LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.
Autor
DataApex
DataApex
Česká společnost DataApex se od svého založení v roce 1991 věnuje vývoji chromatografického softwaru. DataApex se neustále snaží poskytovat uživatelům efektivní a aktuální nástroje pro zpracování chromatografických dat.
Tagy
Článek
Video
Software
Produkt
LinkedIn Logo

Základy integrace chromatogramu v chromatografickém softwaru Clarity

Út, 6.1.2026
| Originální článek z: DataApex
Strukturovaný přehled integrace chromatogramu v softwaru Clarity. Vysvětlení globálních a lokálních integračních parametrů, detekce píků, práce se základní linií a přenos integrace do metody.
Video placeholder
  • Foto: DataApex: Základy integrace chromatogramu v Clarity
  • Vide: DataApex: Clarity Tutorial - Peak Integration Overview 

 

Úvod

Tento článek přináší strukturované, technicky zaměřené vysvětlení základního pracovního postupu integrace chromatogramu, jak je prezentován v instruktážním videu pro chromatografický software Clarity. Text se zaměřuje na integrační algoritmus Wave, přičemž popsané principy jsou obecně platné i pro algoritmus Legacy, který je v softwaru Clarity rovněž k dispozici.

Přehled integrace v softwaru Clarity

Integrace chromatogramu se v Clarity provádí v okně Chromatogram, na kartě Integration. Integrační parametry jsou definovány pomocí tabulky, kde každý řádek představuje jednu integrační operaci nebo událost.

Clarity nabízí dva integrační algoritmy:

  • Wave algoritmus – moderní, adaptivní metoda detekce píků (použitá v tomto článku)
  • Legacy algoritmus – tradiční algoritmus zachovaný z důvodu kompatibility

Přestože se jednotlivé parametry mohou mírně lišit, základní integrační workflow je u obou algoritmů shodné.

Typický postup integrace

Integrace chromatogramu v Clarity probíhá v několika logických krocích. Ve většině běžných aplikací postačují první tři kroky k dosažení správné a reprodukovatelné integrace.

Krok 1: Nastavení integračního intervalu

Integrační interval definuje časový úsek chromatogramu, který bude zahrnut do vyhodnocení. Veškerý signál mimo tento interval je při detekci píků ignorován.

Hlavní body:

  • Interval se vybírá graficky přímo v chromatogramu
  • Po použití integrační funkce Clarity automaticky vytvoří nový řádek v integrační tabulce
  • Časy začátku a konce jsou převzaty z grafického výběru
  • Všechny hodnoty v integrační tabulce lze ručně upravit

Tento krok zajišťuje, že nedojde k ovlivnění integrace irelevantními oblastmi (např. rozpouštědlo, promývání kolony)

Krok 2: Detekce negativních píků

Pokud chromatogram obsahuje negativní píky (například vlivem chování detektoru, odečtu pozadí nebo specifických analytických postupů), je nutné aktivovat funkci Detect Negative Peaks.

Pokud tato volba není zapnuta, negativní píky nebudou zahrnuty do integrace, což může vést k neúplné nebo chybné kvantifikaci.

Krok 3: Nastavení globálních integračních parametrů

Globální parametry určují způsob detekce píků v rámci celého integračního intervalu. Tyto parametry definují základní citlivost a selektivitu integrace.

Globální šířka píku (Global Peak Width)
  • Reprezentuje nejužší očekávaný pík
  • Slouží k určení shlukování píků (bunching)
  • Klíčová pro rozlišení blízce eluujících píků
Globální práh (Global Threshold)
  • Definuje úroveň šumu
  • Signály pod touto úrovní jsou považovány za šum
  • Správné nastavení zabraňuje falešné detekci píků
Globální sklon základní linie (Global Baseline Slope)
  • Ovlivňuje určení začátků a konců píků
  • Pomáhá přizpůsobit integraci šikmým nebo driftujícím základním liniím

Ve většině rutinních aplikací jsou tyto globální parametry dostačující pro správnou integraci.

Pokročilé úpravy integrace

V případech, kdy globální nastavení nestačí, nabízí Clarity nástroje pro lokální a pík-specifické doladění integrace.

Krok 4: Použití lokálních integračních parametrů

Lokální parametry se vztahují pouze na vybraný časový úsek chromatogramu. Využívají se zejména tehdy, když:

  • se tvary píků v průběhu analýzy výrazně liší
  • určitá oblast vyžaduje odlišnou citlivost
  • dochází k překryvu nebo nedostatečnému rozlišení píků

Clarity uživateli navrhne vhodné hodnoty parametrů, které lze dále upravit.

Krok 5: Operace specifické pro píky a základní linii

Pro finální doladění integrace lze použít:

  • pík-specifické integrační parametry
  • operace se základní linií

Tyto nástroje se obvykle používají k:

  • úpravě začátků a konců konkrétních píků
  • řešení atypických tvarů píků
  • zajištění konzistence u klíčových analytů

Tento krok je typický zejména pro složité chromatogramy nebo validované metody.

Logika integrační tabulky a pořadí operací

Každý řádek integrační tabulky představuje jednu integrační událost. Pořadí řádků je zásadní:

  • Operace se aplikují shora dolů
  • Pozdější řádky mohou upravovat výsledky předchozích kroků
  • Správné uspořádání zajišťuje předvídatelné a reprodukovatelné výsledky

Vícesignálové chromatogramy

U chromatogramů s více signály platí:

  • Každý signál má vlastní integrační tabulku
  • Integraci je nutné nastavit samostatně pro každý signál

Tím je zajištěna správná detekce a kvantifikace všech signálů.

Přenos integrace do metody a dalších chromatogramů

Jakmile integrační nastavení vyhovuje typickému chromatogramu, lze hotovou integrační tabulku:

  • přenést do analytické metody
  • použít pro další chromatogramy měřené za stejných podmínek

Tento postup podporuje konzistentní zpracování dat, validaci metod a dlouhodobou reprodukovatelnost výsledků.

Závěr

Integrace chromatogramu v softwaru Clarity je založena na jasně strukturovaném postupu, který začíná definicí integračního intervalu a globálních parametrů a v případě potřeby pokračuje lokálními a pík-specifickými úpravami.

Ve většině rutinních aplikací postačují:

  1. nastavení integračního intervalu
  2. aktivace detekce negativních píků
  3. úprava globálních parametrů

Porozumění hierarchii a pořadí integračních operací je klíčové pro tvorbu robustních metod a dosažení konzistentních analytických výsledků.

DataApex
LinkedIn Logo
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Analysis of Food Allergens, Including Nuts and Fruits, Using a Triple Quadrupole Mass Spectrometer

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Top-Down Sequence Analysis of Intact Proteins Using an Agilent AdvanceBio 6545XT LC/Q-TOF with ExD

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Farmaceutická analýza

A Sensitive and Cost-Effective LC–MS Method for Quantifying N-Nitroso-Atenolol in Drug Formulation

Aplikace
| 2025 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Farmaceutická analýza

Automated Bioprocess Monitoring with Agilent 1290 Infinity III Bio Online LC Solutions

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Farmaceutická analýza

Optimization of Supercritical Fluid Extraction Parameters for Vitamins D2, D3, and K1 from Pharmaceutical Preparations

Technické články
| 2025 | Shimadzu
Instrumentace
SFC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza
 

Podobné články

Co se děje v buňkách, vidíme líp zásluhou objevu z ÚOCHB
Článek | Video

Co se děje v buňkách, vidíme líp zásluhou objevu z ÚOCHB

Vědci z Ústav organické chemie a biochemie AV ČR vyvinuli nové fluorogenní značky, které výrazně zpřesňují fluorescenční mikroskopii a umožňují sledovat buněčné procesy bez rušivého pozadí.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR
tag
share
more
Úvod do validace čištění: principy, rizika a regulační požadavky
Článek | Věda a výzkum

Úvod do validace čištění: principy, rizika a regulační požadavky

Validace čištění je klíčovým prvkem GMP, který chrání pacienty, kvalitu léčiv i výrobce. Článek vysvětluje principy, rizika křížové kontaminace a aktuální regulační požadavky v EU i globálně.
SHIMADZU Handels GmbH - organizační složka
tag
share
more
INOVATIVNÍ ŘEŠENÍ PROBLEMATIKY PESTICIDŮ VE VODNÍCH ZDROJÍCH
Článek | Věda a výzkum

INOVATIVNÍ ŘEŠENÍ PROBLEMATIKY PESTICIDŮ VE VODNÍCH ZDROJÍCH

Rozsáhlý monitoring půd a povrchových vod v ČR odhalil plošnou kontaminaci pesticidy a častá překročení limitů. Článek představuje výsledky studie ALS a ověřené in-situ řešení pomocí štěpkových bioreaktorů.
ALS Czech Republic
tag
share
more
Waters VIZE 2025: Dá se ještě něco nového vymyslet v HPLC, nebo už jen vylepšujeme technologii?
Přednáška | Video

Waters VIZE 2025: Dá se ještě něco nového vymyslet v HPLC, nebo už jen vylepšujeme technologii?

Je kapalinová chromatografie na konci vývoje, nebo teprve na začátku nové éry? Přehled klíčových inovací v LC – od sorbentů a kolon až po bio-inertní systémy a software.
Waters Gesellschaft
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Analysis of Food Allergens, Including Nuts and Fruits, Using a Triple Quadrupole Mass Spectrometer

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Top-Down Sequence Analysis of Intact Proteins Using an Agilent AdvanceBio 6545XT LC/Q-TOF with ExD

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Farmaceutická analýza

A Sensitive and Cost-Effective LC–MS Method for Quantifying N-Nitroso-Atenolol in Drug Formulation

Aplikace
| 2025 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Farmaceutická analýza

Automated Bioprocess Monitoring with Agilent 1290 Infinity III Bio Online LC Solutions

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Farmaceutická analýza

Optimization of Supercritical Fluid Extraction Parameters for Vitamins D2, D3, and K1 from Pharmaceutical Preparations

Technické články
| 2025 | Shimadzu
Instrumentace
SFC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza
 

Podobné články

Co se děje v buňkách, vidíme líp zásluhou objevu z ÚOCHB
Článek | Video

Co se děje v buňkách, vidíme líp zásluhou objevu z ÚOCHB

Vědci z Ústav organické chemie a biochemie AV ČR vyvinuli nové fluorogenní značky, které výrazně zpřesňují fluorescenční mikroskopii a umožňují sledovat buněčné procesy bez rušivého pozadí.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR
tag
share
more
Úvod do validace čištění: principy, rizika a regulační požadavky
Článek | Věda a výzkum

Úvod do validace čištění: principy, rizika a regulační požadavky

Validace čištění je klíčovým prvkem GMP, který chrání pacienty, kvalitu léčiv i výrobce. Článek vysvětluje principy, rizika křížové kontaminace a aktuální regulační požadavky v EU i globálně.
SHIMADZU Handels GmbH - organizační složka
tag
share
more
INOVATIVNÍ ŘEŠENÍ PROBLEMATIKY PESTICIDŮ VE VODNÍCH ZDROJÍCH
Článek | Věda a výzkum

INOVATIVNÍ ŘEŠENÍ PROBLEMATIKY PESTICIDŮ VE VODNÍCH ZDROJÍCH

Rozsáhlý monitoring půd a povrchových vod v ČR odhalil plošnou kontaminaci pesticidy a častá překročení limitů. Článek představuje výsledky studie ALS a ověřené in-situ řešení pomocí štěpkových bioreaktorů.
ALS Czech Republic
tag
share
more
Waters VIZE 2025: Dá se ještě něco nového vymyslet v HPLC, nebo už jen vylepšujeme technologii?
Přednáška | Video

Waters VIZE 2025: Dá se ještě něco nového vymyslet v HPLC, nebo už jen vylepšujeme technologii?

Je kapalinová chromatografie na konci vývoje, nebo teprve na začátku nové éry? Přehled klíčových inovací v LC – od sorbentů a kolon až po bio-inertní systémy a software.
Waters Gesellschaft
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Analysis of Food Allergens, Including Nuts and Fruits, Using a Triple Quadrupole Mass Spectrometer

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Top-Down Sequence Analysis of Intact Proteins Using an Agilent AdvanceBio 6545XT LC/Q-TOF with ExD

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Farmaceutická analýza

A Sensitive and Cost-Effective LC–MS Method for Quantifying N-Nitroso-Atenolol in Drug Formulation

Aplikace
| 2025 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Farmaceutická analýza

Automated Bioprocess Monitoring with Agilent 1290 Infinity III Bio Online LC Solutions

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Farmaceutická analýza

Optimization of Supercritical Fluid Extraction Parameters for Vitamins D2, D3, and K1 from Pharmaceutical Preparations

Technické články
| 2025 | Shimadzu
Instrumentace
SFC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza
 

Podobné články

Co se děje v buňkách, vidíme líp zásluhou objevu z ÚOCHB
Článek | Video

Co se děje v buňkách, vidíme líp zásluhou objevu z ÚOCHB

Vědci z Ústav organické chemie a biochemie AV ČR vyvinuli nové fluorogenní značky, které výrazně zpřesňují fluorescenční mikroskopii a umožňují sledovat buněčné procesy bez rušivého pozadí.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR
tag
share
more
Úvod do validace čištění: principy, rizika a regulační požadavky
Článek | Věda a výzkum

Úvod do validace čištění: principy, rizika a regulační požadavky

Validace čištění je klíčovým prvkem GMP, který chrání pacienty, kvalitu léčiv i výrobce. Článek vysvětluje principy, rizika křížové kontaminace a aktuální regulační požadavky v EU i globálně.
SHIMADZU Handels GmbH - organizační složka
tag
share
more
INOVATIVNÍ ŘEŠENÍ PROBLEMATIKY PESTICIDŮ VE VODNÍCH ZDROJÍCH
Článek | Věda a výzkum

INOVATIVNÍ ŘEŠENÍ PROBLEMATIKY PESTICIDŮ VE VODNÍCH ZDROJÍCH

Rozsáhlý monitoring půd a povrchových vod v ČR odhalil plošnou kontaminaci pesticidy a častá překročení limitů. Článek představuje výsledky studie ALS a ověřené in-situ řešení pomocí štěpkových bioreaktorů.
ALS Czech Republic
tag
share
more
Waters VIZE 2025: Dá se ještě něco nového vymyslet v HPLC, nebo už jen vylepšujeme technologii?
Přednáška | Video

Waters VIZE 2025: Dá se ještě něco nového vymyslet v HPLC, nebo už jen vylepšujeme technologii?

Je kapalinová chromatografie na konci vývoje, nebo teprve na začátku nové éry? Přehled klíčových inovací v LC – od sorbentů a kolon až po bio-inertní systémy a software.
Waters Gesellschaft
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Analysis of Food Allergens, Including Nuts and Fruits, Using a Triple Quadrupole Mass Spectrometer

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Potraviny a zemědělství

Top-Down Sequence Analysis of Intact Proteins Using an Agilent AdvanceBio 6545XT LC/Q-TOF with ExD

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Farmaceutická analýza

A Sensitive and Cost-Effective LC–MS Method for Quantifying N-Nitroso-Atenolol in Drug Formulation

Aplikace
| 2025 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/SQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Farmaceutická analýza

Automated Bioprocess Monitoring with Agilent 1290 Infinity III Bio Online LC Solutions

Aplikace
| 2025 | Agilent Technologies
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Farmaceutická analýza

Optimization of Supercritical Fluid Extraction Parameters for Vitamins D2, D3, and K1 from Pharmaceutical Preparations

Technické články
| 2025 | Shimadzu
Instrumentace
SFC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza
 

Podobné články

Co se děje v buňkách, vidíme líp zásluhou objevu z ÚOCHB
Článek | Video

Co se děje v buňkách, vidíme líp zásluhou objevu z ÚOCHB

Vědci z Ústav organické chemie a biochemie AV ČR vyvinuli nové fluorogenní značky, které výrazně zpřesňují fluorescenční mikroskopii a umožňují sledovat buněčné procesy bez rušivého pozadí.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR
tag
share
more
Úvod do validace čištění: principy, rizika a regulační požadavky
Článek | Věda a výzkum

Úvod do validace čištění: principy, rizika a regulační požadavky

Validace čištění je klíčovým prvkem GMP, který chrání pacienty, kvalitu léčiv i výrobce. Článek vysvětluje principy, rizika křížové kontaminace a aktuální regulační požadavky v EU i globálně.
SHIMADZU Handels GmbH - organizační složka
tag
share
more
INOVATIVNÍ ŘEŠENÍ PROBLEMATIKY PESTICIDŮ VE VODNÍCH ZDROJÍCH
Článek | Věda a výzkum

INOVATIVNÍ ŘEŠENÍ PROBLEMATIKY PESTICIDŮ VE VODNÍCH ZDROJÍCH

Rozsáhlý monitoring půd a povrchových vod v ČR odhalil plošnou kontaminaci pesticidy a častá překročení limitů. Článek představuje výsledky studie ALS a ověřené in-situ řešení pomocí štěpkových bioreaktorů.
ALS Czech Republic
tag
share
more
Waters VIZE 2025: Dá se ještě něco nového vymyslet v HPLC, nebo už jen vylepšujeme technologii?
Přednáška | Video

Waters VIZE 2025: Dá se ještě něco nového vymyslet v HPLC, nebo už jen vylepšujeme technologii?

Je kapalinová chromatografie na konci vývoje, nebo teprve na začátku nové éry? Přehled klíčových inovací v LC – od sorbentů a kolon až po bio-inertní systémy a software.
Waters Gesellschaft
tag
share
more
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.