Fyziologický ústav AV ČR: Místo, kde se přichází na kloub civilizačním chorobám | LabRulez LCMS

Fyziologický ústav AV ČR: Místo, kde se přichází na kloub civilizačním chorobám

Čt, 24.9.2020
| Originální článek z: AV ČR/FZU AV ČR
Nervová soustava, kardiovaskulární fyziologie a metabolismus – v třítaktním rytmu bije srdce Fyziologického ústavu AV ČR, který patří mezi přední vědecké instituce na poli biomedicínského výzkumu.
Video placeholder

Akademie věd ČR: Fyziologický ústav AV ČR: Místo, kde se přichází na kloub civilizačním chorobám

Podílí se také na činnosti centra BIOCEV a všestranně se zapojuje do modernizace a větší integrace krčského areálu. Do pražské Krče zavítala v úterý 15. září 2020 předsedkyně AV ČR Eva Zažímalová v rámci svého turné po akademických pracovištích.

Akademie věd ČR: Fyziologický ústav AV ČR

Akademie věd ČR: Fyziologický ústav AV ČR

Oddělení Metabolomika

Servisní oddělení zajišťuje metabolomickou analýzu polárních metabolitů, lipidů a sloučenin exposomu v biologických materiálech metodami kapalinové chromatografie ve spojení s hmotnostní spektrometrií (LC–MS).

V rámci projektů využívíme LC–MS postup LIMeX (LIpids, Metabolites and eXposome compounds) pro souběžnou extrakci komplexních lipidů, polárních metabolitů a sloučenin exposomu, která kombinuje cílenou a necílenou LC–MS analýzu. Ve studiích zaměřených na lidské kohorty reportujeme obvykle přes 500 komplexních lipidů, 100 polárních metabolitů a desítky sloučenin exposomu (zejména složek potravin a farmaceutických léčiv).

Cílená analýza je k dispozici pro specifické nízkoabundantní lipidové mediátory (eikosanoidy, endokanabinoidy a větvené estery oxidovaných mastných kyselin (FAHFA)) a steroidy.

Měříme také metabolity značené stabilními izotopy pomocí ¹³C/²H glukosy a ²H₂O (fluxomika).

Pro studie ADME vyvíjíme a validujeme analytické metody pro cílenou analýzu potenciálních kandidátních léčiv v souladu s SLP požadavky.

Laboratoř je vybavena vysokorozlišovacím hmotnostním spektrometrem (Thermo Q Exactive Plus) s kapalinovým chromatografem (Thermo Vanquish) a hmotnostním spektrometrem s quadrupolém/lineární iontovou pastí (SCIEX QTRAP 5500) s kapalinovým chromatografem (Dionex/Thermo Ultimate 3000 RSLC) a vzorkovačem pro přímou infuzi.

Metabolomické soubory jsou zpracovávány za použití nejmodernějších softwarových programů, včetně anotace lipidů, polárních metabolitů a dalších detekovaných sloučenin pomocí vlastních, open-source a komerčních MS/MS spektrálních knihoven. Získaná data se dále zpracovávají pomocí jednorozměrných nebo vícerozměrných statistických metod.

Platformy
  • Kombinovaná necílená a cílená analýza komplexních lipidů (LIMeX)
  • Kombinovaná necílená a cílená analýza polárních metabolitů a látek pocházejících z vnějšího prostředí (LIMeX)
  • Cílená analýza specifických lipidových mediátorů a steroidů
  • Cílená analýza metabolitů značených stabilnými isotopy -Cílená analýza farmaceutických sloučenin pro ADME studie
Matrice
  • Plazma, sérum, tkáně (např. játra, srdce, plíce, sval, tuková tkáň), buňky, exosom, mléko

FZU AV CR: LIMeX postup pro kombinovanou necílenou a cílenou analýzu komplexních lipidů, polárních metabolitů a látek pocházejících z vnějšího prostředí

Oddělení Translační metabolismus

Náš výzkum zahrnuje použití technik založených na hmotnostní spektrometrii k provádění metabolomické a proteomické analýzy různých biologických vzorků. Zabýváme se vývojem a aplikací metod kapalinové chromatografie a kapilární elektroforézy ve spojení s hmotnostní speoktrometrií (LC–MS, CE–MS) pro důkladnou charakterizaci a kvantifikaci komplexních lipidů (lipidom), polárních metabolitů (metabolom), různých exogenních sloučenin jako například složky potravin a léčiva (exposom) a proteinů (proteom). Zaměřujeme se také na zdokonalení zpracování dat, statistické metody a vizualizaci omics dat.

Úspěšně jsme integrovali metody LC–MS pro cílenou a necílenou analýzu lipidů, polárních metabolitů a sloučenin exposomu (LIMeX) pro různé typy vzorků a používáme je pro studie zaměřené na kardiovaskulární onemocnění, diabetes 2. typu, lipogenezi, cirkadiánní rytmy a adherenci k medikamentózní léčbě.

Zkoumáme také proteom lidských zubů a slin a jejich spojitost se zubním kazem. Dále se zabýváme analýzou proteomického složení patologických tkání u onemocnění clubfoot (pes equinovarus, noha kososvislá) a mechanismy remodelace stěny plicních artérií během rozvoje plicní hypertenze. Jsou studovány rovněž posttranslační modifikace proteinů probíhající při stárnutí i chorobách organismu.

Hlavní směry výzkumu
  • Jednoduché, rychlé a robustní metody pro projekty zaměřené na metabolomiku a proteomiku
  • Zpracování, statistická analýza a vizualizace metabolomických dat
  • Nové separační metody (LC–MS, kapilární elektromigrační techniky včetně CE–MS) pro fyziologický výzkum
  • Metabolomika pro studium cirkadiánních rytmů
  • Metabolomika a proteomika pro objevování nových biomarkerů lidského zdraví
  • Prediktivní úloha proteomického složení zubů a slin v etiologii zubního kazu
  • Analýza extracelulární hmoty: od proteinů po tkáňovou architekturu u idiopatického pes equinovarus (noha kososvislá)
  • Mechanismy remodelace stěny plicních artérií během rozvoje plicní hypertenze
  • Posttranslační modifikace proteinů v průběhu stárnutí i chorob (např. diabetes mellitus)

FZU AV CR: Translační metabolismus: Překlenutí mezery mezi výzkumem a medicínou v metabolismu

Akademie věd České republiky
 

Mohlo by Vás zajímat

Routine Determination of Trifluoroacetic Acid (TFA) and Difluoroacetic Acid (DFA) in Surface and Drinking Water by Direct Injection Using UPLC-MS/MS

Aplikace
| 2022 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

Analysis of Multiclass Steroids in Serum Using Agilent Ultivo Triple Quadrupole LC/MS

Aplikace
| 2022 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Klinická analýza

Efficient Method Development on Pharmaceutical Impurities Using Single Quadrupole Mass Spectrometer

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza

Identification of plastic additives in pharmaceutical packaging using a fully automated parallel extraction evaporator system and UHPLC-HRMS

Aplikace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Farmaceutická analýza

How to prolong the lifetime of your HPLC column

Technické články
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
---
 

Podobné články

Článek | Produkt

Opravdu kompletní řešení pro metabolomiku a integrovanou biologii od Agilent Technologies

Metabolomické řešení Agilent na platformě Mass Profiler Professional umožňuje v jedné studii integrovat data ze separačních technik LC, CE, GC ve spojení s QQQ, TOF, QTOF, ale i data z genomiky, proteomiky.
Článek | Nejbližší akce

7. Česká lipidomická konference (REGISTRACE do 4. 5. 2022)

Již za pár dní bude uzavřena bezplatná registrace na letošní 7. ročník České lipidomické konference, která se bude letos konat v prostorách Přírodovědecké fakulty Univerzity Hradec Králové.
Článek | Nejbližší akce

7. Česká lipidomická konference 2022 - Program

Ve čtvrtek 19. května 2022 začíná 7. Česká lipidomická konference, která se bude letos konat na Přírodovědecké fakultě Univerzity Hradec Králové. Odborný program tvoří 24 přednášek a 14 posterových příspěvků.
Článek | Nejbližší akce

Krátké kurzy na 23. Škole MS 2022 (PROGRAM & LEKTOŘI)

Krátké odborné a edukativní kurzy proběhnou v neděli 4. září od 14 do 18 hod. a v pondělí 5. září od 8:30 do 12:30 hod. Jsou rozděleny do bloků o délce 1:45 hod, celková délka jednotlivých kurzů se liší.
 

Mohlo by Vás zajímat

Routine Determination of Trifluoroacetic Acid (TFA) and Difluoroacetic Acid (DFA) in Surface and Drinking Water by Direct Injection Using UPLC-MS/MS

Aplikace
| 2022 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

Analysis of Multiclass Steroids in Serum Using Agilent Ultivo Triple Quadrupole LC/MS

Aplikace
| 2022 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Klinická analýza

Efficient Method Development on Pharmaceutical Impurities Using Single Quadrupole Mass Spectrometer

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza

Identification of plastic additives in pharmaceutical packaging using a fully automated parallel extraction evaporator system and UHPLC-HRMS

Aplikace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Farmaceutická analýza

How to prolong the lifetime of your HPLC column

Technické články
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
---
 

Podobné články

Článek | Produkt

Opravdu kompletní řešení pro metabolomiku a integrovanou biologii od Agilent Technologies

Metabolomické řešení Agilent na platformě Mass Profiler Professional umožňuje v jedné studii integrovat data ze separačních technik LC, CE, GC ve spojení s QQQ, TOF, QTOF, ale i data z genomiky, proteomiky.
Článek | Nejbližší akce

7. Česká lipidomická konference (REGISTRACE do 4. 5. 2022)

Již za pár dní bude uzavřena bezplatná registrace na letošní 7. ročník České lipidomické konference, která se bude letos konat v prostorách Přírodovědecké fakulty Univerzity Hradec Králové.
Článek | Nejbližší akce

7. Česká lipidomická konference 2022 - Program

Ve čtvrtek 19. května 2022 začíná 7. Česká lipidomická konference, která se bude letos konat na Přírodovědecké fakultě Univerzity Hradec Králové. Odborný program tvoří 24 přednášek a 14 posterových příspěvků.
Článek | Nejbližší akce

Krátké kurzy na 23. Škole MS 2022 (PROGRAM & LEKTOŘI)

Krátké odborné a edukativní kurzy proběhnou v neděli 4. září od 14 do 18 hod. a v pondělí 5. září od 8:30 do 12:30 hod. Jsou rozděleny do bloků o délce 1:45 hod, celková délka jednotlivých kurzů se liší.
 

Mohlo by Vás zajímat

Routine Determination of Trifluoroacetic Acid (TFA) and Difluoroacetic Acid (DFA) in Surface and Drinking Water by Direct Injection Using UPLC-MS/MS

Aplikace
| 2022 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

Analysis of Multiclass Steroids in Serum Using Agilent Ultivo Triple Quadrupole LC/MS

Aplikace
| 2022 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Klinická analýza

Efficient Method Development on Pharmaceutical Impurities Using Single Quadrupole Mass Spectrometer

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza

Identification of plastic additives in pharmaceutical packaging using a fully automated parallel extraction evaporator system and UHPLC-HRMS

Aplikace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Farmaceutická analýza

How to prolong the lifetime of your HPLC column

Technické články
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
---
 

Podobné články

Článek | Produkt

Opravdu kompletní řešení pro metabolomiku a integrovanou biologii od Agilent Technologies

Metabolomické řešení Agilent na platformě Mass Profiler Professional umožňuje v jedné studii integrovat data ze separačních technik LC, CE, GC ve spojení s QQQ, TOF, QTOF, ale i data z genomiky, proteomiky.
Článek | Nejbližší akce

7. Česká lipidomická konference (REGISTRACE do 4. 5. 2022)

Již za pár dní bude uzavřena bezplatná registrace na letošní 7. ročník České lipidomické konference, která se bude letos konat v prostorách Přírodovědecké fakulty Univerzity Hradec Králové.
Článek | Nejbližší akce

7. Česká lipidomická konference 2022 - Program

Ve čtvrtek 19. května 2022 začíná 7. Česká lipidomická konference, která se bude letos konat na Přírodovědecké fakultě Univerzity Hradec Králové. Odborný program tvoří 24 přednášek a 14 posterových příspěvků.
Článek | Nejbližší akce

Krátké kurzy na 23. Škole MS 2022 (PROGRAM & LEKTOŘI)

Krátké odborné a edukativní kurzy proběhnou v neděli 4. září od 14 do 18 hod. a v pondělí 5. září od 8:30 do 12:30 hod. Jsou rozděleny do bloků o délce 1:45 hod, celková délka jednotlivých kurzů se liší.
 

Mohlo by Vás zajímat

Routine Determination of Trifluoroacetic Acid (TFA) and Difluoroacetic Acid (DFA) in Surface and Drinking Water by Direct Injection Using UPLC-MS/MS

Aplikace
| 2022 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

Analysis of Multiclass Steroids in Serum Using Agilent Ultivo Triple Quadrupole LC/MS

Aplikace
| 2022 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Klinická analýza

Efficient Method Development on Pharmaceutical Impurities Using Single Quadrupole Mass Spectrometer

Aplikace
| 2022 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza

Identification of plastic additives in pharmaceutical packaging using a fully automated parallel extraction evaporator system and UHPLC-HRMS

Aplikace
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Příprava vzorků, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
Farmaceutická analýza

How to prolong the lifetime of your HPLC column

Technické články
| 2022 | Thermo Fischer Scientific
Instrumentace
Spotřební materiál, LC kolony
Výrobce
Thermo Fischer Scientific
Zaměření
---
 

Podobné články

Článek | Produkt

Opravdu kompletní řešení pro metabolomiku a integrovanou biologii od Agilent Technologies

Metabolomické řešení Agilent na platformě Mass Profiler Professional umožňuje v jedné studii integrovat data ze separačních technik LC, CE, GC ve spojení s QQQ, TOF, QTOF, ale i data z genomiky, proteomiky.
Článek | Nejbližší akce

7. Česká lipidomická konference (REGISTRACE do 4. 5. 2022)

Již za pár dní bude uzavřena bezplatná registrace na letošní 7. ročník České lipidomické konference, která se bude letos konat v prostorách Přírodovědecké fakulty Univerzity Hradec Králové.
Článek | Nejbližší akce

7. Česká lipidomická konference 2022 - Program

Ve čtvrtek 19. května 2022 začíná 7. Česká lipidomická konference, která se bude letos konat na Přírodovědecké fakultě Univerzity Hradec Králové. Odborný program tvoří 24 přednášek a 14 posterových příspěvků.
Článek | Nejbližší akce

Krátké kurzy na 23. Škole MS 2022 (PROGRAM & LEKTOŘI)

Krátké odborné a edukativní kurzy proběhnou v neděli 4. září od 14 do 18 hod. a v pondělí 5. září od 8:30 do 12:30 hod. Jsou rozděleny do bloků o délce 1:45 hod, celková délka jednotlivých kurzů se liší.
Další projekty
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití

LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena.