LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.
Autor
DataApex
DataApex
Česká společnost DataApex se od svého založení v roce 1991 věnuje vývoji chromatografického softwaru. DataApex se neustále snaží poskytovat uživatelům efektivní a aktuální nástroje pro zpracování chromatografických dat.
Tagy
Článek
Video
Software
Produkt
LinkedIn Logo

Základy integrace chromatogramu v chromatografickém softwaru Clarity

Út, 6.1.2026
| Originální článek z: DataApex
Strukturovaný přehled integrace chromatogramu v softwaru Clarity. Vysvětlení globálních a lokálních integračních parametrů, detekce píků, práce se základní linií a přenos integrace do metody.
Video placeholder
  • Foto: DataApex: Základy integrace chromatogramu v Clarity
  • Vide: DataApex: Clarity Tutorial - Peak Integration Overview 

 

Úvod

Tento článek přináší strukturované, technicky zaměřené vysvětlení základního pracovního postupu integrace chromatogramu, jak je prezentován v instruktážním videu pro chromatografický software Clarity. Text se zaměřuje na integrační algoritmus Wave, přičemž popsané principy jsou obecně platné i pro algoritmus Legacy, který je v softwaru Clarity rovněž k dispozici.

Přehled integrace v softwaru Clarity

Integrace chromatogramu se v Clarity provádí v okně Chromatogram, na kartě Integration. Integrační parametry jsou definovány pomocí tabulky, kde každý řádek představuje jednu integrační operaci nebo událost.

Clarity nabízí dva integrační algoritmy:

  • Wave algoritmus – moderní, adaptivní metoda detekce píků (použitá v tomto článku)
  • Legacy algoritmus – tradiční algoritmus zachovaný z důvodu kompatibility

Přestože se jednotlivé parametry mohou mírně lišit, základní integrační workflow je u obou algoritmů shodné.

Typický postup integrace

Integrace chromatogramu v Clarity probíhá v několika logických krocích. Ve většině běžných aplikací postačují první tři kroky k dosažení správné a reprodukovatelné integrace.

Krok 1: Nastavení integračního intervalu

Integrační interval definuje časový úsek chromatogramu, který bude zahrnut do vyhodnocení. Veškerý signál mimo tento interval je při detekci píků ignorován.

Hlavní body:

  • Interval se vybírá graficky přímo v chromatogramu
  • Po použití integrační funkce Clarity automaticky vytvoří nový řádek v integrační tabulce
  • Časy začátku a konce jsou převzaty z grafického výběru
  • Všechny hodnoty v integrační tabulce lze ručně upravit

Tento krok zajišťuje, že nedojde k ovlivnění integrace irelevantními oblastmi (např. rozpouštědlo, promývání kolony)

Krok 2: Detekce negativních píků

Pokud chromatogram obsahuje negativní píky (například vlivem chování detektoru, odečtu pozadí nebo specifických analytických postupů), je nutné aktivovat funkci Detect Negative Peaks.

Pokud tato volba není zapnuta, negativní píky nebudou zahrnuty do integrace, což může vést k neúplné nebo chybné kvantifikaci.

Krok 3: Nastavení globálních integračních parametrů

Globální parametry určují způsob detekce píků v rámci celého integračního intervalu. Tyto parametry definují základní citlivost a selektivitu integrace.

Globální šířka píku (Global Peak Width)
  • Reprezentuje nejužší očekávaný pík
  • Slouží k určení shlukování píků (bunching)
  • Klíčová pro rozlišení blízce eluujících píků
Globální práh (Global Threshold)
  • Definuje úroveň šumu
  • Signály pod touto úrovní jsou považovány za šum
  • Správné nastavení zabraňuje falešné detekci píků
Globální sklon základní linie (Global Baseline Slope)
  • Ovlivňuje určení začátků a konců píků
  • Pomáhá přizpůsobit integraci šikmým nebo driftujícím základním liniím

Ve většině rutinních aplikací jsou tyto globální parametry dostačující pro správnou integraci.

Pokročilé úpravy integrace

V případech, kdy globální nastavení nestačí, nabízí Clarity nástroje pro lokální a pík-specifické doladění integrace.

Krok 4: Použití lokálních integračních parametrů

Lokální parametry se vztahují pouze na vybraný časový úsek chromatogramu. Využívají se zejména tehdy, když:

  • se tvary píků v průběhu analýzy výrazně liší
  • určitá oblast vyžaduje odlišnou citlivost
  • dochází k překryvu nebo nedostatečnému rozlišení píků

Clarity uživateli navrhne vhodné hodnoty parametrů, které lze dále upravit.

Krok 5: Operace specifické pro píky a základní linii

Pro finální doladění integrace lze použít:

  • pík-specifické integrační parametry
  • operace se základní linií

Tyto nástroje se obvykle používají k:

  • úpravě začátků a konců konkrétních píků
  • řešení atypických tvarů píků
  • zajištění konzistence u klíčových analytů

Tento krok je typický zejména pro složité chromatogramy nebo validované metody.

Logika integrační tabulky a pořadí operací

Každý řádek integrační tabulky představuje jednu integrační událost. Pořadí řádků je zásadní:

  • Operace se aplikují shora dolů
  • Pozdější řádky mohou upravovat výsledky předchozích kroků
  • Správné uspořádání zajišťuje předvídatelné a reprodukovatelné výsledky

Vícesignálové chromatogramy

U chromatogramů s více signály platí:

  • Každý signál má vlastní integrační tabulku
  • Integraci je nutné nastavit samostatně pro každý signál

Tím je zajištěna správná detekce a kvantifikace všech signálů.

Přenos integrace do metody a dalších chromatogramů

Jakmile integrační nastavení vyhovuje typickému chromatogramu, lze hotovou integrační tabulku:

  • přenést do analytické metody
  • použít pro další chromatogramy měřené za stejných podmínek

Tento postup podporuje konzistentní zpracování dat, validaci metod a dlouhodobou reprodukovatelnost výsledků.

Závěr

Integrace chromatogramu v softwaru Clarity je založena na jasně strukturovaném postupu, který začíná definicí integračního intervalu a globálních parametrů a v případě potřeby pokračuje lokálními a pík-specifickými úpravami.

Ve většině rutinních aplikací postačují:

  1. nastavení integračního intervalu
  2. aktivace detekce negativních píků
  3. úprava globálních parametrů

Porozumění hierarchii a pořadí integračních operací je klíčové pro tvorbu robustních metod a dosažení konzistentních analytických výsledků.

DataApex
LinkedIn Logo
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis of Anti-Degradant Additive (6PPD) and its Transformation Product 6PPD-Quinone in Tire Rubber Using an Integrated HPLC System

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Performance Evaluation of Microbial Identification Using a Benchtop MALDI-TOF MS

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
MALDI, LC/MS, LC/TOF, Software
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza, Potraviny a zemědělství

A Combined Method for Anionic, Cationic, and Zwitterionic PFAS using a Direct Injection UPLC™-MS/MS Method for Environmental Water Samples

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

Beyond the box: A ready-to-run workflow for quantitating 80 drugs of abuse in whole blood with the TSQ Certis Triple Quadrupole MS

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Forenzní analýza a toxikologie

Mastering Single Cell Proteomics: Daily Excellence with μPAC Neo Plus Trap-and-Elute Workflow

Prezentace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
HPLC, LC/Orbitrap, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Proteomika
 

Podobné články

ISC 2026 – Krátký kurz 7: Superkritické kapaliny pro chromatografii a extrakce
Článek | Nejbližší akce

ISC 2026 – Krátký kurz 7: Superkritické kapaliny pro chromatografii a extrakce

ISC 2026 – Krátký kurz 7: Superkritické kapaliny v chromatografii a extrakci. SFE a SFC, CO₂ jako mobilní fáze, vývoj metod i přenos do preparativního měřítka.
International Symposium on Chromatography - (ISC)
tag
share
more
Podcast CHEmic #75 – IT bylo dříve záležitostí nadšenců, dnes jde o klíčovou součást vědy
Video | Popularizace

Podcast CHEmic #75 – IT bylo dříve záležitostí nadšenců, dnes jde o klíčovou součást vědy

Jiří Polách strávil přes 20 let v ÚOCHB. V podcastu CHEMIC popisuje, jak IT proměnilo fungování vědeckého výzkumu a laboratorního prostředí.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR
tag
share
more
Webináře LabRulezLCMS týden 13/2026
Článek | Webináře

Webináře LabRulezLCMS týden 13/2026

14 webinářů: LC-MS, HPLC, proteomika, bioanalýza, nanočástice, GLP-1, titrace, AOC, PFAS, metabolomika, regulace, QA/QC, automatizace, farma
LabRulez
tag
share
more
LabRulez na veletrhu analytica 2026
Článek | Nejbližší akce

LabRulez na veletrhu analytica 2026

Navštivte stánek LabRulez na veletrhu analytica 2026 v Mnichově, který startuje již zítra! Najdete nás v hale A1, stánek A1.506.
LabRulez
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis of Anti-Degradant Additive (6PPD) and its Transformation Product 6PPD-Quinone in Tire Rubber Using an Integrated HPLC System

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Performance Evaluation of Microbial Identification Using a Benchtop MALDI-TOF MS

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
MALDI, LC/MS, LC/TOF, Software
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza, Potraviny a zemědělství

A Combined Method for Anionic, Cationic, and Zwitterionic PFAS using a Direct Injection UPLC™-MS/MS Method for Environmental Water Samples

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

Beyond the box: A ready-to-run workflow for quantitating 80 drugs of abuse in whole blood with the TSQ Certis Triple Quadrupole MS

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Forenzní analýza a toxikologie

Mastering Single Cell Proteomics: Daily Excellence with μPAC Neo Plus Trap-and-Elute Workflow

Prezentace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
HPLC, LC/Orbitrap, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Proteomika
 

Podobné články

ISC 2026 – Krátký kurz 7: Superkritické kapaliny pro chromatografii a extrakce
Článek | Nejbližší akce

ISC 2026 – Krátký kurz 7: Superkritické kapaliny pro chromatografii a extrakce

ISC 2026 – Krátký kurz 7: Superkritické kapaliny v chromatografii a extrakci. SFE a SFC, CO₂ jako mobilní fáze, vývoj metod i přenos do preparativního měřítka.
International Symposium on Chromatography - (ISC)
tag
share
more
Podcast CHEmic #75 – IT bylo dříve záležitostí nadšenců, dnes jde o klíčovou součást vědy
Video | Popularizace

Podcast CHEmic #75 – IT bylo dříve záležitostí nadšenců, dnes jde o klíčovou součást vědy

Jiří Polách strávil přes 20 let v ÚOCHB. V podcastu CHEMIC popisuje, jak IT proměnilo fungování vědeckého výzkumu a laboratorního prostředí.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR
tag
share
more
Webináře LabRulezLCMS týden 13/2026
Článek | Webináře

Webináře LabRulezLCMS týden 13/2026

14 webinářů: LC-MS, HPLC, proteomika, bioanalýza, nanočástice, GLP-1, titrace, AOC, PFAS, metabolomika, regulace, QA/QC, automatizace, farma
LabRulez
tag
share
more
LabRulez na veletrhu analytica 2026
Článek | Nejbližší akce

LabRulez na veletrhu analytica 2026

Navštivte stánek LabRulez na veletrhu analytica 2026 v Mnichově, který startuje již zítra! Najdete nás v hale A1, stánek A1.506.
LabRulez
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis of Anti-Degradant Additive (6PPD) and its Transformation Product 6PPD-Quinone in Tire Rubber Using an Integrated HPLC System

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Performance Evaluation of Microbial Identification Using a Benchtop MALDI-TOF MS

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
MALDI, LC/MS, LC/TOF, Software
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza, Potraviny a zemědělství

A Combined Method for Anionic, Cationic, and Zwitterionic PFAS using a Direct Injection UPLC™-MS/MS Method for Environmental Water Samples

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

Beyond the box: A ready-to-run workflow for quantitating 80 drugs of abuse in whole blood with the TSQ Certis Triple Quadrupole MS

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Forenzní analýza a toxikologie

Mastering Single Cell Proteomics: Daily Excellence with μPAC Neo Plus Trap-and-Elute Workflow

Prezentace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
HPLC, LC/Orbitrap, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Proteomika
 

Podobné články

ISC 2026 – Krátký kurz 7: Superkritické kapaliny pro chromatografii a extrakce
Článek | Nejbližší akce

ISC 2026 – Krátký kurz 7: Superkritické kapaliny pro chromatografii a extrakce

ISC 2026 – Krátký kurz 7: Superkritické kapaliny v chromatografii a extrakci. SFE a SFC, CO₂ jako mobilní fáze, vývoj metod i přenos do preparativního měřítka.
International Symposium on Chromatography - (ISC)
tag
share
more
Podcast CHEmic #75 – IT bylo dříve záležitostí nadšenců, dnes jde o klíčovou součást vědy
Video | Popularizace

Podcast CHEmic #75 – IT bylo dříve záležitostí nadšenců, dnes jde o klíčovou součást vědy

Jiří Polách strávil přes 20 let v ÚOCHB. V podcastu CHEMIC popisuje, jak IT proměnilo fungování vědeckého výzkumu a laboratorního prostředí.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR
tag
share
more
Webináře LabRulezLCMS týden 13/2026
Článek | Webináře

Webináře LabRulezLCMS týden 13/2026

14 webinářů: LC-MS, HPLC, proteomika, bioanalýza, nanočástice, GLP-1, titrace, AOC, PFAS, metabolomika, regulace, QA/QC, automatizace, farma
LabRulez
tag
share
more
LabRulez na veletrhu analytica 2026
Článek | Nejbližší akce

LabRulez na veletrhu analytica 2026

Navštivte stánek LabRulez na veletrhu analytica 2026 v Mnichově, který startuje již zítra! Najdete nás v hale A1, stánek A1.506.
LabRulez
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Analysis of Anti-Degradant Additive (6PPD) and its Transformation Product 6PPD-Quinone in Tire Rubber Using an Integrated HPLC System

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
HPLC
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Průmysl a chemie

Performance Evaluation of Microbial Identification Using a Benchtop MALDI-TOF MS

Aplikace
| 2026 | Shimadzu
Instrumentace
MALDI, LC/MS, LC/TOF, Software
Výrobce
Shimadzu
Zaměření
Farmaceutická analýza, Potraviny a zemědělství

A Combined Method for Anionic, Cationic, and Zwitterionic PFAS using a Direct Injection UPLC™-MS/MS Method for Environmental Water Samples

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

Beyond the box: A ready-to-run workflow for quantitating 80 drugs of abuse in whole blood with the TSQ Certis Triple Quadrupole MS

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Forenzní analýza a toxikologie

Mastering Single Cell Proteomics: Daily Excellence with μPAC Neo Plus Trap-and-Elute Workflow

Prezentace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
HPLC, LC/Orbitrap, LC/MS, LC/MS/MS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Proteomika
 

Podobné články

ISC 2026 – Krátký kurz 7: Superkritické kapaliny pro chromatografii a extrakce
Článek | Nejbližší akce

ISC 2026 – Krátký kurz 7: Superkritické kapaliny pro chromatografii a extrakce

ISC 2026 – Krátký kurz 7: Superkritické kapaliny v chromatografii a extrakci. SFE a SFC, CO₂ jako mobilní fáze, vývoj metod i přenos do preparativního měřítka.
International Symposium on Chromatography - (ISC)
tag
share
more
Podcast CHEmic #75 – IT bylo dříve záležitostí nadšenců, dnes jde o klíčovou součást vědy
Video | Popularizace

Podcast CHEmic #75 – IT bylo dříve záležitostí nadšenců, dnes jde o klíčovou součást vědy

Jiří Polách strávil přes 20 let v ÚOCHB. V podcastu CHEMIC popisuje, jak IT proměnilo fungování vědeckého výzkumu a laboratorního prostředí.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR
tag
share
more
Webináře LabRulezLCMS týden 13/2026
Článek | Webináře

Webináře LabRulezLCMS týden 13/2026

14 webinářů: LC-MS, HPLC, proteomika, bioanalýza, nanočástice, GLP-1, titrace, AOC, PFAS, metabolomika, regulace, QA/QC, automatizace, farma
LabRulez
tag
share
more
LabRulez na veletrhu analytica 2026
Článek | Nejbližší akce

LabRulez na veletrhu analytica 2026

Navštivte stánek LabRulez na veletrhu analytica 2026 v Mnichově, který startuje již zítra! Najdete nás v hale A1, stánek A1.506.
LabRulez
tag
share
more
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
FacebookX (Twitter)LinkedInYouTube
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.