LCMS
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.

MALDI Imaging of 13C6-Glucose Uptake Measured in TCA Metabolites from Glioblastoma Mouse Brain

Postery | 2023 | Bruker | ASMSInstrumentace
MALDI, MS Imaging, Iontová mobilita, LC/MS/MS, LC/HRMS, LC/MS, LC/TOF
Zaměření
Metabolomika, Klinická analýza
Výrobce
Bruker

Souhrn

Význam tématu


Studium metabolického toku glukózy v glioblastomu je klíčové pro pochopení Warburgova efektu a intracerebrální heterogenity nádorové tkáně. Prostorové mapování inkorporace 13C-glukózy do TCA cyklu umožňuje detailní analýzu rozdílů mezi zdravou a nádorovou oblastí v rámci jednoho vzorku.

Cíle a přehled studie


Cílem bylo vizualizovat a kvantifikovat přijetí 13C6-glukózy do TCA metabolitů v myším modelu glioblastomu s pacientskými xenografty. Studie porovnala zdravé a nádorové oblasti mozku po intraperitoneální aplikaci štěpného 13C-glukózového trapače a demonstrovala schopnost MALDI Imagingu rozlišit tyto oblasti.

Použitá metodika


Mladé myši s PDX glioblastomem dostaly 13C6-glukózu v časech 0 a 30 minut před obětováním v 60. minutě. Mozkové řezy byly potaženy NEDC matricí a analyzovány MALDI-2 metodou v negativním ionovém módu s 20 µm rozlišením. Data byla segmentována v SCiLS Lab a anotována v MetaboScape. Pomocí R skriptu a SCiLS REST API byly vypočteny relativní izotopové zastoupení M+0 až M+n.

Použitá instrumentace


  • MALDI-2 spektrometr timsTOF fleX (Bruker)
  • HTX M3+ sprayer pro nanášení matric
  • Software SCiLS Lab 2023a pro segmentaci image dat
  • MetaboScape 2023a pro anotaci
  • R a SCiLS REST API pro izotopovou kvantifikaci

Hlavní výsledky a diskuse


Segmentační analýza jasně oddělila zdravou a nádorovou tkáň a rovněž ošetřená vs. kontrolní zvířata. Ion images pro M+0 až M+4 izotopologové ukázaly rozdílné profily inkorporace 13C mezi oblastmi. Nádorová tkáň vykazovala změněné rozložení TCA metabolitů, což potvrdily i ROC křivky a PCA analýza. Výsledky byly v souladu s komplementárními LC-MS měřeními.

Přínosy a praktické využití metody


Metoda umožňuje prostorové měření metabolického toku štěpných izotopů přímo v tkáňových řezech, což je cenné pro výzkum intratumorální heterogenity, hodnocení účinků terapeutik a vývoj nových diagnostických a výzkumných postupů.

Budoucí trendy a možnosti využití


Další rozvoj zahrnuje aplikaci na různé typy nádorů, kombinaci s jinými omickými technologiemi, zdokonalení softwarové analýzy pomocí umělé inteligence a možnou translaci do preklinických i klinických studií.

Závěr


Ukázalo se, že MALDI Imaging s použitím 13C6-glukózy je efektivní nástroj pro prostorové sledování TCA metabolitů v glioblastomovém modelu. Metodika otevírá nové možnosti pro detailní studium metabolických drah v nemocné tkáni.

Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.

PDF verze ke stažení a čtení
 

Podobná PDF

Toggle
Tumor heterogeneity of glioblastoma analyzed via SpatialOMx and HiPLEX-IHC MALDI Imaging
ASMS 2023 Tumor heterogeneity of glioblastoma analyzed via SpatialOMx and HiPLEX-IHC MALDI Imaging Corinna Henkel1, Signe Frost Frederiksen1, Matthias Szesny1, Jörg Bartsch2, Katherine Stumpo3, Melanie Föll4, Oliver Schilling4 1Bruker Daltonics GmbH & Co.KG, 28359 Bremen, Germany 2Department of Neurosurgery/Lab, Faculty…
Klíčová slova
hiplex, hiplexihc, ihcmaldi, malditumor, tumorimaging, imagingglioblastoma, glioblastomaheterogeneity, heterogeneityspatialomx, spatialomxmicroenvironment, microenvironmentlipid, lipidastrocytoma, astrocytomagbm, gbmspecific, specifictissue, tissuecells
Enhanced tissue compartmentalization by applying segmentation algorithms on reduced spatial omics data
LI F E S CI E N CE S M AS S S P E CTR O M E TR Y Enhanced tissue compartmentalization by applying segmentation algorithms on reduced spatial omics data SCiLS Lab data set Bram Heijs1, Ryan…
Klíčová slova
segmentation, segmentationscores, scoresclustering, clusteringumap, umapmaldi, maldiintensities, intensitieshaematoxylin, haematoxylinimaging, imagingeosin, eosinfeature, featuremeans, meansspatial, spatialdenoising, denoisingleiden, leidenhistology
Integrated annotation pipeline using in-silico prediction for on-target chemical derivatization MALDI Imaging
LI F E S CI E N CE S M AS S S P E CTR O M E TR Y Integrated annotation pipeline using in-silico prediction for on-target chemical derivatization MALDI Imaging Arne Behrens1, Nikolas Kessler1, Sofie Weinkouff1, Bram…
Klíčová slova
derivatization, derivatizationannotation, annotationsilico, silicoccs, ccstarget, targetmetaboscape, metaboscapestructure, structurereaction, reactionsite, sitemaldi, maldiprediction, predictioncarboxy, carboxyagents, agentsimaging, imagingpipeline
Bruker MRMS Applications Handbook
Bruker MRMS Applications Handbook
2020|Bruker|Příručky
MRMS Applications Handbook Cutting-Edge Research in MALDI Imaging, Metabolomics/Phenomics, Native MS and Petroleomics Innovation with Integrity MRMS Dear Mass Spec Customer, Thank you for your interest in Bruker's scimaX® and solariX-series instruments. Powered by MRMS (Magnetic Resonance Mass Spectrometry), this…
Klíčová slova
maldi, maldiimaging, imagingmrms, mrmsbruker, brukermass, masssolarix, solarixmolecular, molecularwere, werespectrometry, spectrometrytissue, tissuedaltonics, daltonicsreserves, reservescontinually, continuallymetabolites, metabolitescrude
Další projekty
GCMS
ICPMS
Sledujte nás
FacebookX (Twitter)LinkedInYouTube
Další informace
WebinářeO násKontaktujte násPodmínky užití
LabRulez s.r.o. Všechna práva vyhrazena. Obsah dostupný pod licencí CC BY-SA 4.0 Uveďte původ-Zachovejte licenci.