Identification of Anthropogenic Compounds in Stream Waters Using Non- target Strategies by HRMS
Postery | 2024 | Agilent Technologies | ASMSInstrumentace
Antropogenní sloučeniny ve vodních tocích představují riziko pro ekosystémy i lidské zdraví. Jejich stopové množství komplikovaně sleduje tradiční cílená analýza. Použití nedefinovaných (non-target) strategií s vysokým rozlišením hmotové spektrometrie (HRMS) umožňuje široké zmapování potenciálních kontaminantů bez předchozích analytických standardů.
Studie mapovala výskyt antropogenních látek v povrchových vodách Velkého Thompsona (Colorado) na šesti lokalitách od pramene až po oblasti ovlivněné antropogenní činností. Hlavním cílem bylo porovnat kontrolní (pristine) a ovlivněné lokality, identifikovat maximální počet sloučenin a vyhodnotit změny koncentrací.
Vzorky (100 mL) byly extrahovány na Oasis HLB kazetách pomocí automatické SPE (Gilson GX-271 ASPEC), eluovány metanolem, koncentrovány na 0,5 mL a injikovány (20 µL) na LC/Q-TOF MS.
Pro zpracování dat se použily: Agilent MassHunter Explorer (non-target extrakce), ChemVista Library Manager (in-house spektrální knihovny), NIST Tandem MS/MS (2023), SIRIUS a CSI:FingerID pro generování struktur a sumárních vzorců.
LOESS normalizací bylo ve 5487 detekovaných sloučeninách nalezeno 294 látek s >10násobným nárůstem koncentrace v dolních úsecích (p<0,05). Principiální rozdíl potvrdila analýza PCA.
Non-target přístup umožňuje rozsáhlé monitorování jak známých, tak neočekávaných kontaminantů v povrchových vodách. Kombinace více databází a nástrojů zvyšuje míru identifikace a podporuje environmentální monitoring a správu kvality vod.
Integrace strojového učení pro automatickou interpretaci fragmentačních dat, rozšíření spektrálních knihoven a aplikace nedefinovaných strategií v reálném čase pro včasné varování v enviromentálních sítích.
Výzkum potvrdil efektivitu non-target HRMS metody v detekci antropogenních sloučenin v povrchových vodách. Kombinované přístupy identifikace zvýšily spolehlivost detekce, avšak značná část látek stále vyžaduje manuální verifikaci fragmentů.
Software, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/TOF
ZaměřeníŽivotní prostředí
VýrobceAgilent Technologies
Souhrn
Význam tématu
Antropogenní sloučeniny ve vodních tocích představují riziko pro ekosystémy i lidské zdraví. Jejich stopové množství komplikovaně sleduje tradiční cílená analýza. Použití nedefinovaných (non-target) strategií s vysokým rozlišením hmotové spektrometrie (HRMS) umožňuje široké zmapování potenciálních kontaminantů bez předchozích analytických standardů.
Cíle a přehled studie / článku
Studie mapovala výskyt antropogenních látek v povrchových vodách Velkého Thompsona (Colorado) na šesti lokalitách od pramene až po oblasti ovlivněné antropogenní činností. Hlavním cílem bylo porovnat kontrolní (pristine) a ovlivněné lokality, identifikovat maximální počet sloučenin a vyhodnotit změny koncentrací.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky (100 mL) byly extrahovány na Oasis HLB kazetách pomocí automatické SPE (Gilson GX-271 ASPEC), eluovány metanolem, koncentrovány na 0,5 mL a injikovány (20 µL) na LC/Q-TOF MS.
- Chromatografie: reverzní fáze (C8 kolona).
- Spektrometrie: Agilent 1290 Infinity II LC spojený s 6546 LC/Q-TOF MS, pozitivní ESI, data-nezávislá i iterativní MS/MS.
Pro zpracování dat se použily: Agilent MassHunter Explorer (non-target extrakce), ChemVista Library Manager (in-house spektrální knihovny), NIST Tandem MS/MS (2023), SIRIUS a CSI:FingerID pro generování struktur a sumárních vzorců.
Hlavní výsledky a diskuse
LOESS normalizací bylo ve 5487 detekovaných sloučeninách nalezeno 294 látek s >10násobným nárůstem koncentrace v dolních úsecích (p<0,05). Principiální rozdíl potvrdila analýza PCA.
- 27 sloučenin bylo potvrzeno s retenčním časem a MS/MS z in-house knihoven.
- 22 dalších sloučenin identifikováno pomocí NIST MS/MS.
- SIRIUS & CSI:FingerID ověřily shodu struktur a poskytly sumární vzorce pro neznámé látky.
Přínosy a praktické využití metody
Non-target přístup umožňuje rozsáhlé monitorování jak známých, tak neočekávaných kontaminantů v povrchových vodách. Kombinace více databází a nástrojů zvyšuje míru identifikace a podporuje environmentální monitoring a správu kvality vod.
Budoucí trendy a možnosti využití
Integrace strojového učení pro automatickou interpretaci fragmentačních dat, rozšíření spektrálních knihoven a aplikace nedefinovaných strategií v reálném čase pro včasné varování v enviromentálních sítích.
Závěr
Výzkum potvrdil efektivitu non-target HRMS metody v detekci antropogenních sloučenin v povrchových vodách. Kombinované přístupy identifikace zvýšily spolehlivost detekce, avšak značná část látek stále vyžaduje manuální verifikaci fragmentů.
Reference
- Dührkop K., Fleischauer M., Ludwig M., et al. SIRIUS4: a rapid tool for turning tandem mass spectra into metabolite structure information. Nat Methods. 16 (2019).
- Dührkop K., Shen H., Meusel M., Rousu J., Böcker S. Searching molecular structure databases with tandem mass spectra using CSI:FingerID. Proc Natl Acad Sci U S A. 112 (2015).
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Drug Metabolite Identification with a Streamlined Software Workflow
2026|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Pharma & Biopharma Drug Metabolite Identification with a Streamlined Software Workflow Combining Agilent Revident Q-TOF LC/MS and MassHunter Explorer 2.0 Count vs. acquisition time (min) Authors Mark Sartain, Lee Bertram, Andrew McEachran, and James Pyke Agilent Technologies, Inc.…
Klíčová slova
verapamil, verapamilcounts, countsmetabolites, metabolitesclassical, classicaldatabase, databaseacquisition, acquisitionmasshunter, masshunterbiotransformations, biotransformationsnorverapamil, norverapamilsirius, siriusbiotransformer, biotransformerdesmethylverapamil, desmethylverapamilmetabolite, metaboliteinjection, injectioncustom
Streamlining HRMS data interpretation for wastewater impact on water quality
2023|Agilent Technologies|Postery
Streamlining HRMS data interpretation for wastewater impact on water quality E. Michael Thurman1, Imma Ferrer1, and James S. Pyke2 1University Novel aspect: Pharmaceuticals, pesticides, personal care products, and industrial substances such as PFAS, are emerging contaminants, which are an environmental…
Klíčová slova
loess, loessnormalization, normalizationpooledqc, pooledqcwastewater, wastewateriterative, iterativepca, pcarocky, rockydata, datastatistical, statisticalliterally, literallymountain, mountainmetabolites, metabolitestreatment, treatmentfind, findputatively
An End-to-End Untargeted LC/MS Workflow for Metabolomics and Lipidomics
2025|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Life Science Research An End-to-End Untargeted LC/MS Workflow for Metabolomics and Lipidomics Authors Sierra D. Durham, Karen E. Yannell, Cate Simmermaker, Genevieve Van de Bittner, Lee Bertram, Daniel Cuthbertson, and Chris Klein Agilent Technologies, Inc. Abstract Untargeted metabolomics…
Klíčová slova
revident, revidentmetabolomics, metabolomicslipid, lipidmasshunter, masshunteragilent, agilentlipidomics, lipidomicsiterative, iterativetof, tofannotator, annotatorchemvista, chemvistaexplorer, explorercustom, customworkflow, workflowmetabolite, metaboliteuntargeted
Workflow for Authenticity Testing of Plant Extract Using Revident LC/Q‑TOF and MassHunter Explorer
2026|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Food Authenticity Workflow for Authenticity Testing of Plant Extract Using Revident LC/Q‑TOF and MassHunter Explorer Authors Abstract Megan Laryea-Akrong and Siheng Li doTERRA International, LLC, Pleasant Grove, UT, USA Interest in food authenticity testing is growing rapidly across…
Klíčová slova
lavender, lavenderauthentic, authenticexplorer, exploreroil, oiladulterated, adulteratedpca, pcaessential, essentialbatches, batchesclustering, clusteringfrom, fromsamples, samplesauthenticity, authenticityorigin, origindifferences, differencesadulterants