LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

Separation and Analysis of Low Molecular Weight Organic Acid Metabolites by Mixed-Mode Chromatography Coupled to Mass Spectrometry

Postery | 2019 | WatersInstrumentace
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
Zaměření
Metabolomika
Výrobce
Waters

Souhrn

Význam tématu


Metabolity citrátového (TCA) cyklu tvoří klíčové ukazatele buněčného dýchání a energetického stavu organismu. Díky své malé molekulární hmotnosti a vysoké polarity je jejich analýza náročná. Standardní RP metody často neposkytují dostatečnou retenci ani selektivitu, což komplikuje rozlišení izobarických párů, jako jsou citrát a isocitrát. Implementace spolehlivého a rychlého přístupu pro kvantifikaci těchto organických kyselin má významné dopady v biochemickém výzkumu, klinické diagnostice či monitorování metabolických poruch.

Cíle a přehled studie


Studie sleduje zavedení nového chromatografického protokolu pro nederivativní separaci nízkomolekulárních organických kyselin z moči pacientek s karcinomem prsu. Hlavní cíle:
  • Optimalizovat separaci a retenci TCA metabolitů bez iontově párovacích činidel.
  • Uplatnit metodu na reálné vzorky moči pro odhalení odlišností mezi zdravými a onkologickými pacientkami.
  • Vyhodnotit výsledky pomocí pokročilé statistické analýzy.

Použitá metodika a instrumentace


Vzorky moči byly ředěny deionizovanou vodou, centrifugovány a analyzovány bez předchozí derivatizace. Separace proběhla na UPLC systému ACQUITY I-Class s kolonou CSH Phenyl-Hexyl (2,1×100 mm, 1,7 µm) při 60 °C. Mobilní fáze A byla voda s 0,1 % kyseliny mravenčí, fáze B acetonitril s 0,1 % kyseliny mravenčí. Gradient šel z 0 do 25 % fáze B za 4 minuty při průtoku 0,4 ml/min. Detekce byla realizována pomocí hmotnostního spektrometru Xevo G2-XS TOF v negativním ionizačním módu s MSe akvizicí.
Software pro zpracování dat zahrnovalo MassLynx 4.1, Progenesis QI a EZinfo pro multivariační statistiku.

Hlavní výsledky a diskuse


Metoda dosáhla dobré retence standardních metabolitů TCA cyklu (laktát 1,0 min, malát 1,15 min, sukcinát 1,2 min, isokitrát 1,4 min, citrát 1,8 min apod.). Separace moči zdravých i karcinomových vzorků vykázala jasné odlišení v PCA a OPLS-DA modelech. Bylo identifikováno několik markerů s významnou změnou abundancí (např. ionty m/z 363,0280 při tR 3,34 min a 295,0894 při tR 0,83 min), které byly následně přiřazeny pomocí databází HMDB, KEGG a METLIN.
Navržené identity klíčových signálů (např. xanosinmonofosfát, dipeptid kyselina asparagová-tyrosin) budou potvrzeny komerčními standardy.

Přínosy a praktické využití metody


Navržený postup umožňuje:
  • Rychlou a reprodukovatelnou analýzu polárních organických kyselin bez nutnosti derivatizace.
  • Spolehlivou diferenciaci klinických skupin na základě metabolického profilu moči.
  • Možnost širší aplikace v metabolomice, klinické diagnostice a farmakologickém výzkumu.

Budoucí trendy a možnosti využití


Metoda lze rozšířit o kvantitativní modul s použitím izotopově značených standardů. Integrace dalších režimů ionizace (pozitivní mód) a implementace cílených MRM metod by mohla zvýšit citlivost a specifičnost pro nízkokoncentrované analyty. Kombinace s technikami kapalinové chromatografie s vysokým rozlišením (HR-LC) či online frakcionací může dále rozšířit metabolomický pokrytí.

Závěr


Předložená mixed-mode UPLC-TOF MS metoda nabízí efektivní řešení pro analýzu TCA cyklu a souvisejících organických kyselin v biologických vzorcích. Metoda prokázala schopnost statisticky významně rozlišit metabolické profily zdravých a karcinomem ovlivněných vzorků.
Další validace s komerčními standardy a rozšíření metodiky napomohou k její aplikaci v rutinní klinické praxi a výzkumu.

Reference


Smith K.M., Rainville P.D. Mixed-Mode Chromatography Coupled to Mass Spectrometry for Low Molecular Weight Organic Acid Metabolites. Waters Corporation, 2019.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
Separation and Analysis of TCA Cycle Analytes by Mixed-Mode Chromatography Coupled with Mass Spectrometry
[ APPLICATION NOTE ] Separation and Analysis of TCA Cycle Analytes by Mixed-Mode Chromatography Coupled with Mass Spectrometry Kerri M. Smith and Paul Rainville Waters Corporation, Milford, MA, USA APPLICATION BENEFITS ■ ■ INTRODUCTION A reproducible LC-MS method for the…
Klíčová slova
tca, tcaacid, acidcycle, cycleprogenesis, progenesismixed, mixedanalytes, analytesuplc, uplccitric, citriccoupled, coupledmode, modespectrometry, spectrometryaconitic, aconiticacquity, acquityapplication, applicationisocitric
Ion Pairing Free Mixed-Mode Chromatography for the Separation and Measurement of TCA Cycle Metabolites in Urine Samples of Breast Cancer Patients
Ion Pairing Free Mixed-Mode Chromatography for the Separation and Measurement of TCA Cycle Metabolites in Urine Samples of Breast Cancer Patients Kerri M Smith, Giorgis Isaac, Suraj Dhungana and Paul D. Rainville Waters Corporation, Milford MA RESULTS and DISCUSSION Additional…
Klíčová slova
tca, tcaacid, acidurine, urinebreast, breastcycle, cyclepool, poolhealthy, healthyanalytes, analytespairing, pairingcancer, cancerpremier, premierisocitric, isocitriccsh, cshhps, hpsmaxpeak
High Sensitivity Metabolite Screening with ionKey/MS Using Post-Column Addition
High Sensitivity Metabolite Screening with ionKey/MS Using Post-Column Addition Angela Doneanu, Jim Murphy, and Paul Rainville Waters Corporation, Milford, MA, USA A P P L I C AT I O N B E N E F I T S INT…
Klíčová slova
ionkey, ionkeypost, postaddition, additionmetabolite, metabolitesensitivity, sensitivityisopropanol, isopropanolcolumn, columnurine, urinescreening, screeningibuprofen, ibuprofenintense, intenseesbpi, esbpihigh, highabsence, absencetime
Evaluation of Ion Mobility/Tof Mass Spectrometry with  Multiple LC Method Parameters for Enhanced Detection  in Metabolic Profiling
[ APPLICATION NOTE ] Evaluation of Ion Mobility/Tof Mass Spectrometry with Multiple LC Method Parameters for Enhanced Detection in Metabolic Profiling Paul D. Rainville,1 Ian D. Wilson, 2 and Robert S. Plumb 1,2 1 Waters Corporation, Milford, MA, USA 2…
Klíčová slova
mobility, mobilityims, imsfeatures, featuresdetection, detectiongradient, gradientdetected, detectedduration, durationion, ionfeature, featuretof, tofuplc, uplcspectrometry, spectrometryenhanced, enhancedmetabonomics, metabonomicsevaluation
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.