LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.
Autor
DataApex
DataApex
Česká společnost DataApex se od svého založení v roce 1991 věnuje vývoji chromatografického softwaru. DataApex se neustále snaží poskytovat uživatelům efektivní a aktuální nástroje pro zpracování chromatografických dat.
Tagy
Článek
Produkt
Software
Video
LinkedIn Logo

Vytváření vlastních výpočtů v chromatografickém softwaru Clarity

Út, 28.10.2025
| Originální článek z: DataApex
Podrobný návod, jak vytvářet uživatelské sloupce v softwaru Clarity. Naučte se definovat, upravovat a sdílet výrazy pro automatické výpočty analytických výsledků.
Video placeholder
  • Foto: DataApex: Clarity Tutorial - User Columns - Overview
  • Video: DataApex: Clarity Tutorial - User Columns - Overview

Funkce vlastních výpočtů (Custom Calculations) v chromatografickém softwaru Clarity umožňuje uživatelům rozšířit funkcionalitu tabulky výsledků o uživatelsky definované sloupce. Tyto sloupce mohou provádět matematické nebo logické výrazy založené na naměřených datech, uživatelských proměnných či konstantách. Tato možnost je klíčová pro laboratoře, které potřebují automatizované dopočty výsledků – například výpočet výtěžnosti, čistoty, korekčních faktorů nebo jiných odvozených parametrů.

Tento návod poskytuje podrobný a strukturovaný postup, jak vytvářet, upravovat a spravovat vlastní výpočty v prostředí Clarity.

Nástroje a předpoklady

Před vytvořením vlastních výpočtů se ujistěte, že:

  • máte přístup k chromatografickému softwaru Clarity (v libovolné edici, která podporuje úpravy tabulky výsledků),
  • máte k dispozici změřená data nebo tabulku výsledků v aktuálním pracovním prostředí,
  • uživatelský účet má oprávnění k úpravě desktopu (nastavení uživatelského rozhraní),
  • jsou případně již definovány uživatelské proměnné v metodě nebo analýze (např. známé přídavky, standardy apod.).

Postup krok za krokem

1. Otevření tabulky výsledků

  1. Otevřete chromatogram nebo výsledky sekvence v Clarity.
  2. Přejděte do sekce Results Table (tabulka výsledků) v dolní části okna.
  3. Klikněte pravým tlačítkem myši kdekoliv v tabulce pro zobrazení kontextového menu.

2. Přidání uživatelského sloupce

  1. V kontextovém menu zvolte User Columns → Add.
  2. Otevře se dialogové okno Add User Column.
  3. V tomto okně:
    • zadejte název nového sloupce (např. Recovery [%]),
    • podle potřeby určete jednotky (např. %, mg/L, ng),
    • rozhodněte, zda se má pro tento sloupec počítat celková hodnota (Total) – vhodné například pro součty ploch píků nebo koncentrací.

3. Definování výrazu pro výpočet

Hlavním krokem je zadání matematického výrazu, který bude Clarity vyhodnocovat.

Výraz může obsahovat:

  • proměnné – např. Amount, Area, Retention Time,
  • uživatelské proměnné – vytvořené dříve prostřednictvím funkce User Variables,
  • funkce – např. AVG(), SUM(), ABS(),
  • operátory – jako +, -, *, /, ^,
  • číselné konstanty.
Příklad: Výpočet výtěžnosti (Recovery)

Pro výpočet výtěžnosti, kdy byla před analýzou přidána stejná známá koncentrace každé látky, zadejte výraz:

Amount / RealAmountAdded * 100

Kde:

  • Amount představuje naměřenou koncentraci,
  • RealAmountAdded je uživatelská proměnná definovaná v metodě jako přidané množství,
  • výsledek se násobí 100, aby byl vyjádřen v procentech.

Po zadání klikněte na OK nebo Save pro uložení výpočtu.

4. Zobrazení a správa uživatelských sloupců

Po uložení se nový sloupec okamžitě zobrazí v tabulce výsledků a Clarity automaticky vypočítá odpovídající hodnoty pro každý řádek (pík nebo komponentu).

Chcete-li upravit nebo odstranit existující uživatelský sloupec:

  1. Klikněte pravým tlačítkem na záhlaví sloupce.
  2. Zvolte User Column → Edit, pokud chcete upravit vzorec nebo nastavení.
  3. Zvolte User Column → Delete, pokud jej chcete odstranit.

Uložení dat a uživatelská nastavení

Informace o uživatelských sloupcích se ukládají do desktop souboru, který je propojen s konkrétním uživatelským účtem.

Základní principy:

  • Každý uživatel má ve výchozím nastavení vlastní desktop.
  • Desktop obsahuje konfiguraci rozložení oken, uživatelské sloupce, šablony reportů a další nastavení.
  • Více uživatelů může sdílet jeden desktop soubor, čímž lze zajistit jednotné zpracování a zobrazení dat v rámci týmu.
  • Sdílení desktopu se nastavuje v User Account Settings.

Tento princip zajišťuje reprodukovatelnost výpočtů a jednotný vzhled výsledků ve víceuživatelském prostředí.

Diskuse a doporučení

Zavedení vlastních výpočtů zefektivňuje zpracování dat a eliminuje nutnost exportu výsledků do externích programů (např. Excel). Clarity tak dokáže provádět všechny dopočty automaticky, přímo při zobrazení výsledků.

Doporučení:

  • Používejte srozumitelné názvy sloupců, např. „Relativní plocha [%]“, „Normalizovaná koncentrace [mg/L]“.
  • Před rutinním použitím ověřte správnost vzorců na testovacích datech.
  • Všechny uživatelské výpočty dokumentujte v metodě nebo SOP pro zajištění dohledatelnosti.
  • Při sdílení desktopu mezi uživateli nastavte jednotnou verzi konfigurace, aby nedocházelo k rozdílům ve výpočtech.

Závěr

Funkce vlastních výpočtů v Clarity přináší vysokou flexibilitu a přizpůsobitelnost při vyhodnocování chromatografických dat. Pomocí uživatelských sloupců lze snadno doplnit tabulku výsledků o výpočty, které odpovídají konkrétním analytickým potřebám – od výtěžnosti přes korekce až po odvozené koncentrace.

Tímto způsobem lze zjednodušit reporting, zvýšit přesnost a zajistit konzistentní zpracování dat napříč laboratořemi a uživateli.

DataApex
LinkedIn Logo
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Quantitation and Discovery analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap mass spectrometers

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Metabolomika

Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Wastewater

Aplikace
| 2026 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Non-Targeted Screening of Biosolids with the Xevo™ MRT Mass Spectrometer Reveals New Isoforms of PFAS

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

High Resolution Characterization of Lipid Nanoparticles Using the Xevo™ Charge Detection Mass Spectrometry (CDMS) Instrument - Single Particle Mass Analysis of Intact LNP-mRNA Formulations

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/HRMS, Charakterizace částic, LC/IT
Výrobce
Waters
Zaměření
Lipidomika

Out-of-the-box workflow for PFAS quantitation using a fullscan high-resolution approach with the Orbitrap Exploris EFOX Mass Detector

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Jak vypočítat poměr signálu k šumu v chromatografickém softwaru Clarity
Článek | Produkt

Jak vypočítat poměr signálu k šumu v chromatografickém softwaru Clarity

Podrobný návod, jak v Clarity CDS vypočítat poměr signálu k šumu (S/N). Krok za krokem: určení šumu, konfigurace tabulky výsledků a vyhodnocení píků.
DataApex
tag
share
more
Práce s uživatelskými proměnnými v chromatografickém softwaru Clarity
Článek | Produkt

Práce s uživatelskými proměnnými v chromatografickém softwaru Clarity

Podrobný návod k práci s uživatelskými proměnnými v softwaru Clarity. Naučte se je nastavovat v metodách, analýzách i sekvencích a využívat pro vlastní výpočty a reporty.
DataApex
tag
share
more
Správa uživatelských nastavení a přizpůsobení v softwaru Clarity
Článek | Produkt

Správa uživatelských nastavení a přizpůsobení v softwaru Clarity

Zjistěte, kde Clarity CDS ukládá uživatelská nastavení do souborů desktop (.dsk), a naučte se spravovat individuální i sdílené konfigurace efektivně.
DataApex
tag
share
more
Jak používat speciální hodnoty ve vlastních výpočtech v Clarity
Článek | Produkt

Jak používat speciální hodnoty ve vlastních výpočtech v Clarity

Zjistěte, jak využívat speciální hodnoty v Clarity CDS pro tvorbu vlastních výpočtů, automatizaci dat a zvýšení efektivity při chromatografické analýze.
DataApex
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Quantitation and Discovery analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap mass spectrometers

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Metabolomika

Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Wastewater

Aplikace
| 2026 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Non-Targeted Screening of Biosolids with the Xevo™ MRT Mass Spectrometer Reveals New Isoforms of PFAS

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

High Resolution Characterization of Lipid Nanoparticles Using the Xevo™ Charge Detection Mass Spectrometry (CDMS) Instrument - Single Particle Mass Analysis of Intact LNP-mRNA Formulations

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/HRMS, Charakterizace částic, LC/IT
Výrobce
Waters
Zaměření
Lipidomika

Out-of-the-box workflow for PFAS quantitation using a fullscan high-resolution approach with the Orbitrap Exploris EFOX Mass Detector

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Jak vypočítat poměr signálu k šumu v chromatografickém softwaru Clarity
Článek | Produkt

Jak vypočítat poměr signálu k šumu v chromatografickém softwaru Clarity

Podrobný návod, jak v Clarity CDS vypočítat poměr signálu k šumu (S/N). Krok za krokem: určení šumu, konfigurace tabulky výsledků a vyhodnocení píků.
DataApex
tag
share
more
Práce s uživatelskými proměnnými v chromatografickém softwaru Clarity
Článek | Produkt

Práce s uživatelskými proměnnými v chromatografickém softwaru Clarity

Podrobný návod k práci s uživatelskými proměnnými v softwaru Clarity. Naučte se je nastavovat v metodách, analýzách i sekvencích a využívat pro vlastní výpočty a reporty.
DataApex
tag
share
more
Správa uživatelských nastavení a přizpůsobení v softwaru Clarity
Článek | Produkt

Správa uživatelských nastavení a přizpůsobení v softwaru Clarity

Zjistěte, kde Clarity CDS ukládá uživatelská nastavení do souborů desktop (.dsk), a naučte se spravovat individuální i sdílené konfigurace efektivně.
DataApex
tag
share
more
Jak používat speciální hodnoty ve vlastních výpočtech v Clarity
Článek | Produkt

Jak používat speciální hodnoty ve vlastních výpočtech v Clarity

Zjistěte, jak využívat speciální hodnoty v Clarity CDS pro tvorbu vlastních výpočtů, automatizaci dat a zvýšení efektivity při chromatografické analýze.
DataApex
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Quantitation and Discovery analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap mass spectrometers

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Metabolomika

Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Wastewater

Aplikace
| 2026 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Non-Targeted Screening of Biosolids with the Xevo™ MRT Mass Spectrometer Reveals New Isoforms of PFAS

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

High Resolution Characterization of Lipid Nanoparticles Using the Xevo™ Charge Detection Mass Spectrometry (CDMS) Instrument - Single Particle Mass Analysis of Intact LNP-mRNA Formulations

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/HRMS, Charakterizace částic, LC/IT
Výrobce
Waters
Zaměření
Lipidomika

Out-of-the-box workflow for PFAS quantitation using a fullscan high-resolution approach with the Orbitrap Exploris EFOX Mass Detector

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Jak vypočítat poměr signálu k šumu v chromatografickém softwaru Clarity
Článek | Produkt

Jak vypočítat poměr signálu k šumu v chromatografickém softwaru Clarity

Podrobný návod, jak v Clarity CDS vypočítat poměr signálu k šumu (S/N). Krok za krokem: určení šumu, konfigurace tabulky výsledků a vyhodnocení píků.
DataApex
tag
share
more
Práce s uživatelskými proměnnými v chromatografickém softwaru Clarity
Článek | Produkt

Práce s uživatelskými proměnnými v chromatografickém softwaru Clarity

Podrobný návod k práci s uživatelskými proměnnými v softwaru Clarity. Naučte se je nastavovat v metodách, analýzách i sekvencích a využívat pro vlastní výpočty a reporty.
DataApex
tag
share
more
Správa uživatelských nastavení a přizpůsobení v softwaru Clarity
Článek | Produkt

Správa uživatelských nastavení a přizpůsobení v softwaru Clarity

Zjistěte, kde Clarity CDS ukládá uživatelská nastavení do souborů desktop (.dsk), a naučte se spravovat individuální i sdílené konfigurace efektivně.
DataApex
tag
share
more
Jak používat speciální hodnoty ve vlastních výpočtech v Clarity
Článek | Produkt

Jak používat speciální hodnoty ve vlastních výpočtech v Clarity

Zjistěte, jak využívat speciální hodnoty v Clarity CDS pro tvorbu vlastních výpočtů, automatizaci dat a zvýšení efektivity při chromatografické analýze.
DataApex
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Quantitation and Discovery analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap mass spectrometers

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Metabolomika

Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Wastewater

Aplikace
| 2026 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Non-Targeted Screening of Biosolids with the Xevo™ MRT Mass Spectrometer Reveals New Isoforms of PFAS

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

High Resolution Characterization of Lipid Nanoparticles Using the Xevo™ Charge Detection Mass Spectrometry (CDMS) Instrument - Single Particle Mass Analysis of Intact LNP-mRNA Formulations

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/HRMS, Charakterizace částic, LC/IT
Výrobce
Waters
Zaměření
Lipidomika

Out-of-the-box workflow for PFAS quantitation using a fullscan high-resolution approach with the Orbitrap Exploris EFOX Mass Detector

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Jak vypočítat poměr signálu k šumu v chromatografickém softwaru Clarity
Článek | Produkt

Jak vypočítat poměr signálu k šumu v chromatografickém softwaru Clarity

Podrobný návod, jak v Clarity CDS vypočítat poměr signálu k šumu (S/N). Krok za krokem: určení šumu, konfigurace tabulky výsledků a vyhodnocení píků.
DataApex
tag
share
more
Práce s uživatelskými proměnnými v chromatografickém softwaru Clarity
Článek | Produkt

Práce s uživatelskými proměnnými v chromatografickém softwaru Clarity

Podrobný návod k práci s uživatelskými proměnnými v softwaru Clarity. Naučte se je nastavovat v metodách, analýzách i sekvencích a využívat pro vlastní výpočty a reporty.
DataApex
tag
share
more
Správa uživatelských nastavení a přizpůsobení v softwaru Clarity
Článek | Produkt

Správa uživatelských nastavení a přizpůsobení v softwaru Clarity

Zjistěte, kde Clarity CDS ukládá uživatelská nastavení do souborů desktop (.dsk), a naučte se spravovat individuální i sdílené konfigurace efektivně.
DataApex
tag
share
more
Jak používat speciální hodnoty ve vlastních výpočtech v Clarity
Článek | Produkt

Jak používat speciální hodnoty ve vlastních výpočtech v Clarity

Zjistěte, jak využívat speciální hodnoty v Clarity CDS pro tvorbu vlastních výpočtů, automatizaci dat a zvýšení efektivity při chromatografické analýze.
DataApex
tag
share
more
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
FacebookX (Twitter)LinkedInYouTube
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.