<p><strong>Třetí ročník pracovního setkání odborníků na vodní ekosystémy pomalu získává na významu. Jedná se o mezioborové setkání, jehož cílem je spojovat informace, projekty a odborníky na vybraná témata ochrany vod.</strong></p><p>Setkání proběhne ve dnech 5. až 6. 2. 2026 v&nbsp;prostorách UJEP, budova CTPO, Pasteurova 15, Ústí nad Labem.</p><blockquote><p><strong>Další informace včetně přednášek z předchozích dvou ročníků konference k dispozici na </strong><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/297"><strong>profilu SeBiChem</strong></a><strong>.</strong></p></blockquote><h3><strong>Program</strong></h3><h4><strong>Čtvrtek 5. února</strong></h4><h5><strong>10:00 – 12:00 Registrace, ubytování – CPTO přízemí</strong></h5><h5><strong>12:00 – 13:00 </strong>Oběd</h5><h5><strong>13:00 – 14:00 Znečištění systému voda/půda ve vztahu k organismům, které v(z) nich žijí</strong></h5><ul><li>Roman Grabic a kol., FROV JČU</li></ul><h5><strong>14:00 – 14:30 Following the Mixtures of Organic Micropollutants with In Vitro Bioassays in Labe/Elbe from Source to Sea</strong></h5><ul><li>Elena Hommel et all, Helmholtz Centre for Environmental Research</li></ul><h5><strong>14:30 – 14:50 Mechorosty na toxických výsypkách v oblasti Sokolova: předběžné výsledky</strong></h5><ul><li>Lucie Fatková a kol., Ústav pro životní prostředí PřFUK</li></ul><h5><strong>14:50 – 15:00 Krátké komerční sdělení</strong></h5><ul><li>František Laštovička, AMEDIS, s.r.o.</li></ul><h5><strong>15:00 – 15:10 Krátké komerční sdělení</strong></h5><ul><li>Petr Barath, Metrohm Česká Republika, s.r.o.</li></ul><h5><strong>15:10 – 15:20 Krátké komerční sdělení</strong></h5><ul><li>Aneta Rychtr, DonauLab</li></ul><h5><strong>15:20 – 15:30 Krátké komerční sdělení</strong></h5><ul><li>J. Kokšal, Shimadzu Handels GmbH-organizační složka</li></ul><h5><strong>15:30 – 16:00 </strong>Přestávka</h5><h5><strong>16:00 – 16:30 Detekce benzenu ve vzorcích z Hustopečí s využitím bioreportéru Pseudomonas putida TVA8</strong></h5><ul><li>Josef Trögl, FŽP UJEP</li></ul><h5><strong>16:30 – 16:50 Vlivy působící na vodní bezobratlé v malých zemědělských tocích</strong></h5><ul><li>&nbsp;Libuše Barešová a kol., ČHMI</li></ul><h5><strong>16:50 – 17:10 &nbsp;Diclofenac jako nebezpečná látka kontaminující životní prostředí: výskyt, toxicita a možnosti dekontaminace</strong></h5><ul><li>Marian Rucki, Státní zdravotní ústav:</li></ul><h5><strong>17:10 – 17:40 &nbsp;Rybářské hospodaření jako významný faktor ovlivňující rybí společenstva v pstruhových vodách</strong></h5><ul><li>Tomáš Randák, FROV JČU</li></ul><h5><strong>17:40 – 18:00 &nbsp;Jak nám může (ne)vonět voda</strong></h5><ul><li>Emil Janeček, Povodí Ohře, s.p.</li></ul><h5><strong>18:00 Ukončení prvního dne setkání.</strong></h5><h5><strong>18:30</strong> Společenský večer, raut</h5><h4><strong>Pátek 6. února</strong></h4><h5><strong>8:00 – 9:00 </strong>Snídaně v prostorách UJEP</h5><h5><strong>9:00 – 9:30 &nbsp;Důlní jezera Milada a Most: cizorodé látky v makrořasách Vaucheria</strong></h5><ul><li>Kateřina Grabicová a kol., FROV JČU</li></ul><h5><strong>9:30 – 10:00 &nbsp;Řasové louky: bioremediační technologie pro ekologickou obnovu vodních biotopů</strong></h5><ul><li>Klára Řeháková a kol., Biologické Centrum AV ČR, HBÚ</li></ul><h5><strong>10:00 – 10:30 &nbsp;Řasové technologie pro rekultivaci</strong></h5><ul><li>Kateřina Čapková a kol, Biologické Centrum AV ČR, HBÚ</li></ul><h5><strong>10:30 – 11:00 Potenciál řas v recyklaci prvků vzácných zemin a remediaci prostředí</strong></h5><ul><li>Mária Čížková a kol, Botanický ústav AV ČR</li></ul><h5><strong>11:00 – 11:30 Výskyt pesticidů a léčiv v přehradních sedimentech</strong></h5><ul><li>Sylvie Kříženecká, FŽP UJEP</li></ul><h5><strong>11:30 – 11:45 Cestování za mikroplasty</strong></h5><ul><li>&nbsp; Hana Burdová, FSI UJEP</li></ul><h5><strong>11:30 – 12:30 </strong>Oběd</h5><h5><strong>12:30 – 14:30 Moderovaná diskuse na témata SeBiChem 2026</strong></h5><h5><strong>14:30 Ukončení setkání</strong></h5><blockquote><p><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.youtube.com/watch?v=dgS2fx4dGAE"><strong>Livestream z prvního dne</strong></a></p></blockquote><p>Konference SeBiChem 2026 bude realizována za <strong>podpory projektu IDEAL</strong>. Podrobnosti o tomto projektu je možné nalézt na stránkách:</p><ul><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://ideal-sncz.eu/cs/instroduction/"><strong>https://lnkd.in/eHdE5sFf</strong></a></li></ul><h4><strong>A také za podpory těchto firem:</strong></h4><ul><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/59"><strong>Watrex Praha, s. r. o.</strong></a></li><li>AMEDIS, s. r. o.</li><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/176"><strong>METROHM Česká republika, s. r. o.</strong></a></li><li>Donau Lab, s. r. o.</li></ul><h4><strong>S mediální podporou od:</strong></h4><ul><li><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/companies/1"><strong>portálu Labrulez&nbsp;</strong></a></li><li>časopisu Chemagazín</li></ul>

On-line stream a program odborného setkání SeBiChem 2026

<p><strong>Vědci z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR pronikají do detailů genové transkripce. Popsali dosud neznámý molekulární mechanismus, kterým může začínat přepis genetické informace z deoxyribonukleové kyseliny (DNA) do ribonukleové kyseliny (RNA). Zaměřili se na zvláštní molekuly nazývané alarmony, které se vyskytují v buňkách napříč organismy a jejichž hladina se často zvyšuje při buněčném stresu. Výsledky výzkumu zveřejnil prestižní vědecký časopis </strong><i><strong>Nature Chemical Biology</strong></i><strong>.</strong></p><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_bc2bfffa6c.jpg" alt="ÚOCHB/Tomáš Belloň: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Dr. Hana Cahová, vedoucí vědecké skupiny Chemická biologie nukleových kyselin." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_bc2bfffa6c.jpg 234w," sizes="100vw" width="2000" height="1335"></p><div><p>RNA molekuly mohou nést na jednom konci různé chemické modifikace, označované jako tzv. „čepičky“. U eukaryotních organismů, kam patří i lidské buňky, je nejznámější čepička, která se podílí na stabilitě RNA a regulaci jejího dalšího osudu. V posledních letech se však ukazuje, že existují i alternativní, nekanonické RNA čepičky, jejichž vznik a mechanismus připojení k RNA se zatím vymyká lidským znalostem. Mezi ně patří například tzv. alarmonové čepičky, tvořené molekulami dinukleosidpolyfosfátu, alarmonů, které chrání buněčnou RNA ve chvílích, kdy je buňka v ohrožení.</p><p>Tým <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://cahova.group.uochb.cz/cs"><strong>Dr. Hany Cahové</strong></a> se ve své studii zaměřil na RNA polymerázu z bakterií a sledoval, jakým způsobem může tento enzym zahájit transkripci za využití dinukleosidpolyfosfátů (NpNs) místo běžných stavebních bloků RNA. Vědci vůbec poprvé popsali na atomární úrovni, jak může vznikat RNA s alarmonovou čepičkou přímo při zahájení přepisu genu. Navíc pozorovali, že se Np<sub>n</sub>Ns vážou jiným typem párování, než je obvyklé.</p><p>Na práci se zásadně podílely <strong>Valentina Serianni z týmu Hany Cahové</strong>, která prokázala schopnost dinukleosidpolyfosfátů zahajovat přepis genu, a<strong> Jana Škerlová</strong>, která se zaměřila na strukturální analýzu RNA polymerázy a na základě dat z kryogenní elektronové mikroskopie ukázala, jak se molekuly dinukleosidpolyfosfátů váží do aktivního místa RNA polymerázy, tedy do srdce enzymu, kde se genetická informace přepisuje. Jejich studie pomáhá odhalovat procesy, které provázejí přepis genetické informace z DNA do RNA.</p><p>Hana Cahová k tomu dodává: <i>„Popisujeme něco, co se v buňkách skutečně děje a co nyní dokážeme pozorovat přímo na úrovni jednotlivých molekul. Získáváme tak odpovědi na zásadní otázky týkající se buněčných procesů, například jak se buňky přizpůsobují stresu. Právě RNA totiž přenáší kaskádu informací, které stojí za jakoukoli buněčnou reakcí, např. na stav ohrožení způsobený nedostatkem živin či teplotním šokem.“</i></p><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_2_0fe88ff9e9.jpg" alt="ÚOCHB/Tomáš Belloň: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Dr. Tomáš Kouba, vedoucí core facillity skupiny Kryogenní elektronová mikroskopie." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_2_0fe88ff9e9.jpg 234w," sizes="100vw" width="2000" height="1335"></p><div><p>Klíčovou roli v projektu sehrála kryogenní elektronová mikroskopie (cryo-EM), kterou ved<strong>l Dr. Tomáš Kouba</strong>, jeden z autorů článku. <i>„Kryoelektronová mikroskopie umožňuje zmrazit biologické molekuly skoro v jejich přirozené formě a následné získat trojrozměrnou strukturu takových molekul. Díky tomu můžeme nahlédnout přímo do aktivního centra enzymů a sledovat jejich fungování až na atomární úrovni,“ </i>vysvětluje Tomáš Kouba.</p><p>ÚOCHB vloni otevřel nové<strong> </strong><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://cryoem.group.uochb.cz/cs"><strong>centrum cryo-EM</strong></a>, které je v českém prostředí unikátní. Špičkové kryogenní elektronové mikroskopy našly zázemí ve speciálně navržené budově a umožňují studium biologických procesů s mimořádnou strukturální přesností.</p><p><img src="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_3_4d881e7a58.jpg" alt="ÚOCHB: Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace: Tato práce ukazuje, jak malé molekuly NpnN pomáhají bakteriím zahájit přepis genetické informace. Detailní zobrazení pomocí kryogenní elektronové mikroskopie odhaluje, jak se vážou na genetickou šablonu a fungují jako nekanonické „čepičky“ RNA." srcset="https://storage.googleapis.com/labrulez-bucket-strapi-h3hsga3/thumbnail_UOCHB_Vyzkum_z_UOCHB_odhaluje_dosud_nepoznany_zpusob_prepisu_geneticke_informace_3_4d881e7a58.jpg 245w," sizes="100vw" width="2000" height="1077"></p><blockquote><h4><strong>Původní článek</strong></h4><h4><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://www.nature.com/articles/s41589-025-02134-5#citeas"><strong>Molekulární vhled do 5′ zakončení RNA pomocí Np</strong><i><strong><sub>n</sub></strong></i><strong>Ns zprostředkovaného bakteriální RNA polymerázou</strong></a></h4><p>Valentina M. Serianni, Jana Škerlová, Anna Knopp Dubánková, Anton Škríba, Hana Šváchová, Tereza Vučková, Anatolij Filimoněnko, Milan Fábry, Pavlína Řezáčová, Tomáš Kouba &amp; Hana Cahova&nbsp;</p><p><strong>Nat. Chem. Biol.</strong> <strong>21</strong> (2026)</p><p><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://doi.org/10.1038/s41589-025-02134-5">https://doi.org/10.1038/s41589-025-02134-5</a></p><h6>licencováno pod <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/"><strong>CC-BY 4.0</strong></a></h6></blockquote><h4><strong>Abstrakt</strong></h4><p>RNA zakončená dinukleosidovými polyfosfáty byla u bakterií i eukaryot objevena teprve nedávno. Pravděpodobný mechanismus tohoto specifického typu zakončení RNA spočívá v přímém začlenění dinukleosidových polyfosfátů RNA polymerázou jako nekanonických iniciačních nukleotidů. Dosud však nebylo známo, jakým způsobem se tyto sloučeniny vážou do aktivního místa RNA polymerázy během zahájení transkripce. V této práci jsme in vitro studovali iniciaci transkripce za použití série DNA templátů v kombinaci s dinukleosidovými polyfosfáty a modelovou RNA polymerázou z bakterie <i>Thermus thermophilus</i>. Zjistili jsme, že místo zahájení transkripce se může lišit v závislosti na kompatibilitě konkrétního templátu a použitého dinukleosidového polyfosfátu. Struktury iniciačních transkripčních komplexů s dinukleosidovými polyfosfáty získané pomocí kryogenní elektronové mikroskopie odhalily, že obě nukleové báze v molekule mohou párovat s DNA templátem. První kódovaný nukleotid se páruje kanonickým Watsonovým–Crickovým způsobem, zatímco druhá nukleová báze se váže nekanonicky prostřednictvím reverzního Watsonova–Crickova párování. Tato práce tak poskytuje strukturní vysvětlení mechanismu, kterým dinukleosidové polyfosfáty zahajují transkripci RNA.</p></div></div>

Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace

<p>🎤 <strong>Přednášející: Michal Belianský</strong></p><h3><strong>VIZE 2025: Empower Method Validation Manager</strong></h3><h4><strong>Empower Method Validation Manager (MVM): moderní přístup k validaci chromatografických metod</strong></h4><p>Validace analytických metod je klíčovým požadavkem regulovaných laboratoří v oblasti farmacie, biotechnologií i kontroly kvality. Software <strong>Empower Method Validation Manager (MVM)</strong> od společnosti Waters představuje komplexní nástroj, který umožňuje provádět validaci chromatografických metod systematicky a plně v souladu s požadavky lékopisů a regulačních autorit.</p><p>MVM je rozšířením chromatografického datového systému <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/627"><strong>Empower</strong></a>, díky čemuž propojuje vývoj, validaci, zpracování dat i reporting do jednoho uceleného workflow.</p><h4><strong>Automatizované výpočty a System Suitability</strong></h4><p>Jednou z hlavních výhod Empower MVM je využití <strong>automaticky generovaných chromatografických parametrů</strong>, jako jsou:</p><ul><li>rozlišení (Resolution),</li><li>faktor symetrie a tailing,</li><li>počet teoretických pater (Plate Count),</li><li>výška a šířka píku,</li><li>poměr signál/šum (S/N).</li></ul><p>Tyto parametry jsou vyhodnocovány v souladu s požadavky <strong>USP, EP i JP</strong> a mohou být přímo použity v rámci testů <strong>System Suitability</strong>, čímž se minimalizuje riziko manuálních chyb a zvyšuje konzistence výsledků.</p><h4><strong>Podpora chemických struktur a specifických aplikací</strong></h4><p>Empower MVM nabízí také rozšíření <strong>Chemical Structures</strong>, které je integrováno ve spolupráci s ACD/Labs. Díky tomu lze přímo v prostředí Empoweru:</p><ul><li>kreslit a upravovat chemické struktury,</li><li>vytvářet knihovny sloučenin,</li><li>vkládat struktury do tabulek komponent a zahrnovat je do reportů.</li></ul><p>Další specializovaná rozšíření pokrývají například:</p><ul><li><strong>Dissolution</strong> – automatizované vyhodnocení disolučních testů včetně výpočtů f1, f2 a Q faktoru,</li><li><strong>GPC/SEC pro polymerní analýzu</strong> – výpočty molekulových hmotností (Mw, Mn, Mp, Mz) a kombinaci dat z RI a LS detektorů,</li><li><strong>Sample Weight Importer</strong> – přímý přenos hmotností ze vah do Empoweru s plnou auditní stopou.</li></ul><h4><strong>Validace metod krok za krokem v MVM</strong></h4><p>Empower Method Validation Manager strukturuje validaci do tří hlavních fází:</p><ol><li><strong>Validation Protocol</strong><br>Definice validačních požadavků, akceptačních kritérií, typů testů a schvalovacích procesů.</li><li><strong>Validation Study</strong><br>Řízení celé validační studie v jednom projektu – akvizice dat, jejich zpracování, statistické výpočty a průběžné hodnocení souladu s kritérii.</li><li><strong>Reporting</strong><br>Automatizovaná tvorba validačních reportů z předdefinovaných šablon, včetně elektronických podpisů a plné sledovatelnosti změn.</li></ol><p>Software podporuje všechny klíčové validační testy, jako jsou linearita, přesnost, správnost, specificita, LOD/LOQ, opakovatelnost, mezilehlá přesnost, robustnost či stabilita metody</p><h4><strong>Integrace, migrace dat a monitoring systémů</strong></h4><p>Součástí ekosystému Empoweru jsou i nástroje pro <strong>migraci dat z jiných CDS</strong> (např. Agilent ChemStation/OpenLab, Thermo Chromeleon, MassLynx) pomocí modulu <strong>Waters Data Converter</strong>.</p><p>Díky platformě <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://lcms.cz/products/1544"><strong>waters_connect</strong></a><strong> System Monitoring</strong> mají uživatelé přehled o stovkách chromatografických a LC-MS systémů, mohou sledovat jejich stav v reálném čase, dostávat automatické notifikace a efektivně plánovat využití přístrojů, což významně zvyšuje produktivitu laboratoře.</p><h4><strong>Závěr</strong></h4><p>Empower Method Validation Manager představuje robustní a regulatorně připravené řešení pro validaci chromatografických metod od A do Z. Automatizace výpočtů, jednotné řízení validačních studií, pokročilé reportingové nástroje a hluboká integrace s CDS Empower činí z MVM silný nástroj pro laboratoře, které kladou důraz na kvalitu dat, efektivitu práce a plnou shodu s regulačními požadavky.</p>

Waters VIZE 2025: Empower Method Validation Manager

Přednáška

Věda a výzkum

Video

Článek

Produkt

Nejbližší akce

ÚOCHB AV ČR je přední mezinárodně uznávaná vědecká instituce, jejímž hlavním posláním je základní výzkum v oblasti chemické biologie a medicinální chemie, organické a materiálové chemie, chemie přírodních látek, biochemie a molekulární biologie, fyzikální chemie, teoretické chemie a analytické chemie.

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR

Setkání odborníků z oblasti biologie a chemie vodních ekosystémů pod záštitou Povodí Ohře, s. p., jehož cílem je najít společná témata a navázat vzájemnou mezioborovou spolupráci.

SeBiChem

Firmu Waters založil v roce 1958 pan James Waters. Od té doby se společnost Waters specializuje na kapalinovou chromatografii a hmotnostní spektrometrii. Divize TA Instruments působí na poli termální analýzy. V České republice je Waters zastoupen přímou pobočkou, která sídlí v Praze.

Waters Gesellschaft

Bruker

Spectroscopy & Separation Science

<p><strong>The increasing popularity of extra virgin olive oil (EVOO) and the increasing problem of food fraud have provided the need for quality and authenticity control. Typical problems are the mislabeling of protected designation of origin (PDO) or edible oil adulteration. In this presentation we give an overview about the capabilities of different mass spectrometric methods to accurately determine the PDO of EVOO.</strong></p>
<ul>
<li>Multi-class LC-MS and GC-MS methodologies together with statistical methods enable the discrimination between different PDOs, identifying potential origin markers.</li>
<li>The combined use of non-targeted and targeted approaches enhances the outcome of the study. GC-APCI-QTOF preserves the pseudo-molecular ion information, which is a great advantage and facilitates the identification.</li>
<li>Co-eluting isomers maybe PDO markers and these can be identified and characterized by timsTOF technology.</li>
<li>Rapid LC-free, magnetic resonance mass spectrometry (MRMS) analysis was used for mapping and quality control assessment of EVOO using statistical methods which allows for clustering according to geographical origin, harvesting year, cultivation practice and the oil production procedure.</li>
</ul>
<h5><strong>Key Topics</strong></h5>
<ul>
<li>Introduction to food authenticity using the example of EVOO and the application of new software tools, in combination with UHPLC-QTOF and GC-APCI-QTOF, to identify origin markers.</li>
<li>Introduction into timsTOF technology and the separation of isomeric markers by timsTOF.</li>
<li>Application of LC-free, magnetic resonance mass spectrometry (MRMS) for rapid quality control assessment of extra virgin olive oil.</li>
</ul>
<h5><strong>Who should attend?</strong></h5>
<ul>
<li>Scientist working in the field of food research and foodomics interested in determining authenticity and/or adulteration of edible oils.</li>
<li>Scientists wishing to learn about powerful new techniques to separate isobaric isomers by mass spectroscopic techniques.</li>
</ul>
<blockquote>
<p><strong>Presenter:  Dr. Carsten Baessmann</strong></p>
</blockquote>
<blockquote>
<p>Dr. Carsten Baessmann is responsible for the development of new mass spectrometry-based solutions in the applied markets. His responsibilities include managing collaborations with leading researchers in food, environmental, forensics and clinical analysis. He is also responsible for driving the necessary hardware and software development. Dr. Baessmann holds a PhD in physical chemistry from the Technical University of Munich in the development of new mass spectrometric and laser spectroscopic methods. He has held various management positions in research and development and application development at Bruker for 22 years.</p>
</blockquote>


Pixabay/engin akyurt: Application of new mass spectrometric methods and workflows to determine authenticity of food

Application of new mass spectrometric methods and workflows to determine authenticity of food

<p><strong>There is increased concern regarding the authenticity of basmati rice throughout the world. For years, traders have been passing off a lesser quality rice as the world&#39;s finest long-grained, aromatic rice, basmati, in key markets like the US, Canada and the EU.</strong></p>
<p>In this on-demand webinar, we describe a proof of principle method to assess the authenticity of basmati rice using the latest advancements in high resolution GC-MS and informatics technologies. Volatile compounds of interest were extracted from heated dry rice via SPME and headspace. Following a generic GC separation, detection was performed using a SYNAPT G2-Si MS run in HDMSE mode. Collection of a HDMSE dataset offers a high level of specificity owing to the orthogonal nature of the ion mobility separation to the GC separation.</p>
<p>Progenesis QI, the latest OMICS informatics package from Waters, is designed to utilize the 4-dimensional data produced during a SYNAPT G2-Si HDMSE acquisition. Initially, alignment of all injections was performed followed by the unique peak co-detection process resulting in the same number of analyte measurements in every sample and no missing values. Data from all isotopes and adducts of a parent compound were then deconvoluted giving a single robust and accurate quantitative measurement for that parent compound. The peak picking and deconvolution algorithms ensure a high quality compound table where adducts and isotopes are grouped with the parent m/z. Compounds of interest from the rice samples were highlighted using various multivariate statistical techniques such as PCA and identified using elucidation tools and relevant database searches within the software platform.</p>
<p>This workflow has general applicability to many areas of discovery OMICS and food research where biomarkers differentiating between two or multiple groups are required.</p>
<h3><strong>What will I learn?</strong></h3>
<ul>
<li>An experimental workflow to evaluate the authenticity of foodstuffs</li>
<li>A basic workflow for the discovery of volatile biomarkers between multiple groups of samples</li>
<li>The basics of HDMSE data independent acquisition</li>
<li>How Progenesis QI is used to analyze metabolomics data</li>
</ul>
<h3><strong>Who should attend?</strong></h3>
<ul>
<li>Food research scientists</li>
<li>Metabolomics research scientists</li>
<li>Biomarker research scientists</li>
</ul>
<blockquote>
<p><strong>Presenter: Robert Tonge, Ph.D. (Senior Product Manager, OMICS Informatics, Waters Corporation)</strong></p>
</blockquote>
<blockquote>
<p>Dr Robert Tonge is Senior Product Manager for OMICS Informatics at Waters Corporation, Manchester UK. Robert has been at Waters for 4 years in both Product Development and Field Marketing and has approaching 20 years experience in OMICS science. He trained initially in Biochemistry and Toxicology before moving to &#39;Big Pharma&#39; where he worked in Discovery and Translational Research across a wide variety of disease areas from cancer, cardiovascular disease and infection research.</p>
</blockquote>
<blockquote>
<p><strong>Presenter: Gareth Cleland, Ph.D. (Principal Scientist, Food &amp; Environmental Business, Waters Corporation)</strong></p>
</blockquote>
<blockquote>
<p>Dr Gareth Cleland is a Principal Scientist within the Food and Environment Business Operations at Waters Headquarters, USA. Following his Chemistry studies, he started his professional career working as a Development Chemist for a small coatings company in Oxfordshire, UK. He joined Waters Corporation in 2002 and has held various roles within the organization, both UK and US based, over the last 12 years.</p>
</blockquote>


Pixabay/Trung Hieu Dang: Discovery OMICS and Progenesis QI for Food Authenticity Testing

LCMS webináře se zaměřením na GC/APCI - strana 2

Application of new mass spectrometric methods and workflows to determine authenticity of food

Discovery OMICS and Progenesis QI for Food Authenticity Testing

Mohlo by Vás zajímat

On-line stream a program odborného setkání SeBiChem 2026

Výzkum z ÚOCHB odhaluje dosud nepoznaný způsob přepisu genetické informace

Waters VIZE 2025: Empower Method Validation Manager