EVALUATION OF SEMI-TARGETED AND NON-TARGETED (‘DISCOVERY’) SCREENING TOOLS
Postery | 2023 | WatersInstrumentace
Analýza nových psychoaktivních látek představuje pro toxikologické laboratoře výraznou výzvu vzhledem k dynamickému výskytu dosud neznámých sloučenin. Vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie (HRMS), zejména technika TOF-MSE, umožňuje sběr neomezených dat pro cílené i necílené screeningové přístupy a poskytuje možnost zpětné analýzy.
Tato práce hodnotí tři přístupy k toxikologickému screeningu:
Pro screenování bylo nasazeno řešení Waters Forensic Toxicology Screening Application Solution sestávající z:
Analyzováno bylo 17 pitevních krevních vzorků. Spektra se sbírala současně při nízké energii (přesná hmotnost prekurzoru) a vysoké energii (fragmentační ionty). Data se zpracovávala automatizovaně:
Cílený screening odhalil 138 látek (74 toxikologicky relevantních), z toho 93 % detekcí potvrzeno alespoň jedním fragmentem, 83 % dvěma a 54 % třemi fragmenty. Semi-cílená metoda potvrdila 122 z 138 dříve detekovaných látek (88 %) pomocí teoretických fragmentů a přidala navíc tři další látky. Necílená analýza validovala 85 % z původní sady 138 elektrolytů a prokázala svou schopnost nezávislého potvrzení.
Automatizované semi-cílené a necílené workflow významně zvyšují spolehlivost a rozsah toxikologického screeningu. Semi-cílená analýza umožňuje potvrzení látek bez referenčního standardu a poskytuje vyšší specifitu díky teoreticky generovaným fragmentům. Discovery nástroj šetří čas při identifikaci nových sloučenin a rozšiřuje možnosti retrospektivní analýzy.
Očekává se další rozšíření knihoven Molfile, vylepšení algoritmů in silico fragmentace a integrace strojového učení pro robustnější výběr kandidátů. Online propojování s globálními databázemi umožní rychlejší varování před novými psychoaktivními látkami a podpoří včasné zasahování.
Srovnání tří screeningových přístupů prokázalo, že kombinované použití cílené, semi-cílené a necílené analýzy na platformě TOF-MSE se UNIFI informatikou přináší vysokou spolehlivost, rozšířený rozsah detekce a efektivní identifikaci známých i nových psychoaktivních látek.
Wood M, Rosano TG. Evaluation of Semi-Targeted and Non-Targeted (‘Discovery’) Screening Tools. Waters Corporation; Albany Medical Center; National Toxicology Center.
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Analýza nových psychoaktivních látek představuje pro toxikologické laboratoře výraznou výzvu vzhledem k dynamickému výskytu dosud neznámých sloučenin. Vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie (HRMS), zejména technika TOF-MSE, umožňuje sběr neomezených dat pro cílené i necílené screeningové přístupy a poskytuje možnost zpětné analýzy.
Cíle studie
Tato práce hodnotí tři přístupy k toxikologickému screeningu:
- cílenou analýzu se srovnáním s standardní knihovnou,
- semi-cílenou analýzu založenou na in silico generovaných fragmentech z Molfile,
- necílenou („Discovery“) analýzu využívající automatizovaný návrh sumárních vzorců, externí vyhledávání a in silico fragmentaci.
Použitá instrumentace
Pro screenování bylo nasazeno řešení Waters Forensic Toxicology Screening Application Solution sestávající z:
- ACQUITY UPLC I-Class,
- XEVO G2-XS QTOF s TOF-MSE režimem,
- UNIFI informatiky a toxikologické knihovny s více než 1300 záznamy (z nich 1250 doplněno o RT, diagnostické ionty a Molfile).
Metodika
Analyzováno bylo 17 pitevních krevních vzorků. Spektra se sbírala současně při nízké energii (přesná hmotnost prekurzoru) a vysoké energii (fragmentační ionty). Data se zpracovávala automatizovaně:
- Cílená analýza: porovnání dat s knihovnou podle RT ±0,35 min, přesnosti hmotnosti ±5 ppm, minimálně jednoho diagnostického fragmentu a prahového signálu 6000 counts.
- Semi-cílená analýza: automatická in silico fragmentace Molfile a porovnání teoretických fragmentů s vysokou energií (±2 mDa).
- Necílená („Discovery“) analýza: návrh až pěti sumárních vzorců, externí online vyhledávání v chemspider a dalších databázích, in silico fragmentace a automatické porovnání s experimentálními daty.
Hlavní výsledky a diskuse
Cílený screening odhalil 138 látek (74 toxikologicky relevantních), z toho 93 % detekcí potvrzeno alespoň jedním fragmentem, 83 % dvěma a 54 % třemi fragmenty. Semi-cílená metoda potvrdila 122 z 138 dříve detekovaných látek (88 %) pomocí teoretických fragmentů a přidala navíc tři další látky. Necílená analýza validovala 85 % z původní sady 138 elektrolytů a prokázala svou schopnost nezávislého potvrzení.
Přínosy a praktické využití metody
Automatizované semi-cílené a necílené workflow významně zvyšují spolehlivost a rozsah toxikologického screeningu. Semi-cílená analýza umožňuje potvrzení látek bez referenčního standardu a poskytuje vyšší specifitu díky teoreticky generovaným fragmentům. Discovery nástroj šetří čas při identifikaci nových sloučenin a rozšiřuje možnosti retrospektivní analýzy.
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se další rozšíření knihoven Molfile, vylepšení algoritmů in silico fragmentace a integrace strojového učení pro robustnější výběr kandidátů. Online propojování s globálními databázemi umožní rychlejší varování před novými psychoaktivními látkami a podpoří včasné zasahování.
Závěr
Srovnání tří screeningových přístupů prokázalo, že kombinované použití cílené, semi-cílené a necílené analýzy na platformě TOF-MSE se UNIFI informatikou přináší vysokou spolehlivost, rozšířený rozsah detekce a efektivní identifikaci známých i nových psychoaktivních látek.
Reference
Wood M, Rosano TG. Evaluation of Semi-Targeted and Non-Targeted (‘Discovery’) Screening Tools. Waters Corporation; Albany Medical Center; National Toxicology Center.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
EVALUATION OF SEMI-TARGETED AND NON-TARGETED (‘DISCOVERY’) SCREENING TOOLS Michelle Wood1 and Thomas G Rosano2,3 1 Waters Corporation, Wilmslow, UK; 2Albany Medical Center Hospital and College, Albany, NY, USA; 3National Toxicology Center, Albany, NY, USA molfile Noun (plural molfiles) (chemistry) Format…
Klíčová slova
targeted, targetedmolfile, molfilesemi, semiscreening, screeningmolfiles, molfilessilico, silicodiscovery, discoveryproposed, proposedtheoretical, theoreticalcomprising, comprisingsubstances, substancesacquired, acquiredoffice, officefews, fewswarning
Comprehensive Drug Screening for Forensic Toxicology
2023|Waters|Příručky
Comprehensive Drug Screening for Forensic Toxicology Overcome Evolving Toxicology Screening Challenges with High Resolution Mass Spectrometry (HRMS) CONTENTS Introduction: Challenges in Toxicology Screening........................................................................................................ 3 Benefits of HRMS and Accurate Mass................................................................................................................................... 4 A Complete Waters Solution.......................................................................................................................................................... 5 A Comprehensive Portfolio…
Klíčová slova
screening, screeningtoxicology, toxicologyforensic, forensicwaters, watersworkflows, workflowsdrug, drugchallenges, challengeshrms, hrmscomprehensive, comprehensivesupport, supportseized, seizedbenefits, benefitssolution, solutionnps, npsdrugs
Analysis of Plant Alkaloids Through Accurate Mass Screening and Discovery
2015|Waters|Aplikace
Analysis of Plant Alkaloids Through Accurate Mass Screening and Discovery Jeff Goshawk and Michelle Wood Waters Corporation, Wilmslow, UK A P P L I C AT I O N B E N E F I T S INT RODUC T…
Klíčová slova
alkaloids, alkaloidsplant, planthrough, hroughdiscovery, discoveryscreening, screeningunifi, unififragment, fragmenttoxicology, toxicologyaccurate, accuratemass, masssubmitted, submittedamygdalin, amygdalinlibrary, libraryenergy, energyuplc
Approaches to Non-targeted Analyses of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Environmental Samples
2021|Waters|Aplikace
Application Note Approaches to Non-targeted Analyses of Per- and Polyfluoroalkyl Substances (PFAS) in Environmental Samples Marian Twohig, Gordon Fujimoto, Aarthi Mohan, Kari L. Organtini, Kenneth J. Rosnack, Simon Hird Waters Corporation, University of Massachusetts Amherst Abstract Per- and polyfluoroalkyl substances…
Klíčová slova
pfas, pfaswastewater, wastewaterunifi, unifitargeted, targetedsearching, searchingsubstances, substancescompounds, compoundspolyfluoroalkyl, polyfluoroalkylsubclasses, subclassesloss, losscan, canpertaining, pertaininglibraries, librariespfass, pfasssoil