LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.
Autor
Akademie věd České republiky
Akademie věd České republiky
Akademie věd České republiky (AV ČR) vznikla v roce 1992 jako nástupce někdejší Československé akademie věd. V současnosti ji tvoří komplex 54 veřejných výzkumných institucí.
Tagy
Článek
Věda a výzkum
LinkedIn Logo

Patrik Španěl: Jak otevřeně publikuje Akademie věd ČR

Út, 30.1.2024
| Originální článek z: AV ČR/Patrik Španěl
O hodnocení vědy na základě publikací a pozitivech i problémech, které režim Open Access přináší, referuje Patrik Španěl z Ústavu fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR.
<ul>
<li><strong>Foto:</strong> AV ČR/Jana Plavec: Patrik Španěl: Jak otevřeně publikuje Akademie věd ČR</li>
</ul>
  • Foto: AV ČR/Jana Plavec: Patrik Španěl: Jak otevřeně publikuje Akademie věd ČR

Zveřejňování výsledků je už samozřejmým prvkem vědecké práce. Badatelky a badatelé navíc stále častěji publikují v režimu Open Access, kdy si jejich výsledky může prostudovat kdokoli s přístupem k internetu. O hodnocení vědy na základě publikací a pozitivech i problémech, které režim Open Access přináší, referuje Patrik Španěl z Ústavu fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR.

Publikace výsledků je důležitou součástí vědecké metody, která se praktikuje v posledních několika stoletích. Základem je pozorování jevů, ať už v přírodě, ve společnosti nebo v cíleně připraveném experimentu, následované vyvozováním závěrů. Tento proces často zahrnuje formulaci hypotéz a jejich více či méně formalizované empirické ověřování. Výsledkem jsou určité závěry: objevy, pochopení a vysvětlení, proč se něco děje, jak to funguje anebo nalezení nečekaných souvislostí.

Naprosto zásadní ale je, že výsledky musejí být opakovatelné, reprodukovatelné za stejných podmínek jinde a jinými lidmi. Historicky se toho dosáhlo zveřejňováním vědeckých výsledků formou psaného textu, často doplněného obrázky a tabulkami, který mohli jiní badatelé kriticky zhodnocovat a jenž především umožnil nezávislé ověření.

V současnosti, jak víme asi všichni, kdo pracujeme ve vědě, existuje obrovský průmysl, který zajišťuje publikace oponovaných (peer-review) článků v časopisech a monografiích. V posledních letech vychází podle indexu OpenAlex.org ročně více než šest milionů článků a více než milion kapitol v monografiích. Pro srovnání, v roce 1990 to bylo pouze více než milion článků a 80 tisíc kapitol. Teoreticky má systém peer-review, jenž využívá odpovědné editory a anonymní recenzenty, zajistit věrohodnost a vědecký přínos publikovaných poznatků.

AV ČR/Jana Plavec: Patrik Španěl Jak otevřeně publikuje Akademie věd ČRAV ČR/Jana Plavec: Patrik Španěl Jak otevřeně publikuje Akademie věd ČR

Je produkce článků účelem vědy?

Stále věřím, že takto uveřejněné výsledky mají význam pro vzdělávání a další rozvoj poznání. Tyto články se nicméně staly základem, případně alespoň významnou součástí hodnocení práce vědců či celých institucí, čímž vznikla motivace publikovat samoúčelně. Z důvodů, které měly smysl koncem dvacátého století, se začala hodnota výzkumu posuzovat nejdříve na základě počtu takzvaně impaktovaných článků (v žargonu českých státních institucí spojených s financováním vědy známá kategorie výstupů Jimp), později podle oborového pořadí impaktního faktoru časopisu, kde článek vyšel, a nakonec podle podobně konstruovaných kvartilů a decilů.

Systém se zjevnými nedostatky, jež tkvějí předpokladu, že význam každého článku odpovídá skóre celého časopisu, vedl také ke schematické představě, že „výstupem“, a tedy účelem základního výzkumu je produkce vědeckých článků. Umožňuje to různé demagogické interpretace významu vědy pro společnost a národ. Od vrcholných politiků jsme třeba slyšeli názor: proč bychom měli investovat do vědy, když si výsledky může každý zdarma přečíst a zkopírovat v knihovně? To vede také ke zjednodušenému a formalistickému dělení vědeckého bádání na takzvaný základní a aplikovaný výzkum.

Naděje v reformě

Těžko odhadovat, co nás čeká v budoucnosti. Velice slibně ale vypadá iniciativa mezinárodní koalice za reformu hodnocení výzkumu CoARA. Reforma opouští princip hodnocení podle časopisů a zdůrazňuje odborné posuzování konkrétních výsledků výzkumu a jejich otevřenost. S tím souvisí filozofie publikování vědeckých výsledků v článcích s otevřeným přístupem (OA z anglického Open Access). Často se cituje princip, že pokud veřejnost, občané a daňoví poplatníci přispívají na vědu, mají právo bezplatně číst a prohlížet její výsledky.

Tento argument není sám o sobě tak závažný. Už dlouho totiž existuje možnost, aby autor článku poskytl bezplatně jednu kopii článku komukoli, kdo o ni slušně požádá. Vzpomínám na předtištěné korespondenční lístky s prosbou o zaslání separátu a na předtištěné kartičky „with compliments“, kterými autoři mohli vyjádřit poděkování příjemcům za jejich zájem. S rozvojem e-mailu se to ještě zjednodušilo. Vždy mě potěšilo, že jsem mohl poslat text v PDF konkrétnímu zájemci.

Mnoho let podobně fungovala síť ResearchGate, která umožňovala osobní odeslání jedné kopie. Tato možnost ale také ustupuje, možná kvůli snadné dostupnosti pirátských systémů. Skutečnou výhodou OA je podle zkušeností z Ústavu fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, že licence Creative Commons nejen umožňuje další snadné použití zveřejněného materiálu za jasně daných podmínek (příkladem je využití obrázku do tiskové zprávy), ale také výrazně zjednodušuje evidenci duševního vlastnictví – copyright zůstává autorům a nepřevádí se na vydavatele. Takový převod práv k duševnímu vlastnictví je mimo jiné v rozporu s českým autorským zákonem a licenční smlouvy ústavy Akademie věd ČR musejí evidovat, což znamená dost práce navíc. Současně všechny Creative Commons licence výslovně stanovují povinnost citovat zdroj při dalším použití textu nebo obrázků.

Jak jsme na tom v Akademii?

Je dobré vidět, že podíl OA článků s afilací k pracovištím Akademie věd ČR setrvale roste, jak ukazuje graf.

AV ČR: Podíl publikací AV ČR s otevřeným přístupemAV ČR: Podíl publikací AV ČR s otevřeným přístupem

Oranžové sloupce ukazují celkový počet publikací podle údajů z indexu OpenAlex.org, modré sloupce počet publikací s otevřeným přístupem. Černá čára představuje jejich procentuální podíl. Posledních pět let je již většina článků z Akademie věd ČR dostupná v režimu OA. Z grafu je také patrné, že počet článků vydaných v uzavřeném režimu je zhruba konstantní a nárůst jde hlavně na vrub OA.

Zamyšlení nad financováním OA by vydalo na samostatný článek. Mohu ale určitě napsat, že vítáme možnost publikování v některých vydavatelstvích na základě smluv v konsorciu CzechElib, které zajišťují pro členy slevu nebo úplné odpuštění poplatků za zveřejnění v otevřeném režimu (vydavatelství Wiley, Springer Nature, ACS, RSC, Taylor and Francis, OUP, CUP, IOP, AIP, ACM, Sage…).

Stinné stránky

Stinnou stránkou je ovšem rozmach placených platforem, například často zmiňované MDPI a mnohých dalších. Účtují poměrně velké částky za publikace a používají propracované taktiky multi-level-marketingu, které zneužívají určité naivity vědců ochotných ujmout se role hostujících editorů zvláštních vydání s povinností prodat možnost publikování třeba deseti zájemcům. S tím může být spojená i motivace pro snížení nároků na peer-review.

Doufáme, že se bude v nadcházejícím hodnocení týmů a ústavů Akademie věd pozitivně oceňovat publikování v režimu OA a s důrazem na peer-review hodnocení jednotlivých článků, aniž by se mechanicky přejímaly kvartily a decily.

O otevřeném publikování jsme psali i v loňském čísle AB / Akademického bulletinu.

Akademie věd České republiky
LinkedIn Logo
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Quantitation and Discovery analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap mass spectrometers

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Metabolomika

Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Wastewater

Aplikace
| 2026 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Non-Targeted Screening of Biosolids with the Xevo™ MRT Mass Spectrometer Reveals New Isoforms of PFAS

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

High Resolution Characterization of Lipid Nanoparticles Using the Xevo™ Charge Detection Mass Spectrometry (CDMS) Instrument - Single Particle Mass Analysis of Intact LNP-mRNA Formulations

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/HRMS, Charakterizace částic, LC/IT
Výrobce
Waters
Zaměření
Lipidomika

Out-of-the-box workflow for PFAS quantitation using a fullscan high-resolution approach with the Orbitrap Exploris EFOX Mass Detector

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Otevřený přístup k výsledkům výzkumu z pohledu managementu výzkumné organizace
Článek | Věda a výzkum

Otevřený přístup k výsledkům výzkumu z pohledu managementu výzkumné organizace

Otevřený přístup k výsledkům výzkumu představuje příležitost k další akceleraci výzkumných aktivit a šíření výsledků výzkumu mezi odbornou a nakonec i laickou veřejnost.
Vodohospodářské technicko-ekonomické informace
tag
share
more
Univerzita Karlova šíří osvětu v oblasti otevřené vědy
Článek | Věda a výzkum

Univerzita Karlova šíří osvětu v oblasti otevřené vědy

Co jsou principy otevřené vědy? A jak probíhá správa vědeckých dat v takovém režimu? Centrum pro podporu open science Univerzity Karlovy se snaží bořit mýty osvětou.
Vědavýzkum.cz
tag
share
more
Prof. František Švec obdržel nejvýznamnější české ocenění udělované v oboru analytická chemie
Článek | Věda a výzkum

Prof. František Švec obdržel nejvýznamnější české ocenění udělované v oboru analytická chemie

V roce 2022 byla cena Jaroslava Janáka udělena Prof. Františku Švecovi za přínos k rozvoji nových chromatografických technik.
Farmaceutická fakulta Univerzity Karlovy v Hradci Králové
tag
share
more
Dosavadní způsoby hodnocení výzkumu procházejí transformací
Článek | Věda a výzkum

Dosavadní způsoby hodnocení výzkumu procházejí transformací

Budou poskytovatelé podpory a grantové agentury více naslouchat vědcům? Posouvá se pojetí excelence směrem k větší inkluzi? Jaká hodnoticí kritéria převažují jinde?
Vědavýzkum.cz
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Quantitation and Discovery analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap mass spectrometers

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Metabolomika

Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Wastewater

Aplikace
| 2026 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Non-Targeted Screening of Biosolids with the Xevo™ MRT Mass Spectrometer Reveals New Isoforms of PFAS

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

High Resolution Characterization of Lipid Nanoparticles Using the Xevo™ Charge Detection Mass Spectrometry (CDMS) Instrument - Single Particle Mass Analysis of Intact LNP-mRNA Formulations

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/HRMS, Charakterizace částic, LC/IT
Výrobce
Waters
Zaměření
Lipidomika

Out-of-the-box workflow for PFAS quantitation using a fullscan high-resolution approach with the Orbitrap Exploris EFOX Mass Detector

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Otevřený přístup k výsledkům výzkumu z pohledu managementu výzkumné organizace
Článek | Věda a výzkum

Otevřený přístup k výsledkům výzkumu z pohledu managementu výzkumné organizace

Otevřený přístup k výsledkům výzkumu představuje příležitost k další akceleraci výzkumných aktivit a šíření výsledků výzkumu mezi odbornou a nakonec i laickou veřejnost.
Vodohospodářské technicko-ekonomické informace
tag
share
more
Univerzita Karlova šíří osvětu v oblasti otevřené vědy
Článek | Věda a výzkum

Univerzita Karlova šíří osvětu v oblasti otevřené vědy

Co jsou principy otevřené vědy? A jak probíhá správa vědeckých dat v takovém režimu? Centrum pro podporu open science Univerzity Karlovy se snaží bořit mýty osvětou.
Vědavýzkum.cz
tag
share
more
Prof. František Švec obdržel nejvýznamnější české ocenění udělované v oboru analytická chemie
Článek | Věda a výzkum

Prof. František Švec obdržel nejvýznamnější české ocenění udělované v oboru analytická chemie

V roce 2022 byla cena Jaroslava Janáka udělena Prof. Františku Švecovi za přínos k rozvoji nových chromatografických technik.
Farmaceutická fakulta Univerzity Karlovy v Hradci Králové
tag
share
more
Dosavadní způsoby hodnocení výzkumu procházejí transformací
Článek | Věda a výzkum

Dosavadní způsoby hodnocení výzkumu procházejí transformací

Budou poskytovatelé podpory a grantové agentury více naslouchat vědcům? Posouvá se pojetí excelence směrem k větší inkluzi? Jaká hodnoticí kritéria převažují jinde?
Vědavýzkum.cz
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Quantitation and Discovery analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap mass spectrometers

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Metabolomika

Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Wastewater

Aplikace
| 2026 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Non-Targeted Screening of Biosolids with the Xevo™ MRT Mass Spectrometer Reveals New Isoforms of PFAS

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

High Resolution Characterization of Lipid Nanoparticles Using the Xevo™ Charge Detection Mass Spectrometry (CDMS) Instrument - Single Particle Mass Analysis of Intact LNP-mRNA Formulations

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/HRMS, Charakterizace částic, LC/IT
Výrobce
Waters
Zaměření
Lipidomika

Out-of-the-box workflow for PFAS quantitation using a fullscan high-resolution approach with the Orbitrap Exploris EFOX Mass Detector

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Otevřený přístup k výsledkům výzkumu z pohledu managementu výzkumné organizace
Článek | Věda a výzkum

Otevřený přístup k výsledkům výzkumu z pohledu managementu výzkumné organizace

Otevřený přístup k výsledkům výzkumu představuje příležitost k další akceleraci výzkumných aktivit a šíření výsledků výzkumu mezi odbornou a nakonec i laickou veřejnost.
Vodohospodářské technicko-ekonomické informace
tag
share
more
Univerzita Karlova šíří osvětu v oblasti otevřené vědy
Článek | Věda a výzkum

Univerzita Karlova šíří osvětu v oblasti otevřené vědy

Co jsou principy otevřené vědy? A jak probíhá správa vědeckých dat v takovém režimu? Centrum pro podporu open science Univerzity Karlovy se snaží bořit mýty osvětou.
Vědavýzkum.cz
tag
share
more
Prof. František Švec obdržel nejvýznamnější české ocenění udělované v oboru analytická chemie
Článek | Věda a výzkum

Prof. František Švec obdržel nejvýznamnější české ocenění udělované v oboru analytická chemie

V roce 2022 byla cena Jaroslava Janáka udělena Prof. Františku Švecovi za přínos k rozvoji nových chromatografických technik.
Farmaceutická fakulta Univerzity Karlovy v Hradci Králové
tag
share
more
Dosavadní způsoby hodnocení výzkumu procházejí transformací
Článek | Věda a výzkum

Dosavadní způsoby hodnocení výzkumu procházejí transformací

Budou poskytovatelé podpory a grantové agentury více naslouchat vědcům? Posouvá se pojetí excelence směrem k větší inkluzi? Jaká hodnoticí kritéria převažují jinde?
Vědavýzkum.cz
tag
share
more
 

Mohlo by Vás zajímat

Simultaneous Quantitation and Discovery analysis: Combining targeted and untargeted metabolomics on Orbitrap mass spectrometers

Aplikace
| 2026 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Metabolomika

Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Wastewater

Aplikace
| 2026 | Agilent Technologies
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
Výrobce
Agilent Technologies
Zaměření
Životní prostředí

Non-Targeted Screening of Biosolids with the Xevo™ MRT Mass Spectrometer Reveals New Isoforms of PFAS

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF, LC/HRMS
Výrobce
Waters
Zaměření
Životní prostředí

High Resolution Characterization of Lipid Nanoparticles Using the Xevo™ Charge Detection Mass Spectrometry (CDMS) Instrument - Single Particle Mass Analysis of Intact LNP-mRNA Formulations

Aplikace
| 2026 | Waters
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/HRMS, Charakterizace částic, LC/IT
Výrobce
Waters
Zaměření
Lipidomika

Out-of-the-box workflow for PFAS quantitation using a fullscan high-resolution approach with the Orbitrap Exploris EFOX Mass Detector

Aplikace
| 2025 | Thermo Fisher Scientific
Instrumentace
LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, LC/HRMS
Výrobce
Thermo Fisher Scientific
Zaměření
Životní prostředí
 

Podobné články

Otevřený přístup k výsledkům výzkumu z pohledu managementu výzkumné organizace
Článek | Věda a výzkum

Otevřený přístup k výsledkům výzkumu z pohledu managementu výzkumné organizace

Otevřený přístup k výsledkům výzkumu představuje příležitost k další akceleraci výzkumných aktivit a šíření výsledků výzkumu mezi odbornou a nakonec i laickou veřejnost.
Vodohospodářské technicko-ekonomické informace
tag
share
more
Univerzita Karlova šíří osvětu v oblasti otevřené vědy
Článek | Věda a výzkum

Univerzita Karlova šíří osvětu v oblasti otevřené vědy

Co jsou principy otevřené vědy? A jak probíhá správa vědeckých dat v takovém režimu? Centrum pro podporu open science Univerzity Karlovy se snaží bořit mýty osvětou.
Vědavýzkum.cz
tag
share
more
Prof. František Švec obdržel nejvýznamnější české ocenění udělované v oboru analytická chemie
Článek | Věda a výzkum

Prof. František Švec obdržel nejvýznamnější české ocenění udělované v oboru analytická chemie

V roce 2022 byla cena Jaroslava Janáka udělena Prof. Františku Švecovi za přínos k rozvoji nových chromatografických technik.
Farmaceutická fakulta Univerzity Karlovy v Hradci Králové
tag
share
more
Dosavadní způsoby hodnocení výzkumu procházejí transformací
Článek | Věda a výzkum

Dosavadní způsoby hodnocení výzkumu procházejí transformací

Budou poskytovatelé podpory a grantové agentury více naslouchat vědcům? Posouvá se pojetí excelence směrem k větší inkluzi? Jaká hodnoticí kritéria převažují jinde?
Vědavýzkum.cz
tag
share
more
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
FacebookX (Twitter)LinkedInYouTube
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.