Mnova Gears – MS Scan (Starting Guide)

Význam tématu

Analýza LC MS dat v metabolomice a kvantifikace iontů v retenčních oknech je klíčová, ale složitá v běžném softwaru dodavatelů. MS Scan plugin pro Mnova Gears automatizuje extrakci spekter a chromatogramů z TIC souborů.

Cíle a přehled článku

Poskytnout podrobný návod k nastavení a provozu pluginu MS Scan ve workflow Mnova Gears. Ukázat hlavní kroky od výběru vstupních dat až po zpracování a vizualizaci výsledků.

Použitá metodika a instrumentace

• Vstupní data: TIC soubory z LC MS
• Software a plugin: Mnova Gears s MS Scan
• Workflow: pět kroků Input, Processing, Plugins, Design, Output

Hlavní výsledky a diskuse

• Automatická detekce a filtrování experimentů podle masky souborů
• Definice retenčních intervalů a prahů intenzity pro extrakci spekter
• Vygenerování CSV a HTML sestav s m/z, RT, relativní plochou a výškou píků
• Interaktivní kontrola a úprava výsledků v Mgears Viewer

Přínosy a praktické využití metody

• Rychlá a spolehlivá kvantifikace iontů ve velkých datech
• Automatizace opakujících se analýz s minimálním zásahem operátora
• Možnost exportu výsledků do CSV, HTML, PDF nebo do databáze

Budoucí trendy a možnosti využití

• Rozšíření pluginu o zpětné spouštění analýz a dynamickou kalibraci
• Integrace s dalšími analytickými platformami a pokročilými databázemi
• Využití strojového učení pro automatickou identifikaci významných signálů a eliminaci šumu

Závěr

MS Scan plugin nabízí efektivní a flexibilní řešení pro extrakci a kvantifikaci LC MS dat v Mnova Gears. Díky konfigurovatelným parametrům, automatizovanému reportingu a přímé kontrole v Mgears Viewer se výrazně urychluje práce s rozsáhlými metabolomickými datasetem.

Reference

• Uživatelská příručka Mnova Gears