Establishment of a Method for Direct Analysis of the Mouse Brain Metabolome Using the DPiMS-8060
Aplikace | 2019 | ShimadzuInstrumentace
Metabolomická analýza poskytuje komplexní pohled na endogenní metabolity v biologickém vzorku. Rychlá a bezpřípravná metoda je klíčová pro aplikace, kde je třeba minimalizovat zásah do vzorku a zkrátit dobu analýzy. Kombinace PESI a tandemové hmotnostní spektrometrie zvyšuje citlivost a rychlost detekce metabolitů v mozkových tkáních.
Studie si klade za cíl vyvinout a validovat postup pro přímou analýzu metabolomů myšího mozku bez složitého předzpracování. Využitá instrumentace DPiMS-8060 propojuje ultrajemnou sondou PESI s rychlým tandemovým MS, což umožňuje analyzovat široké spektrum metabolitů (aminokyseliny, organické kyseliny, cukry) během 0,2 minuty na vzorek.
Vzorky standardních metabolitů bylo připraveno v 50% ethanolu a analyzováno formou MRM přechodů optimalizovaných pro každou sloučeninu. Mozkové tkáně (frontální kůra a hippocampus) modelové skupiny (léčba AM-2201) a kontrolní skupiny byly přímo sondovány sondou s průměrem hrotu ~700 nm. Hmotnostní spektrometr DPiMS-8060 pracuje bez chromatografického dělení, vysoké napětí na sondě zajišťuje ionizaci.
PLS-DA modelové a kontrolní skupiny ukázala jasné oddělení metabolomických profilů, s klíčovými změnami v hladinách glutamové a sukcinové kyseliny. Metoda dosáhla srovnatelných výsledků s dříve publikovanou GC/MS/MS technikou, přičemž eliminuje přetížení lipidy v mozku. Lokální analýza odlišností mezi frontální kůrou a hippocampem potvrdila, že vliv matrice je minimální a stabilní.
Metoda umožňuje rychlé a citlivé měření mozkových metabolitů bez časově náročného předzpracování, což zefektivňuje rutinní metabolomické studie i farmakologický výzkum. Ultrajemná sonda otevírá možnosti pro prostorově rozlišené analýzy v mikrooblastech tkáně.
Další vývoj může směřovat k automatizaci sondování, rozšíření počtu monitorovaných sloučenin a aplikaci v klinickém výzkumu neurodegenerativních onemocnění. Metoda by mohla být integrována s obrazovacími technikami pro korelaci metabolitických změn s morfologií.
DPiMS-8060 představuje efektivní platformu pro přímou, rychlou a přesnou analýzu mozkového metabolomu. Vynechání předzpracování zjednodušuje workflow a umožňuje detailní regionální analýzu, což rozšiřuje možnosti aplikace v biomedicínském výzkumu.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ, DART
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Metabolomická analýza poskytuje komplexní pohled na endogenní metabolity v biologickém vzorku. Rychlá a bezpřípravná metoda je klíčová pro aplikace, kde je třeba minimalizovat zásah do vzorku a zkrátit dobu analýzy. Kombinace PESI a tandemové hmotnostní spektrometrie zvyšuje citlivost a rychlost detekce metabolitů v mozkových tkáních.
Cíle a přehled studie
Studie si klade za cíl vyvinout a validovat postup pro přímou analýzu metabolomů myšího mozku bez složitého předzpracování. Využitá instrumentace DPiMS-8060 propojuje ultrajemnou sondou PESI s rychlým tandemovým MS, což umožňuje analyzovat široké spektrum metabolitů (aminokyseliny, organické kyseliny, cukry) během 0,2 minuty na vzorek.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky standardních metabolitů bylo připraveno v 50% ethanolu a analyzováno formou MRM přechodů optimalizovaných pro každou sloučeninu. Mozkové tkáně (frontální kůra a hippocampus) modelové skupiny (léčba AM-2201) a kontrolní skupiny byly přímo sondovány sondou s průměrem hrotu ~700 nm. Hmotnostní spektrometr DPiMS-8060 pracuje bez chromatografického dělení, vysoké napětí na sondě zajišťuje ionizaci.
Hlavní výsledky a diskuse
PLS-DA modelové a kontrolní skupiny ukázala jasné oddělení metabolomických profilů, s klíčovými změnami v hladinách glutamové a sukcinové kyseliny. Metoda dosáhla srovnatelných výsledků s dříve publikovanou GC/MS/MS technikou, přičemž eliminuje přetížení lipidy v mozku. Lokální analýza odlišností mezi frontální kůrou a hippocampem potvrdila, že vliv matrice je minimální a stabilní.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda umožňuje rychlé a citlivé měření mozkových metabolitů bez časově náročného předzpracování, což zefektivňuje rutinní metabolomické studie i farmakologický výzkum. Ultrajemná sonda otevírá možnosti pro prostorově rozlišené analýzy v mikrooblastech tkáně.
Budoucí trendy a možnosti využití
Další vývoj může směřovat k automatizaci sondování, rozšíření počtu monitorovaných sloučenin a aplikaci v klinickém výzkumu neurodegenerativních onemocnění. Metoda by mohla být integrována s obrazovacími technikami pro korelaci metabolitických změn s morfologií.
Závěr
DPiMS-8060 představuje efektivní platformu pro přímou, rychlou a přesnou analýzu mozkového metabolomu. Vynechání předzpracování zjednodušuje workflow a umožňuje detailní regionální analýzu, což rozšiřuje možnosti aplikace v biomedicínském výzkumu.
Reference
- Hayashi Y.; Zaitsu K.; Murata T., et al. Analytica Chimica Acta 2017, 983, 160–165.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Direct Probe Ionization Mass Spectrometer - Application Notebook
2019|Shimadzu|Příručky
C10G-E078 Direct Probe Ionization Mass Spectrometer Index Introduction to DPiMS DPiMS: Mechanism of Action Application Notes Summary Quick and Sensitive Screening for Tetrodotoxin Contamination Direct Analysis of Pesticides in Agricultural Products Rapid and Quantitative Analysis of Drugs in Forensic Specimens…
Klíčová slova
probe, probepesi, pesiionization, ionizationacid, acidpetunia, petuniaabiraterone, abirateroneeverolimus, everolimusanthocyanin, anthocyaninelectrospray, electrosprayanalysis, analysisfrontal, frontalliver, liverpetals, petalsmass, massbrain
Establishment of a Method for Direct Analysis of the Mouse Liver Metabolome Using the DPiMS-8060
2019|Shimadzu|Aplikace
LAAN-A-TM-E059 Application News No. B88 Probe Electrospray Ionization Mass Spectrometer Establishment of a Method for Direct Analysis of the Mouse Liver Metabolome Using the DPiMSTM-8060 In the analysis of endogenous metabolites (metabolome analysis), it is difficult to perfectly remove biases…
Klíčová slova
acid, acidmetabolome, metabolomemouse, mouseliver, livertaurine, taurinemodel, modelpca, pcafailure, failureaminotransferase, aminotransferasehealthy, healthyglutaric, glutaricpyruvic, pyruvicintact, intactornithine, ornithinemalic
Establishment of a Method for Direct Analysis of the Mouse Liver Metabolome Using the DPiMS-8060
2019|Shimadzu|Aplikace
LAAN-A-TM-E059 Application News No. B88 Probe Electrospray Ionization Mass Spectrometer Establishment of a Method for Direct Analysis of the Mouse Liver Metabolome Using the DPiMSTM-8060 In the analysis of endogenous metabolites (metabolome analysis), it is difficult to perfectly remove biases…
Klíčová slova
acid, acidmetabolome, metabolomemouse, mouseliver, livertaurine, taurinemodel, modelpca, pcafailure, failureaminotransferase, aminotransferasehealthy, healthyglutaric, glutaricpyruvic, pyruvicintact, intactornithine, ornithinemalic
Shimadzu Kit for Direct Probe Ionization Mass Spectrometer - DPiMS-8060
2018|Shimadzu|Brožury a specifikace
C146-E369 Kit for Direct Probe Ionization Mass Spectrometer DPiMS-8060 Quick and Easy Measurement Without Sample Preparation — Direct Probe Ionization-MS — The PESI (Probe Electro Spray Ionization) TQ unit can easily replace an ESI unit for use in combination with…
Klíčová slova
acid, acidamino, aminopesi, pesiprobe, probeionization, ionizationliver, livertaurine, taurinelcms, lcmsplate, platedpims, dpimsbiological, biologicalunit, unitornithine, ornithinekidney, kidneylung