LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.
Autor
DataApex
DataApex
Česká společnost DataApex se od svého založení v roce 1991 věnuje vývoji chromatografického softwaru. DataApex se neustále snaží poskytovat uživatelům efektivní a aktuální nástroje pro zpracování chromatografických dat.
Tagy
Článek
Produkt
Software
Video
LinkedIn Logo

Jak nastavit možnosti sekvence v Clarity SW

Út, 19.8.2025
| Originální článek z: DataApex
Praktický průvodce nastavením možností sekvence v Clarity Chromatography. Naučte se správně konfigurovat režimy, dobu nečinnosti, pojmenování souborů, kalibraci i vypínání zařízení.
Video placeholder
  • Foto: DataApex: Jak nastavit možnosti sekvence
  • Video: DataApex: Jak nastavit možnosti sekvence

Úvod

Software Clarity Chromatography poskytuje pokročilé nástroje pro správu chromatografických sekvencí. Správné nastavení možností sekvence je klíčové, protože určuje, jak funguje tabulka sekvencí, jak se provádějí jednotlivé běhy a jak se ukládají výsledky. Tento článek přináší podrobný návod k nastavení možností sekvence na základě instruktážního videa.

Otevření dialogového okna Možnosti sekvence

  1. Otevřete okno Sekvence.
  2. Vyberte ikonu Možnosti (Options) na panelu nástrojů nebo položku Možnosti (Options) v nabídce Sekvence (Sequence).
  3. Zobrazí se dialogové okno Možnosti sekvence (Sequence Options) obsahující několik konfigurovatelných sekcí.

Popis sekvence (Sequence Description)

V horní části dialogového okna najdete pole Popis (Description). Jedná se o volné textové pole, do kterého můžete zadat poznámky nebo identifikátory sekvence. Přestože je toto pole volitelné, je užitečné pro dokumentaci konkrétních detailů experimentu.

Režim sekvence (Sequence Mode)

Tato část určuje, jak Clarity zpracovává spuštění sekvence:

  • Pasivní režim (Passive Mode)
    • Clarity čeká na externí startovací signál (např. z připojeného zařízení).
    • Obvykle se používá při ručním dávkování nebo s externím autosamplerem, který není řízen softwarem.
    • Měření se spustí po vyvolání externí události, například otočením ručního injekčního ventilu.
  • Aktivní režim (Active Mode, výchozí)
    • Clarity řídí celý proces.
    • Nejprve vyčká, až budou všechna zařízení připravena, a poté vyšle autosampleru signál k provedení nástřiku.
    • Po provedení nástřiku se měření spustí automaticky.
    • Tento režim je vhodný pro většinu automatizovaných pracovních postupů.

Podrobnější nastavení specifická pro jednotlivé přístroje najdete v kapitole 6 Příručky pro začátečníky (Getting Started Manual).

Doba nečinnosti v aktivním režimu (Idle Time in Active Mode)

Můžete nastavit zpoždění (dobu nečinnosti) mezi koncem jednoho běhu a začátkem následujícího nástřiku.
Tato funkce je užitečná v případech, kdy:

  • připojená zařízení potřebují dodatečný čas na stabilizaci,
  • příliš mnoho příkazů odeslaných najednou může způsobit problémy s komunikací.

Výběr řádků sekvence (Sequence Row Selection)

V tomto poli určíte, které řádky v tabulce sekvencí se mají provést.

  • Software automaticky zaškrtne příslušná políčka ve sloupci Spustit (Run).
  • Tyto volby můžete následně ručně upravit.

Nastavení proměnné čítače (Counter Variable Settings)

V této části lze nastavit proměnnou čítače tak, aby se během sekvence automaticky zvyšovala.

  • Čítač lze využít pro označování běhů nebo souborů.
  • Zvyšuje se při každém novém běhu v sekvenci.
  • odle konfigurace se čítač buď resetuje, nebo nikoli.

Řešení konfliktů názvů souborů (File Name Conflict Resolution)

Pokud je z jednoho řádku spuštěno více analýz, může dojít ke konfliktům v názvech souborů. Nabízejí se dvě možnosti:

  • Automatické (výchozí) – Clarity k názvu souboru automaticky připojí proměnnou vialky nebo nástřiku, čímž se zabrání duplicitám.
  • Ruční – uživatel řeší konflikty sám, před uložením.

Kalibrace a použití sekvence 

V této části můžete definovat typ klonování kalibrace, který bude v sekvenci použit.

Po dokončení sekvence 

Na konci sekvence můžete nastavit způsob vypnutí připojených zařízení.

Uložení a použití nastavení (Saving and Applying Settings)

Po dokončení konfigurace:

  • Klikněte na OK pro uložení možností sekvence.
  • Parametry se okamžitě použijí na aktuálně otevřený soubor sekvence.

Příklad konfigurace (z videoukázky) 

  • Režim: Aktivní
  • Doba nečinnosti: 5 minut
  • Provedené řádky: Pouze řádky 2 a 4
  • Řádek 4: Upravená koncová vialka pro více měření
  • Konflikty názvů souborů: Automaticky vyřešeny připojením proměnné vialky
  • Proměnná čítače: Začíná na hodnotě 5, zvyšuje se při každém spuštění, nikdy se neresetuje

Závěr

Nastavení možností sekvence v softwaru Clarity Chromatography zajišťuje plynulý provoz, konzistentní zpracování dat a efektivní automatizaci. Ovládnutím nastavení režimu sekvence, doby nečinnosti, pojmenování souborů, kalibrace a způsobů vypínání mohou analytici přizpůsobit pracovní postupy specifickým požadavkům laboratoře.

Pro další informace doporučujeme podívat se na tyto návody:

DataApex
LinkedIn Logo
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Quantitation and Discovery analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap mass spectrometers

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Metabolomika

Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Wastewater

Aplikace
| 2026 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Non-Targeted Screening of Biosolids with the Xevo™ MRT Mass Spectrometer Reveals New Isoforms of PFAS

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

High Resolution Characterization of Lipid Nanoparticles Using the Xevo™ Charge Detection Mass Spectrometry (CDMS) Instrument - Single Particle Mass Analysis of Intact LNP-mRNA Formulations

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/HRMS, Charakterizace částic, LC/IT
Výrobce
Waters
Zaměření
Lipidomika

Out-of-the-box workflow for PFAS quantitation using a fullscan high-resolution approach with the Orbitrap Exploris EFOX Mass Detector

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Jak otevřít chromatogramy ze sekvence
Článek | Produkt

Jak otevřít chromatogramy ze sekvence

Podrobný návod, jak v softwaru Clarity pohodlně otevřít chromatogramy ze sekvence – buď selektivně s překrytím, nebo hromadně v okně chromatogramu.
DataApex
tag
share
more
Jak fungují post-run akce v Clarity software
Článek | Produkt

Jak fungují post-run akce v Clarity software

Post-run akce v Clarity umožňují automatizovat export dat, otevírání chromatogramů, práci s kalibrací a SST i integraci s externími programy.
DataApex
tag
share
more
Jak vytisknout report ze sekvence v software Clarity
Článek | Produkt

Jak vytisknout report ze sekvence v software Clarity

Naučte se, jak nakonfigurovat software Clarity tak, aby po měřeních automaticky generoval a tiskl reporty ve formátu PDF pomocí nastavení po spuštění.
DataApex
tag
share
more
Clarity chromatografický software – Návod: Okno sekvence – Přehled
Článek | Produkt

Clarity chromatografický software – Návod: Okno sekvence – Přehled

Podrobný průvodce oknem Sekvence v Clarity CDS. Naučte se plánovat měření, spravovat vzorky, nastavovat kalibrace a efektivně řídit analytické procesy.
DataApex
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Quantitation and Discovery analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap mass spectrometers

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Metabolomika

Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Wastewater

Aplikace
| 2026 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Non-Targeted Screening of Biosolids with the Xevo™ MRT Mass Spectrometer Reveals New Isoforms of PFAS

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

High Resolution Characterization of Lipid Nanoparticles Using the Xevo™ Charge Detection Mass Spectrometry (CDMS) Instrument - Single Particle Mass Analysis of Intact LNP-mRNA Formulations

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/HRMS, Charakterizace částic, LC/IT
Výrobce
Waters
Zaměření
Lipidomika

Out-of-the-box workflow for PFAS quantitation using a fullscan high-resolution approach with the Orbitrap Exploris EFOX Mass Detector

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Jak otevřít chromatogramy ze sekvence
Článek | Produkt

Jak otevřít chromatogramy ze sekvence

Podrobný návod, jak v softwaru Clarity pohodlně otevřít chromatogramy ze sekvence – buď selektivně s překrytím, nebo hromadně v okně chromatogramu.
DataApex
tag
share
more
Jak fungují post-run akce v Clarity software
Článek | Produkt

Jak fungují post-run akce v Clarity software

Post-run akce v Clarity umožňují automatizovat export dat, otevírání chromatogramů, práci s kalibrací a SST i integraci s externími programy.
DataApex
tag
share
more
Jak vytisknout report ze sekvence v software Clarity
Článek | Produkt

Jak vytisknout report ze sekvence v software Clarity

Naučte se, jak nakonfigurovat software Clarity tak, aby po měřeních automaticky generoval a tiskl reporty ve formátu PDF pomocí nastavení po spuštění.
DataApex
tag
share
more
Clarity chromatografický software – Návod: Okno sekvence – Přehled
Článek | Produkt

Clarity chromatografický software – Návod: Okno sekvence – Přehled

Podrobný průvodce oknem Sekvence v Clarity CDS. Naučte se plánovat měření, spravovat vzorky, nastavovat kalibrace a efektivně řídit analytické procesy.
DataApex
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Quantitation and Discovery analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap mass spectrometers

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Metabolomika

Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Wastewater

Aplikace
| 2026 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Non-Targeted Screening of Biosolids with the Xevo™ MRT Mass Spectrometer Reveals New Isoforms of PFAS

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

High Resolution Characterization of Lipid Nanoparticles Using the Xevo™ Charge Detection Mass Spectrometry (CDMS) Instrument - Single Particle Mass Analysis of Intact LNP-mRNA Formulations

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/HRMS, Charakterizace částic, LC/IT
Výrobce
Waters
Zaměření
Lipidomika

Out-of-the-box workflow for PFAS quantitation using a fullscan high-resolution approach with the Orbitrap Exploris EFOX Mass Detector

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Jak otevřít chromatogramy ze sekvence
Článek | Produkt

Jak otevřít chromatogramy ze sekvence

Podrobný návod, jak v softwaru Clarity pohodlně otevřít chromatogramy ze sekvence – buď selektivně s překrytím, nebo hromadně v okně chromatogramu.
DataApex
tag
share
more
Jak fungují post-run akce v Clarity software
Článek | Produkt

Jak fungují post-run akce v Clarity software

Post-run akce v Clarity umožňují automatizovat export dat, otevírání chromatogramů, práci s kalibrací a SST i integraci s externími programy.
DataApex
tag
share
more
Jak vytisknout report ze sekvence v software Clarity
Článek | Produkt

Jak vytisknout report ze sekvence v software Clarity

Naučte se, jak nakonfigurovat software Clarity tak, aby po měřeních automaticky generoval a tiskl reporty ve formátu PDF pomocí nastavení po spuštění.
DataApex
tag
share
more
Clarity chromatografický software – Návod: Okno sekvence – Přehled
Článek | Produkt

Clarity chromatografický software – Návod: Okno sekvence – Přehled

Podrobný průvodce oknem Sekvence v Clarity CDS. Naučte se plánovat měření, spravovat vzorky, nastavovat kalibrace a efektivně řídit analytické procesy.
DataApex
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Quantitation and Discovery analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap mass spectrometers

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Metabolomika

Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Wastewater

Aplikace
| 2026 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Non-Targeted Screening of Biosolids with the Xevo™ MRT Mass Spectrometer Reveals New Isoforms of PFAS

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

High Resolution Characterization of Lipid Nanoparticles Using the Xevo™ Charge Detection Mass Spectrometry (CDMS) Instrument - Single Particle Mass Analysis of Intact LNP-mRNA Formulations

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/HRMS, Charakterizace částic, LC/IT
Výrobce
Waters
Zaměření
Lipidomika

Out-of-the-box workflow for PFAS quantitation using a fullscan high-resolution approach with the Orbitrap Exploris EFOX Mass Detector

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Jak otevřít chromatogramy ze sekvence
Článek | Produkt

Jak otevřít chromatogramy ze sekvence

Podrobný návod, jak v softwaru Clarity pohodlně otevřít chromatogramy ze sekvence – buď selektivně s překrytím, nebo hromadně v okně chromatogramu.
DataApex
tag
share
more
Jak fungují post-run akce v Clarity software
Článek | Produkt

Jak fungují post-run akce v Clarity software

Post-run akce v Clarity umožňují automatizovat export dat, otevírání chromatogramů, práci s kalibrací a SST i integraci s externími programy.
DataApex
tag
share
more
Jak vytisknout report ze sekvence v software Clarity
Článek | Produkt

Jak vytisknout report ze sekvence v software Clarity

Naučte se, jak nakonfigurovat software Clarity tak, aby po měřeních automaticky generoval a tiskl reporty ve formátu PDF pomocí nastavení po spuštění.
DataApex
tag
share
more
Clarity chromatografický software – Návod: Okno sekvence – Přehled
Článek | Produkt

Clarity chromatografický software – Návod: Okno sekvence – Přehled

Podrobný průvodce oknem Sekvence v Clarity CDS. Naučte se plánovat měření, spravovat vzorky, nastavovat kalibrace a efektivně řídit analytické procesy.
DataApex
tag
share
more
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
FacebookX (Twitter)LinkedInYouTube
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.