LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

NIST26 FREE Demonstration (Demo) Copy of MS/MS Integrated Processing

Prezentace | 2026 | James Little/Mass Spec Interpretation ServicesInstrumentace
Software, LC/MS, LC/MS/MS
Zaměření
Ostatní
Výrobce
Wiley

Souhrn

Význam tématu


Integrované zpracování MS/MS spekter s dekonvolucí a zároveň propojeným vyhledáváním v knihovnách zásadně zvyšuje rychlost a spolehlivost identifikace látek v analytické praxi. Spojení kvalitně kurátovaných knihoven (NIST) s rozsáhlými veřejnými sbírkami (MoNA, MS-DIAL) a možností zpracování LC-MS/MS i EI GC-MS signálů pomáhá laboratořím v rychlém screeningovém i konfirmativním režimu, snižuje potřebu manuální intervence a zlepšuje odhalování složitých matric a nízkoabundantních složek.

Cíle a přehled demonstrace


Demo popisuje plně funkční ukázkovou (Demo) kopii NIST26 s integrovanou dekonvolucí a vyhledáváním v knihovnách pro EI GC-MS i LC-MS/MS. Hlavními cíli jsou:
  • předvést nové integrované funkce NIST26 pro zpracování a vyhledávání MS/MS;
  • poskytnout instalační a provozní postupy pro práci s demo knihovnami a testovacími soubory;
  • ukázat doplnění NIST knihovny veřejnými databázemi pro širší pokrytí sloučenin.

Použitá metodika


Demonstrace kombinuje několik vrstev zpracování dat a testovacích datových sad:
  • Plně funkční demo verze NIST26 s integrovanou dekonvolucí a knihovním vyhledáváním (dostupná k volnému stažení od NIST, předpoklad dostupnosti v červnu 2026).
  • Demo knihovna NIST obsahující 26 sloučenin a cca 830 asociovaných MS/MS spekter pro ukázkové testy.
  • Testovací datové soubory – dvě sady obsahující vzorky v pozitivním a negativním režimu, včetně souborů ve formátu mzML (3 dodatečné běžně dostupné sloučeniny poskytnuté autorem).
  • Možnost nasazení třech veřejných knihoven (exportovaných do NIST formátu) obsahujících celkem přes 520 000 MS/MS spekter a více než 150 000 struktur převzatých z MoNA a MS-DIAL.
  • Postup instalace: stažení demo softwaru z webu NIST, umístění testovacích souborů do předepsané složky NIST Test Files, umístění demo a veřejných knihoven do adresáře Demo.

Použitá instrumentace


V demonstraci a souvisejícím kurzu jsou relevantní tyto nástroje a formáty:
  • Software: NIST26 s novou integrovanou dekonvolucí a knihovním vyhledáváním.
  • Mikrosystémy: platformy pro EI GC-MS (electron ionization gas chromatography–mass spectrometry) a LC-MS/MS (liquid chromatography tandem mass spectrometry).
  • Datové formáty: nativní formáty NIST, MSP (MS-DIAL), mzML (open standard pro hromadění dat), SDF pro připojené struktury.
  • Veřejné zdroje spekter: MassBank of North America (MoNA), MS-DIAL MSP kolekce.

Hlavní výsledky a diskuse


Demoverze a materiály ukazují následující poznatky:
  • NIST26 (2026) je rozsáhlá, kurátorská a strukturálně navázaná knihovna; NIST uvádí přibližně 68 635 unikátních sloučenin a kolem 3,2 milionu spekter v celkové NIST databázi.
  • Veřejné kolekce (MoNA, MS-DIAL) přinášejí značné rozšíření pokrytí sloučenin (>150 000 struktur a >520 000 spekter ve zpřístupněných souborech), avšak často s nižší úrovní kurace a bez přímého připojení ke strukturám v některých výstupech.
  • MS-DIAL MSP kolekce může obsahovat velké množství unikátních položek, avšak variabilita počtu unikátních sloučenin závisí na tom, které knihovny jsou zahrnuty a jak se řeší duplicity.
  • Integrovaná dekonvoluce umožní zlepšit detekci nízkoabundantních komponent a zlepšit kvalitu shod v knihovných vyhledáváních, zvláště v komplexních biologických či environmentálních matricích.
  • Praktická rada z demonstrace: vyhledávat paralelně v NIST i v dostupných veřejných knihovnách, protože kombinace zvyšuje šanci na identifikaci sloučenin, které ve standardní NIST databázi chybí.

Přínosy a praktické využití metody


Hlavní přínosy integrovaného přístupu jsou:
  • rychlejší a konzistentnější identifikace látek díky automatizované dekonvoluci a přímému porovnání se spektrálními knihovnami;
  • možnost širšího pokrytí sloučenin díky zapojení veřejných databází vedle kurátorské NIST knihovny;
  • snížení potřeby manuální kontroly signálu u jasných shod, při zachování možnosti manuální verifikace pro kritické případy;
  • uplatnění v rutinním screeningu, forenzní analýze, environmentálních studiích, metabolomice a farmaceutické QC/QA.

Budoucí trendy a možnosti využití


Očekávané směry rozvoje a praktické možnosti implementace:
  • další rozšiřování a standardizace veřejných sbírek spekter a lepší provázání strukturálních dat se spektry;
  • vylepšení algoritmů dekonvoluce a strojového učení pro robustnější rozlišení překrývajících se signálů a lepší predikci shod;
  • integrace více formátů a lepší interoperabilita mezi NIST, MoNA, MS-DIAL a dalšími zdroji;
  • rozvoj hybridních vyhledávacích strategií kombinujících expertní pravidla, předpovědi fragmentace a čisté spektrální shody pro vyšší spolehlivost identifikací;
  • zvýšené využití v rychlých screeningových pracovištích a centralizovaných databázových službách nabízejících aktualizace knihoven v reálném čase.

Závěr


Demo NIST26 s integrovanou dekonvolucí a vyhledáváním představuje užitečný nástroj pro zrychlení a zvýšení spolehlivosti identifikací v MS analytice. Kombinace kurátorské kvality NIST s rozsahem veřejných knihoven dává laboratořím praktickou cestu, jak rozšířit pokrytí sloučenin při zachování vysoké kvality výsledků. Doporučení z demonstrace zahrnují paralelní vyhledávání ve více knihovnách, správné umístění testovacích souborů podle instalačního návodu a využití otevřených formátů (mzML, MSP) pro interoperabilitu.

Reference


  • National Institute of Standards and Technology. NIST Mass Spectral Library (NIST26). 2026.
  • MassBank of North America (MoNA). Public MS/MS spectral database. 2026.
  • MS-DIAL Project. MS-DIAL MSP libraries (verze 19). 2026.
  • Little J. NIST26 FREE Demonstration (Demo) Copy of MS/MS Integrated Processing. Mass Spec Interpretation Services. April 25, 2026. mzinterpretation.com.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
Creating and Using Free Public and User Libraries in NIST26 Chromatogram and Lib Search
Creating and Using Free Public and User Libraries in NIST26 Chromatogram and Lib Search Video/Handout James Little Mass Spec Interpretation Services April 25, 2026 mzinterpretation.com See Full Course on NIST26 with new Integrated Deconvolution/Library Searching for EI GC-MS and LC-MS/MS!…
Klíčová slova
libraries, librariesnist, nistpublic, publiclibrary, librarytolerances, tolerancesstructures, structuresfree, freesuggested, suggestedformat, formatresolution, resolutionsearches, searcheshandout, handoutbest, bestlib, libspectra
LC/MS Unknown Identifications Using MSMS Libraries Part VII: Using and Creating Other MSMS Libraries
LC/MS Unknown Identifications Using MSMS Libraries Part VII: Using and Creating Other MSMS Libraries 12/27/20 James Little [email protected] https://littlemsandsailing.wordpress.com/ Kingsport, TN Retired* Research Fellow, Eastman Chem. Co. 42 years experience unknown identification Now Consultant, MS Interpretation Services Specialties1 EI GC-MS,…
Klíčová slova
msms, msmslibrary, librarynist, nistlibraries, librarieslmb, lmbmona, monasearch, searchentries, entriesuser, userspectrum, spectrumeastman, eastmanmsp, mspformat, formatsearches, searchesstructure
Processing MS/MS Data in NIST26 Chromatogram Window
Processing MS/MS Data in NIST26 Chromatogram Window Video/Handout James Little Mass Spec Interpretation Services April 24, 2026 mzinterpretation.com See Full Course on NIST26 with new Integrated Deconvolution/Library Searching for EI GC-MS and LC-MS/MS! Important Skills ➢ Assume familiar with configuring…
Klíčová slova
video, videomenu, menuclick, clickscores, scoreschromatogram, chromatogramhandout, handoutwindow, windowctrl, ctrllist, listbox, boxkeyboard, keyboardentries, entriessearch, searchxic, xicuseful
Identifications Folder: Raw Files Created in MS/MS NIST26
Identifications Folder: Raw Files Created in MS/MS NIST26 Video/Handout James Little Mass Spec Interpretation Services April 24, 2026 mzinterpretation.com See Full Course on NIST26 with new Integrated Deconvolution/Library Searching for EI GC-MS and LC-MS/MS! Identifications Folder in LC-MS/MS Chromatogram Window…
Klíčová slova
chatgpt, chatgptchromatogram, chromatogramfiles, filesformally, formallyhandout, handoutcreated, createdwindow, windowlibrary, libraryprompt, promptoutlier, outlierhierarchical, hierarchicaljames, jamesclustering, clusteringexplain, explainfolder
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
FacebookX (Twitter)LinkedInYouTube
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.