Přihlášení
LabRulez
Registrace
Nastavení
Filtrování
Filtrování
Obnova hesla
Obnova hesla

BIOCEV - Centrum molekulární struktury

St, 30.9.2020
| Originální článek z: BioCeV/MBÚ
Centrum molekulární struktury (CMS) sdružuje několik laboratoří poskytujících komplexní přístup ke studiu prostorové struktury, funkce a biofyzikálních vlastností biologických molekul.

BIOCEV: Centrum molekulární struktury - Biotechnologický ústav AV ČR

Společně s centrálními laboratořemi centra CEITEC je CMS sdruženo do České infrastruktury pro integrativní strukturní biologii (CIISB) - přidruženého národního centra Evropského strategického fóra pro výzkumné infrastruktury Instruct (ESFRI; European infrastructure for structural biology Instruct). Členové CIISB reprezentují českou strukturní biologii a Českou republiku jakožto jednu z ustavujících zemí konsorcia INSTRUCT.

CMS poskytuje expertízu, měření a asistenci v následujícíh oblastech:

  • krystalizace biologických molekul
  • monokrystalová rentgenová difrakce
  • řešení krystalových struktur
  • mikrokalorimetrické techniky pro sledování interakcí a stability (ITC, DSC)
  • stanovení parametrů interakcí makromolekulárních látek (SPR)
  • určovaní primární sekvence bílkovin na mikrogramové úrovni a uspořádáni disulfidových můstků (FTMS)
  • charakterizace posttranslačních modifikací
  • mapování terciární a kvartérní struktury

Výzkumní pracovníci, kteří se zasloužili o návrh a realizaci laboratoří CMS:

  • Biofyzikální techniky - Bohdan Schneider (BTÚ)
  • Krystalizace proteinů a nukleových kyselin a Difrakční techniky - Jan Dohnálek (BTÚ)
  • Jarmila Dušková (BTÚ)
  • Tomáš Kovaľ (BTÚ)
  • Karla Fejfarová (BTÚ)
  • Strukturní hmotnostní spektrometrie - Petr Novák (MBÚ)

Laboratoř Strukturní hmotnostní spektrometrie a Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace

Je multidisciplinárním týmem, jehož tematické zaměření je rozděleno do dvou hlavních směrů.

Strukturně biologická skupina produkuje proteiny pomocí rekombinantních expresních technologií a charakterizuje strukturu a dynamiku proteinů nebo komplexů proteinu s ligandem pomocí pokročilé hmotnostní spektrometrie.

Laboratoř strukturní biologie a buněčné signalizace

Skupina buněčné signalizace zkoumá propojení buněčné signalizace na metabolismus rakovinných buněk za použití molekulárně-biologických a biochemických metod.

Skrze spolupráci obou skupin vzniká jedinečná výzkumná platforma, kde výsledky získané studiem biologických systémů mohou být ověřeny a vysvětleny na molekulární úrovni.

Vybavení laboratoře

BIOCEV - Vybavení laboratoře Strukturní hmotnostní spektrometrie

15T-SolariX XR FT-ICR mass spectrometer (Bruker Daltonics)

Bruker Daltonics 15T-Solarix XR FT-ICR mass spectrometer, with electrospray and MALDI ion sources. This ultra-high resolution mass spectrometer is used mostly for the determination of the precise mass of biological macromolecules, and the characterization of their posttranslational modifications. Further possibilities include peptide mass fingerprinting, detection of small molecule/metabolites, monitoring of protein structural changes and protein-protein interactions under physiological conditions by hydrogen-deuterium exchange, chemical cross-linking and covalent labelling.

Agilent Technologies 1200 HPLC system (usually coupled to the 15T-SolariX XR mass spectrometer) for the separation of complex peptide mixtures, proteins and metabolites.

This equipment allows to provide the following services:

  • Protein molecular weight determination by ultra-high resolution FT-ICR mass spectrometer with sequence confirmation by Top-down approach using different fragmentation techniques (collision induced dissociation, electron transfer/capture dissociation);
  • Peptide mass fingerprinting – identification of proteins from gel or solution including larger protein mixtures by using MALDI or ESI ;
  • Characterization of posttranslational modification such as phosphorylation, glycosylation or disulphide bonds;
  • Structural mass spectrometry: limited proteolysis, hydrogen/deuterium exchange, chemical cross-linking, covalent labelling;
  • HPLC separation of peptides, proteins and small molecules (metabolites) coupled with mass spectrometric detection by FT-ICR;
  • Processing and interpretation of mass spectrometric data.
MALDI-TOF (Bruker Daltonics)

Used for routine analysis of peptides and proteins.

Excimer laser (Coherent)

Used for Fast Photochemical Oxidation of Proteins (FPOP) - a type of hydroxyl-radical-based protein footprinting.

HPLC, UPLC (Agilent Technologies)

For the separation of complex peptide mixtures, proteins and metabolites.

BIOCEV
 

Mohlo by Vás zajímat

Development of a Method for Multipesticide Analysis Using the Agilent 1260 Infinity Analytical SFC System with Triple Quadrupole MS Detection

Aplikace
| 2017 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Improving Drug Metabolite Identification in Biofluids with the ACQUITY PREMIER and Hybrid Organic Surface Technology: Increased Sensitivity and Reproducibility

Aplikace
| 2021 | Waters
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Waters
Zaměření
Klinická analýza

Analysis of Kakkonto by Nexera-e and SPD-M30A Photodiode Array Detector (Part 1)

Aplikace
| 2015 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza
 

Podobné články

Článek | Produkt

Shimadzu na ASMS 2020 - pohled zpátky - část LC a LCMS

Podívejte se zpátky na letošní virtuální veletrh Shimadzu na ASMS 2020. Téměř 70 posterů, několik webinářů, nové produkty a 50 let historie a inovací v hmotnostní spektrometrii.
Článek | Webináře

Webináře LC/HRMS - přehled LCMS webinářů v roce 2020

Podívejte se na přehled více než 40 LCMS webinářů zaměřených na využití hmotnostní spektrometrie s vysokým rozlišením (LCHRMS) publikovaných v roce 2020.
Článek | Webináře

LC a LCMS webináře - únor 2021

V únoru 2021 na Vás zatím v oblasti LC a LC/MS čeká celkem 20 zajímavých webinářů. Nenechte si je ujít a rozšiřte své znalosti.
 

Mohlo by Vás zajímat

Development of a Method for Multipesticide Analysis Using the Agilent 1260 Infinity Analytical SFC System with Triple Quadrupole MS Detection

Aplikace
| 2017 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Improving Drug Metabolite Identification in Biofluids with the ACQUITY PREMIER and Hybrid Organic Surface Technology: Increased Sensitivity and Reproducibility

Aplikace
| 2021 | Waters
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Waters
Zaměření
Klinická analýza

Analysis of Kakkonto by Nexera-e and SPD-M30A Photodiode Array Detector (Part 1)

Aplikace
| 2015 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza
 

Podobné články

Článek | Produkt

Shimadzu na ASMS 2020 - pohled zpátky - část LC a LCMS

Podívejte se zpátky na letošní virtuální veletrh Shimadzu na ASMS 2020. Téměř 70 posterů, několik webinářů, nové produkty a 50 let historie a inovací v hmotnostní spektrometrii.
Článek | Webináře

Webináře LC/HRMS - přehled LCMS webinářů v roce 2020

Podívejte se na přehled více než 40 LCMS webinářů zaměřených na využití hmotnostní spektrometrie s vysokým rozlišením (LCHRMS) publikovaných v roce 2020.
Článek | Webináře

LC a LCMS webináře - únor 2021

V únoru 2021 na Vás zatím v oblasti LC a LC/MS čeká celkem 20 zajímavých webinářů. Nenechte si je ujít a rozšiřte své znalosti.
 

Mohlo by Vás zajímat

Development of a Method for Multipesticide Analysis Using the Agilent 1260 Infinity Analytical SFC System with Triple Quadrupole MS Detection

Aplikace
| 2017 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Improving Drug Metabolite Identification in Biofluids with the ACQUITY PREMIER and Hybrid Organic Surface Technology: Increased Sensitivity and Reproducibility

Aplikace
| 2021 | Waters
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Waters
Zaměření
Klinická analýza

Analysis of Kakkonto by Nexera-e and SPD-M30A Photodiode Array Detector (Part 1)

Aplikace
| 2015 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza
 

Podobné články

Článek | Produkt

Shimadzu na ASMS 2020 - pohled zpátky - část LC a LCMS

Podívejte se zpátky na letošní virtuální veletrh Shimadzu na ASMS 2020. Téměř 70 posterů, několik webinářů, nové produkty a 50 let historie a inovací v hmotnostní spektrometrii.
Článek | Webináře

Webináře LC/HRMS - přehled LCMS webinářů v roce 2020

Podívejte se na přehled více než 40 LCMS webinářů zaměřených na využití hmotnostní spektrometrie s vysokým rozlišením (LCHRMS) publikovaných v roce 2020.
Článek | Webináře

LC a LCMS webináře - únor 2021

V únoru 2021 na Vás zatím v oblasti LC a LC/MS čeká celkem 20 zajímavých webinářů. Nenechte si je ujít a rozšiřte své znalosti.
 

Mohlo by Vás zajímat

Development of a Method for Multipesticide Analysis Using the Agilent 1260 Infinity Analytical SFC System with Triple Quadrupole MS Detection

Aplikace
| 2017 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Improving Drug Metabolite Identification in Biofluids with the ACQUITY PREMIER and Hybrid Organic Surface Technology: Increased Sensitivity and Reproducibility

Aplikace
| 2021 | Waters
Instrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Waters
Zaměření
Klinická analýza

Analysis of Kakkonto by Nexera-e and SPD-M30A Photodiode Array Detector (Part 1)

Aplikace
| 2015 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza
 

Podobné články

Článek | Produkt

Shimadzu na ASMS 2020 - pohled zpátky - část LC a LCMS

Podívejte se zpátky na letošní virtuální veletrh Shimadzu na ASMS 2020. Téměř 70 posterů, několik webinářů, nové produkty a 50 let historie a inovací v hmotnostní spektrometrii.
Článek | Webináře

Webináře LC/HRMS - přehled LCMS webinářů v roce 2020

Podívejte se na přehled více než 40 LCMS webinářů zaměřených na využití hmotnostní spektrometrie s vysokým rozlišením (LCHRMS) publikovaných v roce 2020.
Článek | Webináře

LC a LCMS webináře - únor 2021

V únoru 2021 na Vás zatím v oblasti LC a LC/MS čeká celkem 20 zajímavých webinářů. Nenechte si je ujít a rozšiřte své znalosti.
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití

LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena.