ATOMÁRNÍ A MOLEKULÁRNÍ ZOBRAZOVACÍ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE
Vědecké články | 2020 | Chemické listyInstrumentace
Zobrazovací hmotnostní spektrometrie (MSI) je klíčová technika pro prostorovou lokalizaci biomolekul na ploše tkání a materiálů bez nutnosti značení. Díky schopnosti detekovat proteiny, peptidy, lipidy i malé metabolity přináší nové možnosti v diagnostice onemocnění, studiu farmakokinetiky léčiv a základním i aplikovaném výzkumu.
Článek shrnuje historický vývoj IMS a MSI od SIMS z roku 1962 po moderní konfigurace MALDI-MSI, SIMS-MSI a LA-ICP-MSI. Diskutuje přípravu vzorků, různé ionizační modality a analyzátory i vybrané aplikace v biologii a materiálových vědách.
MSI pracuje zpravidla rastrovacím principem, kde jednotlivé pixely odpovídají spektrům získaným desorpcí a ionizací. Klíčové modality zahrnují
Porovnání analyzátorů ukazuje:
MSI přináší
Rozvoj submikrometrických technik (AFM-MSI), rychlejších laserů, pokročilé post-ionizace, automatické datové fúze a strojového učení pro interpretaci rozsáhlých datasetů otevře cestu k průmyslovým a klinickým aplikacím v personalizované medicíně.
Zobrazovací hmotnostní spektrometrie se rychle vyvíjí a prosazuje jako nezastupitelná metoda pro chemickou vizualizaci v biologii i materiálových vědách. Díky pokračujícím technologickým inovacím a multimodálnímu přístupu lze očekávat rozšířené využití v diagnostice, farmacii a pokročilém výzkumu.
1 Castaing R, Slodzian G: C R Acad Sci 255, 1893 (1962).
2 Caprioli RM: US Patent US5808300A (1998).
3 Spengler B, Hubert M, Kaufmann R: Proc 42nd Am Soc Mass Spectr, p 1041 (1994).
4 Vidová V, Volný M, Lemr K, Havlíček V: Collect Czech Chem Commun 74, 1101 (2009).
5 Pól J, Strohalm M, Havlíček V, Volný M: Histochem Cell Biol 134, 423 (2010).
6 Ellis SR, Soltwisch J, Paine MRL, Dreisewerd K, Heeren RMA: Chem Commun 53, 7246 (2017).
7 Deutskens F, Yang JH, Caprioli RM: J Mass Spectrom 46, 568 (2011).
8 Dreisewerd K, Yew JY: Nat Methods 14, 1139 (2017).
9 Schober Y, Guenther S, Spengler B, Rompp A: Anal Chem 84, 6293 (2012).
10 Casadonte R, Caprioli RM: Nat Protoc 6, 1695 (2011).
11 Balluff B, Schone C, Hofler H, Walch A: Histochem Cell Biol 136, 227 (2011).
12 Greer T, Sturm R, Li LJ: J Proteomics 74, 2617 (2011).
13 Cassat JE et al: Sci Transl Med 10, eaan6361 (2018).
14 Pól J et al: Anal Chem 81, 8479 (2009).
15 Vidová V et al: Anal Chem 82, 4994 (2010).
16 Vidová V et al: J Lipid Res 51, 2295 (2010).
17 Pól J et al: PLoS One 6, e19441 (2011).
18 Strohalm M et al: Anal Chem 83, 5458 (2011).
19 Niehaus M et al: Nat Methods 16, 925 (2019).
20 Luptáková D et al: Sci Rep 8, 6952 (2018).
21 Luptáková D et al: Sci Rep 7, 16523 (2017).
22 Novák J et al: Biochim Biophys Acta Proteins Proteomics 1865, 768 (2017).
23 Škríba A et al: Front Microbiol 9, 2356 (2018).
24 Novák J et al: J Mass Spectrom 53, 1097 (2018).
25 Postawa Z et al: J Phys Chem B 108, 7831 (2004).
26 Kompauer M, Heiles S, Spengler B: Nat Methods 14, 90 (2017).
27 Kompauer M, Heiles S, Spengler B: Nat Methods 14, 1156 (2017).
28 Ievlev AV et al: Anal Chem 90, 3475 (2018).
29 Somnath S et al: Nanoscale 9, 5708 (2017).
MALDI, MS Imaging
ZaměřeníVýrobceSouhrn
Význam tématu
Zobrazovací hmotnostní spektrometrie (MSI) je klíčová technika pro prostorovou lokalizaci biomolekul na ploše tkání a materiálů bez nutnosti značení. Díky schopnosti detekovat proteiny, peptidy, lipidy i malé metabolity přináší nové možnosti v diagnostice onemocnění, studiu farmakokinetiky léčiv a základním i aplikovaném výzkumu.
Cíle a přehled článku
Článek shrnuje historický vývoj IMS a MSI od SIMS z roku 1962 po moderní konfigurace MALDI-MSI, SIMS-MSI a LA-ICP-MSI. Diskutuje přípravu vzorků, různé ionizační modality a analyzátory i vybrané aplikace v biologii a materiálových vědách.
Použitá metodika a instrumentace
MSI pracuje zpravidla rastrovacím principem, kde jednotlivé pixely odpovídají spektrům získaným desorpcí a ionizací. Klíčové modality zahrnují
- MALDI-MSI – laserová desorpce/ionizace za přítomnosti matrice, kompatibilní s TOF a FTICR analyzátory
- SIMS-MSI – sekundární iontová spektrometrie pro submikrometrické rozlišení
- LA-ICP-MSI – laserová ablace s ICP-TOF pro sledování kovů v materiálech
- Alternativní techniky – DESI, LAESI, ESI, NALDI bez potřeby klasické matrice
Hlavní výsledky a diskuse
Porovnání analyzátorů ukazuje:
- MALDI-TOF – hmotnostní rozsah nad 100 kTh, laterální rozlišení 3–20 µm
- MALDI-FTICR – hmotnostní rozlišení až 106
- SIMS-TOF – rozlišení pod 1 µm, vzorkovací hloubka 0,01 µm
- LA-ICP-TOF – sledování kovů s hloubkou odběru kolem 10 µm
Přínosy a praktické využití metody
MSI přináší
- Label-free mapování biomarkerů
- Analýzu distribuce léčiv a jejich metabolitů
- Subcelulární rozlišení u materiálových i biologických vzorků
- Možnost retrospektivní studie archivních tkání
- Integraci s histologickým a mikroskopickým hodnocením
Budoucí trendy a možnosti využití
Rozvoj submikrometrických technik (AFM-MSI), rychlejších laserů, pokročilé post-ionizace, automatické datové fúze a strojového učení pro interpretaci rozsáhlých datasetů otevře cestu k průmyslovým a klinickým aplikacím v personalizované medicíně.
Závěr
Zobrazovací hmotnostní spektrometrie se rychle vyvíjí a prosazuje jako nezastupitelná metoda pro chemickou vizualizaci v biologii i materiálových vědách. Díky pokračujícím technologickým inovacím a multimodálnímu přístupu lze očekávat rozšířené využití v diagnostice, farmacii a pokročilém výzkumu.
Reference
1 Castaing R, Slodzian G: C R Acad Sci 255, 1893 (1962).
2 Caprioli RM: US Patent US5808300A (1998).
3 Spengler B, Hubert M, Kaufmann R: Proc 42nd Am Soc Mass Spectr, p 1041 (1994).
4 Vidová V, Volný M, Lemr K, Havlíček V: Collect Czech Chem Commun 74, 1101 (2009).
5 Pól J, Strohalm M, Havlíček V, Volný M: Histochem Cell Biol 134, 423 (2010).
6 Ellis SR, Soltwisch J, Paine MRL, Dreisewerd K, Heeren RMA: Chem Commun 53, 7246 (2017).
7 Deutskens F, Yang JH, Caprioli RM: J Mass Spectrom 46, 568 (2011).
8 Dreisewerd K, Yew JY: Nat Methods 14, 1139 (2017).
9 Schober Y, Guenther S, Spengler B, Rompp A: Anal Chem 84, 6293 (2012).
10 Casadonte R, Caprioli RM: Nat Protoc 6, 1695 (2011).
11 Balluff B, Schone C, Hofler H, Walch A: Histochem Cell Biol 136, 227 (2011).
12 Greer T, Sturm R, Li LJ: J Proteomics 74, 2617 (2011).
13 Cassat JE et al: Sci Transl Med 10, eaan6361 (2018).
14 Pól J et al: Anal Chem 81, 8479 (2009).
15 Vidová V et al: Anal Chem 82, 4994 (2010).
16 Vidová V et al: J Lipid Res 51, 2295 (2010).
17 Pól J et al: PLoS One 6, e19441 (2011).
18 Strohalm M et al: Anal Chem 83, 5458 (2011).
19 Niehaus M et al: Nat Methods 16, 925 (2019).
20 Luptáková D et al: Sci Rep 8, 6952 (2018).
21 Luptáková D et al: Sci Rep 7, 16523 (2017).
22 Novák J et al: Biochim Biophys Acta Proteins Proteomics 1865, 768 (2017).
23 Škríba A et al: Front Microbiol 9, 2356 (2018).
24 Novák J et al: J Mass Spectrom 53, 1097 (2018).
25 Postawa Z et al: J Phys Chem B 108, 7831 (2004).
26 Kompauer M, Heiles S, Spengler B: Nat Methods 14, 90 (2017).
27 Kompauer M, Heiles S, Spengler B: Nat Methods 14, 1156 (2017).
28 Ievlev AV et al: Anal Chem 90, 3475 (2018).
29 Somnath S et al: Nanoscale 9, 5708 (2017).
Podobná PDF
MALDI ZOBRAZOVACÍ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE PRO STUDIUM FYZIOLOGICKÝCH POCHODŮ V NÁDORECH
2016||Vědecké články
Chem. Listy 110, 106111(2016) Referát MALDI ZOBRAZOVACÍ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE PRO STUDIUM FYZIOLOGICKÝCH POCHODŮ V NÁDORECH ROMAN GURÁŇa,b, ONDŘEJ ZÍTKAa,b, MIGUEL ANGEL MERLOS RODRIGOa,b, VOJTĚCH ADAMa,b a RENÉ KIZEKa,b vá stále více výzkumných týmů. Zároveň dochází k vývoji instrumentace, např. ke…
Klíčová slova
maldi, maldinádorů, nádorůmsi, msistudium, studiumspojení, spojenílaserová, laserováhmotnostní, hmotnostnípro, proreferát, referátbyla, bylaspektrometrie, spektrometrieprsu, prsusklíčka, sklíčkaablace, ablacebiliverdin
ÚVOD DO TANDEMOVÉ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE
2020||Vědecké články
Chem. Listy 114, 133−144 (2020) Referát ÚVOD DO TANDEMOVÉ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE Martin Sadílek 1. Úvod a definice University of Washington, Seattle, WA 98195-1700, Spojené státy americké [email protected] Lidová moudrost, že „ve dvou se to lépe táhne“, platí i v oblasti…
Klíčová slova
iontů, iontůhmotnostní, hmotnostníaktivaci, aktivacireferát, referátths, thselektronu, elektronupro, prodisociace, disociaceenergie, energienízký, nízkýaktivace, aktivaceenergií, energiíprostoru, prostoruhmotnostních, hmotnostníchrozpady
HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE V TOXIKOLOGII A FORENZNÍ ANALÝZE
2020||Vědecké články
Chem. Listy 114, 220−224 (2020) Referát HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE V TOXIKOLOGII A FORENZNÍ ANALÝZE Tomáš Pluháček a Vladimír Havlíček na jater, ledvin, mozku, sleziny apod.). V těchto biologických matricích se může jednat o analýzu endogenních látek (např. kyseliny 3-hydroxybutanové mající příčinnou…
Klíčová slova
hmotnostní, hmotnostníanalýze, analýzeskríning, skríningpoměrů, poměrůreferát, referátanalýza, analýzaanalytů, analytůspektrometrie, spektrometriehmotnostních, hmotnostníchisotopových, isotopovýchlátek, látekvyužívá, využívánecílený, necílenýanalýzy, analýzytoxikologické
HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE NÁMELOVÝCH ALKALOIDŮ
1998||Vědecké články
Chem. Listy 92, 538 - 547 (1998) HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE NÁMELOVÝCH ALKALOIDŮ 1. Uvod PETR HALADA3, ALEXANDR JEGOROV b , MIROSLAV RYSKAC a VLADIMÍR HAVLÍČEK 3 Námelové alkaloidy představují skupinu přírodních látek se širokým spektrem biologických aktivit podmíněných interakcí s různými…
Klíčová slova
alkaloidy, alkaloidyalkaloidů, alkaloidůnámelové, námelovénámelových, námelovýchspektrech, spektrechpři, přiionizací, ionizacíjsou, jsouionty, iontypředevším, předevšímstruktur, strukturdosud, dosudpřírodních, přírodníchergoliny, ergolinyergopeptinů