měřič zákalu nemá monochromátor, takže vždy měří pouze jednu hodnotu: jas světelného zdroje za vzorkem. Naproti tomu spektrometr měří propustnost světla vzorkem pro každou vlnovou délku. To je výhodné, protože ze spektra lze kromě hodnoty zákalu vypočítat i další parametry, jako je barva nebo transmitance ultrafialového, nebo infračerveného světla. V závislosti na konkrétním použití jsou tyto hodnoty vyžadovány dalšími normami, například normou DIN EN 410 pro barevnou stálost a tepelnou izolaci okenních skel.Ale právě tato univerzálnost je tak trochu nevýhodou spektrometru: stanovení hodnoty zákalu vyžaduje oproti měřiči zákalu pro spektrometr práci navíc. Výpočet a vyhodnocení je stále nutné provádět z velké části ručně. To znamená, že laboratoře dříve stály před rozhodnutím, zda zakoupit měřič zákalu, který slouží pouze k jednomu účelu, nebo se smířit s další námahou.<h4>Výpočet hodnoty zákalu</h4>Oba přístroje mohou měřit celkovou transmitanci, kdy prochází veškeré světlo na detektor a difúzní odraz, kdy je světlo rozptýleno vzorkem a toto rozptýlené světlo dopadá na detektor. Tímto způsobem se soubor dat skládá ze surových dat ze čtyř měření:<ul><li>Měření slepého vzorku s nastavením měření pro celou transmitanci, T1 ~ 100 %.</li><li>Celková propustnost světla vzorkem, T2 ≤ 100 %.</li><li>Měření slepého vzorku s nastavením měření pro difúzní transmitanci, T3 ~ 0 %.</li><li>Světlo rozptýlené na vzorku, T4 ≤ T1</li></ul>Protože při měření slepého vzorku není světlo od vzorku odraženo, pohlceno ani rozptýleno, odpovídá hodnota transmitance v ideálním případě 100 % a naopak 0 % jde-li o difúzní transmitanci. U reálných vzorků je pak celková transmitance menší než 100 %, neboť dochází k odrazu a absorpci světla vzorkem. Naměřená hodnota difúzní transmitance závisí do značné míry na hodnotě zákalu a pohybuje se mezi 0 % (žádný zákal) a naměřenou hodnotou celkové transmitance (úplný zákal = 100 %).Při měření spektrometrem je nutno celé spektrum nejprve převést na jednotlivé hodnoty transmitance pro každou vlnovou délku zvlášť.Hodnota transmitance každé vlnové délky je dána intenzitou simulovaného zdroje světla a citlivostí lidského oka na jas. Součet těchto parametrů pro všechny vlnové délky v rozsahu viditelného světla (380-780 nm) se pak vypočítá, aby se celé spektrum (intenzita vs. vlnová délka) převedlo na jedinou hodnotu intenzity. Pro dosažení srovnatelných hodnot jsou emisní křivky přípustných zdrojů světla (wolframová lampa nebo denní světlo) a citlivost lidského oka pro každou vlnovou délku podrobněji popsány a shrnuty v tabulkách v normě ASTM D 1003.Údaje lze převést přímo v programu <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.shimadzu.eu/products/molecular-spectroscopy/uv-vis/uv-vis-nir-spectroscopy-software/labsolutions-uv-vis/index.html">LabSolutions UV-Vis</a> pro každé jednotlivé měření, jak je popsáno, a lze je přednastavit jako automatické zpracování dat. Příslušné tabulky jsou již uloženy v softwaru, takže je třeba pouze vybrat vhodný zdroj světla.Korigovaná hodnota zákalu se vypočítá z těchto čtyř jednotlivých měření odečtením hodnoty zákalu slepého vzorku (ideálně 0) od hodnoty zákalu vzorku:<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Shimadzu_Vypocet_hodnoty_zakalu_32efaa5b83.jpg" alt="Shimadzu: Výpočet hodnoty zákalu" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Shimadzu_Vypocet_hodnoty_zakalu_32efaa5b83.jpg 245w," sizes="100vw" width="981" height="114">Tento poslední krok výpočtu není obvykle možný ze softwaru spektrometru, místo toho je nutné surová data exportovat do vyhodnocovacího softwaru, jako je Microsoft Excel, MathWorks MATLAB nebo OriginLab Origin. Tento manuální krok je velmi náchylný k chybám.<h4>Automatizovaný proces</h4>Aby byl tento časově náročný proces pro uživatele jednodušší, bylo nutné <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.labrulez.com/library?manufacturerItems=3&amp;search=labsolutions+uv-vis">software LabSolutions UV-Vis</a> rozšířit a odpovídajícím způsobem automatizovat. Po pečlivém zvážení normy ASTM D 1003 byla nejprve vypracována šablona Excel pro vyhodnocení po ručním exportu dat a poté rozšířena o automatické měření.V nyní upraveném softwaru lze pro zjednodušení tvorby závěrečné zprávy použít šablonu Excel s připravenými vzorci nebo makry. Pro použití v regulovaném prostředí (21 CFR Part 11) nabízí společnost Shimadzu nástroj LabSolutions Manager pro vykazování více dat, tabulkovou aplikaci s plnou sledovatelností díky auditní stopě a elektronickým podpisům. Pro oba případy je možné vyžádat si připravené šablony pro měření zákalu.<h4>Laboratorní software v praxi</h4>Pro demonstraci vlivu hodnoty zákalu jsou použita čtyři různě zakalená akrylátová skla s odpovídajícími transmitačními spektry a hodnotami zákalu (obr. 3). Byly umístěny před fotografii obličeje pana Genza Shimadzu staršího, zakladatele společnosti Shimadzu.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Shimadzu_Obrazek_3_5c21efb214.jpg" alt="Shimadzu: Obrázek 3 - Příklady různých hodnot zákalu, které se zvyšují od levého k pravému vzorku. Zatímco celková transmitance (modrá křivka) je u všech vzorků téměř stejná, difuzní transmitance (oranžová čára) se s rostoucí hodnotou zákalu zvyšuje" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Shimadzu_Obrazek_3_5c21efb214.jpg 245w," sizes="100vw" width="1590" height="561">Vzorek úplně nalevo s hodnotou zákalu kolem 0 % nemá téměř žádnou difuzní transmitanci a obraz je jasně rozpoznatelný. Zatímco celková transmitance zůstává u všech ostatních vzorků téměř stejná, naměřená hodnota difuzní transmitance se zvyšuje s hodnotou zákalu; obrysy Genzova obličeje jsou stále rozmazanější. U vzorku napravo s téměř 100 % hodnou zákalu jsou obrysy sotva rozpoznatelné; křivky celkové a difúzní transmitance jsou téměř stejné.Měření čtyř požadovaných souborů surových dat a jejich analýzu nyní zjednodušuje speciální měřicí program. Ten uživatele provede jednotlivými kroky a zajistí, aby surová data byla do šablony protokolu zadána ve správném formátu a analyzována.Grafické uživatelské rozhraní tohoto programu je znázorněno na obrázku 4. Přehledné instrukce vedou uživatele analýzou krok za krokem a v případě potřeby i s ilustracemi. Příslušná metadata (Jedná se o vzorek nebo blank? Má se měřit celková nebo difúzní transmitance?) jsou automaticky generována na pozadí a předána do systému LabSolutions UV-Vis. Poté se vygeneruje zpráva pomocí aplikace Excel nebo zpráva s více daty, v závislosti na regulačních požadavcích, kde jsou zde popsané vzorce již uloženy v šabloně zprávy.<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Shimadzu_Obrazek_4_Graficke_rozhrani_makra_Lab_Solutions_UV_Vis_pro_mereni_zakalu_s_jasnymi_pokyny_pro_pripravu_mereni_9fea9f3205.jpg" alt="Shimadzu: Obrázek 4 - Grafické rozhraní makra LabSolutions UV-Vis pro měření zákalu s jasnými pokyny pro přípravu měření" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Shimadzu_Obrazek_4_Graficke_rozhrani_makra_Lab_Solutions_UV_Vis_pro_mereni_zakalu_s_jasnymi_pokyny_pro_pripravu_mereni_9fea9f3205.jpg 245w," sizes="100vw" width="1682" height="794">Tím odpadá nutnost přenášet data do dalšího programu pro vyhodnocení. Automatizace závěrečného a rozhodujícího kroku výpočtu šetří čas a pomáhá předcházet chybám, které mohou vzniknout při přenosu.Hodnota zákalu akrylového skla je rozhodující pro technické použití příslušného výrobku. Čirá čočka s nízkou hodnotou zákalu umožňuje jasný výhled, zatímco zakalená čočka s vysokou hodnotou zákalu rozmazává obrysy všech předmětů za ní. Ruční určení hodnoty zákalu vyžaduje určité základní znalosti. To bylo usnadněno programem s automatickým měřením a jasnými pokyny, který nyní umožňuje provádět analýzy i méně zkušeným uživatelům. Software LabSolutions UV-Vis umožňuje automatizaci pomocí maker a export dat do aplikace Excel. Díky zde uvedenému balíčku zařízení, softwaru a šablonám zpráv je tento proces automatizován. Nyní stačí, když uživatel zadá vzorky a stiskne tlačítko „Start“, aby obdržel hotový report.

Jasné vyhlídky pro akrylátová skla

DataApex je úspěšná česká společnost, která už přes 30 let vyvíjí a celosvětově prodává specializovaný software <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/305">Clarity</a> pro chemické laboratoře. Clarity je komplexní nativní aplikace, která řídí měřicí přístroje různých výrobců, sbírá data a pomáhá vědcům a technikům s jejich vyhodnocováním, zejména v oblasti chromatografie a hmotnostní spektrometrie. Díky své univerzálnosti se Clarity používá v mnoha odvětvích po celém světě.<h5>Aktuálně otevřené pozice:</h5><ul><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/131">Dokumentarista/Uživatelská podpora/Tester</a></li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/2011">Programátor (C++, .NET, Testování, Build)</a></li></ul><h3>1. Dokumentarista/Uživatelská podpora/Tester</h3><h5>Navrhuj nové funkce a buď oporou uživatelům našeho SW Clarity po celém světě!</h5><h4>Proč pracovat právě u nás?</h4><ul><li>Pracuj na smysluplném produktu: Náš software Clarity používají laboratoře ve více než 100 zemích světa. Tvá práce bude mít reálný dopad v oblastech jako je chemická analýza, výzkum a kontrola kvality.</li><li>Prostor pro tvé nápady: Podílej se na návrzích uživatelského rozhraní a funkcionality. Máš nápad, jak něco vylepšit? Sem s ním! Dáváme prostor realizovat vlastní nápady.</li><li>Nekorporátní a přátelská atmosféra: Jsme stabilní česká firma s více než 30letou historií, ale bez zbytečné byrokracie. Zakládáme si na pohodovém prostředí a týmové spolupráci.</li><li>Růst a vzdělávání: Podporujeme tvůj profesní rozvoj. Uč se nové věci a pracuj na sobě s naší podporou.</li><li>Skvělé benefity:&nbsp;<ul><li>Flexibilní pracovní doba</li><li>Možnost částečně pracovat z domova</li><li>5 týdnů dovolené + 3 sick days</li><li>Podíly na zisku (vyplácené 2x ročně)</li><li>Pravidelné firemní akce a teambuildingy (mrkni na náš Facebook!)</li><li>Možnost využít firemní laboratoř, 3D tiskárny a dokonce i Teslu</li></ul></li><li>Férové ohodnocení: Dle tvých zkušeností nabízíme 40 000 – 70 000 Kč.</li></ul><h4>Co bude tvým úkolem? (Náplň práce)</h4><ul><li>Tvorba uživatelské dokumentace v angličtině (příručky, prezentace, elektronická nápověda, technické listy).</li><li>Návrhy funkčnosti a uživatelského rozhraní (UI) softwaru Clarity.</li><li>Podpora našich uživatelů a prodejců z celého světa.</li><li>Analýza a ověřování nahlášených chyb softwaru.</li><li>Manuální testování nových verzí a funkcí softwaru Clarity.</li></ul><h4>Co od tebe očekáváme? (Požadujeme)</h4><ul><li>Znalost analytické chemie: Vzdělání nebo praktická zkušenost v oboru (zejména chromatografie) je klíčová pro pochopení potřeb našich uživatelů.</li><li>Excelentní angličtinu: Potřebujeme tvé výborné vyjadřovací a vysvětlovací schopnosti v anglickém jazyce (slovem i písmem) pro tvorbu dokumentace a komunikaci s uživateli.</li><li>Technické dovednosti: Vysokou znalost práce s dokumentačními a prezentačními programy (MS Office - PowerPoint, Word...). Znalost HTML a CSS pro tvorbu online nápovědy. Znalost programů pro návrh GUI (např. Balsamiq Mockup, Axure) je výhodou.</li><li>Osobnostní předpoklady: Pečlivost, svědomitost, samostatnost, komunikativnost a chuť učit se novým věcem.</li></ul><h4>Praktické informace:</h4><ul><li>Datum nástupu: Ihned nebo dle dohody</li><li>Typ úvazku: Hlavní pracovní poměr (HPP)</li><li>Místo výkonu práce: Praha 5, Hůrka (blízko metra B)</li></ul><h4>Zaujala tě tato příležitost?</h4>Pošli nám svůj životopis a pár řádků o sobě na hruby@dataapex.com. Těšíme se na tebe!<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Data_Apex_Aktivity_v_roce_2024_72cd907af2.jpg" alt="DataApex: Aktivity v roce 2024" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Data_Apex_Aktivity_v_roce_2024_72cd907af2.jpg 156w," sizes="100vw" width="1920" height="1920">

Kariéra DataApex - Dokumentarista/Uživatelská podpora/Tester SW Clarity

DataApex je úspěšná česká společnost, která už přes 30 let vyvíjí a celosvětově prodává specializovaný software <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/305">Clarity</a> pro chemické laboratoře. Clarity je komplexní nativní aplikace, která řídí měřicí přístroje různých výrobců, sbírá data a pomáhá vědcům a technikům s jejich vyhodnocováním, zejména v oblasti chromatografie a hmotnostní spektrometrie. Díky své univerzálnosti se Clarity používá v mnoha odvětvích po celém světě.<h5>Aktuálně otevřené pozice:</h5><ul><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/131">Dokumentarista/Uživatelská podpora/Tester</a></li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/job/2011">Programátor (C++, .NET, Testování, Build)</a></li></ul><h3>2. Programátor (C++, .NET, Testování, Build) SW Clarity</h3><h5>Staň se klíčovým hráčem ve vývoji špičkového softwaru pro laboratoře po celém světě!</h5><h4>Proč pracovat právě u nás?</h4><ul><li>Vyvíjej smysluplný produkt: Náš software Clarity používají laboratoře ve více než 100 zemích světa. Tvá práce bude mít reálný dopad v oblastech jako je chemická analýza, výzkum a kontrola kvality.</li><li>Moderní technologie a prostor pro inovace: Pracujeme s C++20, .NET 7+, modular monoliths a dalšími aktuálními technologiemi a postupy. Máš nápad, jak něco vylepšit? Sem s ním! Dáváme prostor realizovat vlastní nápady.</li><li>Nekorporátní a přátelská atmosféra: Jsme stabilní česká firma s více než 30letou historií, ale bez zbytečné byrokracie. Zakládáme si na pohodovém prostředí a týmové spolupráci.</li><li>Růst a vzdělávání: Podporujeme tvůj profesní rozvoj. Uč se nové věci a pracuj na sobě s naší podporou.</li><li>Skvělé benefity:&nbsp;<ul><li>Flexibilní pracovní doba</li><li>Možnost částečně pracovat z domova</li><li>5 týdnů dovolené + 3 sick days</li><li>Podíly na zisku (vyplácené 2x ročně)</li><li>Pravidelné firemní akce a teambuildingy (mrkni na náš Facebook!)</li><li>Možnost využít firemní laboratoř, 3D tiskárny a dokonce i Teslu</li></ul></li><li>Férové ohodnocení: Dle tvých zkušeností nabízíme 50 000 – 100 000 Kč.</li></ul><h4>Co budeš dělat? (Náplň práce)</h4><ul><li>Podílet se na vývoji a údržbě našeho klíčového produktu Clarity a jeho součástí. Konkrétní zaměření závisí na roli, která tě zajímá.</li></ul><h4>Koho hledáme? (Požadujeme)</h4><ul><li>Nadšence do programování s chutí řešit problémy a dotahovat věci do konce.</li><li>Pečlivého a samostatného člověka, který je zároveň týmovým hráčem a umí komunikovat.</li><li>Ochotu a schopnost neustále se učit nové technologie a postupy.</li><li>Komunikativní úroveň angličtiny.</li><li>SŠ/VŠ vzdělání (IT zaměření).</li><li>Zkušenost s unit testováním je plus.</li><li>Specifické znalosti níže dle role.&nbsp;</li></ul><h4>Otevřené role a specifické požadavky:</h4><h5>1. C++ Developer</h5><ul><li>Profil: Moderní C++ (verze 20+), Clean Architecture. Výhodou: MFC, WinAPI, COM, C#.</li><li>Náplň: Vývoj klientské části Clarity (GUI, backend výpočty, refaktoring, architektura, řízení přístrojů, design, testování, code review).</li></ul><h5>2. Senior .NET Developer</h5><ul><li>Profil: ASP.NET 5/6/7+, Microservices / Modular monoliths, dokumentové/SQL databáze.&nbsp;</li><li>Výhodou: zkušenost s vedením týmu.</li><li>Náplň: Vývoj serverové části Clarity (REST API, víceuživatelský systém, bezpečné ukládání dat, auditování změn).</li></ul><h5>3. Vývojář testů</h5><ul><li>Profil: JavaScript/TypeScript, C#, zkušenosti s automatickým i manuálním testováním, Test Management, Test Design.</li><li>Náplň: Vývoj automatizovaných testů (TestComplete GUI testy, Integrační testy v C#).</li></ul><h5>4. Build Engineer</h5><ul><li>Profil: Docker, MSBuild, C#, Powershell, zkušenosti s buildem a deploymentem softwaru.</li><li>Náplň: Rozvoj a správa našeho build systému.</li></ul><h4>Praktické informace:</h4><ul><li>Datum nástupu: Ihned nebo dle dohody</li><li>Typ úvazku: Hlavní pracovní poměr (HPP)</li><li>Místo výkonu práce: Praha 5, Hůrka (blízko metra B)</li></ul><h4>Zaujala tě tato příležitost?</h4>Pošli nám svůj životopis a pár řádků o sobě na hruby@dataapex.com. Těšíme se na tebe!<img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/Data_Apex_Aktivity_v_roce_2024_72cd907af2.jpg" alt="DataApex: Aktivity v roce 2024" srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_Data_Apex_Aktivity_v_roce_2024_72cd907af2.jpg 156w," sizes="100vw" width="1920" height="1920">

Kariéra DataApex - Programátor (C++, .NET, Testování, Build) SW Clarity

Webináře

Aplikace

Akademie

Osobnosti

Plasty

Životní prostředí

Potraviny

Vody

Zdraví

Přednáška

Vědecký článek

Rozhovor

Toxikologie

Popularizace

Věda a výzkum

Software

Covid-19

Kariéra

Article

Video

Článek

Laboratoře

Různé

Produkt

Poster

Nejbližší akce

Typ novinky

Zaměření

Česká společnost DataApex se od svého založení v roce 1991 věnuje vývoji chromatografického softwaru. DataApex se neustále snaží poskytovat uživatelům efektivní a aktuální nástroje pro zpracování chromatografických dat.

DataApex

Je autorizovaným distributorem společnosti Agilent Technologies pro Českou republiku v oblastech chromatografie (GC, HPLC, UHPLC, kapilární elektroforéza) a hmotnostní spektrometrie (GC/MS, LC/MS, CE/MS), disolučních aparátů, molekulární (UV-Vis, UV-Vis-NIR, fluorescence, FTIR analyzátory a mikroskopy) a atomové spektroskopie (ICP-OES, ICP-MS, AAS), a v neposlední řadě také v oblasti molekulární biologie a genomiky (analýza nukleových kyselin a proteinů, microarray skenery a skla, PCR & RT-PCR, qPCR, řešení pro NGS, reagencie pro mutagenezi a klonování, sondy FISH a další).

Altium International

ÚOCHB AV ČR je přední mezinárodně uznávaná vědecká instituce, jejímž hlavním posláním je základní výzkum v oblasti chemické biologie a medicinální chemie, organické a materiálové chemie, chemie přírodních látek, biochemie a molekulární biologie, fyzikální chemie, teoretické chemie a analytické chemie.

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR

Naším posláním je šířit informace o produktech firmy Shimadzu v oblasti instrumentálních analytických přístrojů, přístrojů pro testování materiálů a speciálních přístrojů pro life science, jejich prodej a následně - instalace, zaškolení, záruční a pozáruční servis, ověřování a validace a aplikační podpora.

LCMS novinky se zaměřením na software - strana 3

Kariéra DataApex - Programátor (C++, .NET, Testování, Build) SW Clarity

Kariéra DataApex - Dokumentarista/Uživatelská podpora/Tester SW Clarity

Jasné vyhlídky pro akrylátová skla

DataApex PDA - rozšíření o modul detektorů s fotodiodovým polem pro software Clarity

Od vědeckého projektu ke globálnímu byznysu. Firma mzio se snaží zlepšit analýzu dat v laboratořích hmotnostní spektrometrie

Open Source LIMS od HPST, s.r.o.

Nejbližší akce

Waters seminář Oligonukleotidy a RNA

LABORATORNÍ MEDICÍNA - ŽERMANICE 2026

Setkání uživatelů Shimadzu 2026

Webináře

Data handling and DMPK analysis with confidence

Reliable quantitation of GLP‑1 analogues in bioanalysis and IP 2026 updates

Enhancing Next-Gen Drug Discovery with High-Performance Inert LC Solutions