IMSC: Ultra-Fast Analysis of Allergens Using Capillary Electrophoresis Coupled to Mass Spectrometry and Ultra Violet Photodissociation
Postery | 2016 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
Ryby představují významný zdroj potravinových alergenů, především parvalbuminů, které mohou vyvolat závažné imunologické reakce u citlivých jedinců. Rychlá a spolehlivá detekce těchto proteinů v potravinových matricích je klíčová pro ochranu spotřebitelů a zajištění souladu s legislativními požadavky.
Hlavním cílem bylo vyvinout jednoduchou a rychlou dvoukrokovou strategii pro současnou identifikaci rybích alergenů a autenticitu druhů. Metoda kombinuje selektivní extrakci thermo-stabilních proteinů z muscle tissue vzorků ryb a jejich následnou analýzu technikou kapilární elektroforézy (CE) hyphenované s top-down hmotnostní spektrometrií (MS/MS).
Pro extrakci byly homogenizovány 1 g svaloviny, ze které se po centrifugaci a zahřátí na 70 °C izolovaly thermo-stabilní proteiny.
Analýzou CE-MS/MS byly detekovány a separovány β-parvalbuminy (~11 kDa), hlavní rybí alergeny, včetně isoform β1 a β2. Vznikly unikátní mapy hmotnosti vs. doby migrace pro každý alergen. Isoformy se oddělovaly během 10 min (cation-coated kapilára) nebo 30 min (neutral-coated kapilára). Top-down fragmentace poskytla až 86 % sekvenční pokrytí a <2 ppm chybovost měření. Dvě druhy hejků (Merluccius paradoxus a Merluccius merluccius) byly úspěšně charakterizovány a rozlišeny na základě detailní proteomické analýzy.
Metoda umožňuje rychlou a cílenou detekci rybích alergenů přímo ve zpracovaných potravinách a současně ověření druhu ryby. Vysoká přesnost a selektivita top-down přístupu dává základ pro vývoj miniaturizovaných CE-MS čipů pro rutinní QA/QC v potravinářském průmyslu.
Další rozvoj miniaturizovaných CE-MS systémů na bázi tzv. lab-on-a-chip zvýší propustnost a automatizaci analýz. Inovace ve fragmentačních zdrojích (rozšířené UVPD, AI-řízená dekonvoluce dat) posílí citlivost a přesnost identifikace alergenů i v komplexních směsích.
Vyvinutá strategie spojuje selektivní extrakci thermo-stabilních proteinů a top-down CE-MS/MS na Orbitrap Fusion Lumos s UVPD fragmentací pro rapidní a spolehlivou identifikaci rybích alergenů a autentizaci druhů. Metoda nabízí vysoké pokrytí sekvencí, nízkou chybovost a potenciál pro průmyslové nasazení.
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap, Kapilární elektroforéza
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Ryby představují významný zdroj potravinových alergenů, především parvalbuminů, které mohou vyvolat závažné imunologické reakce u citlivých jedinců. Rychlá a spolehlivá detekce těchto proteinů v potravinových matricích je klíčová pro ochranu spotřebitelů a zajištění souladu s legislativními požadavky.
Cíle a přehled studie
Hlavním cílem bylo vyvinout jednoduchou a rychlou dvoukrokovou strategii pro současnou identifikaci rybích alergenů a autenticitu druhů. Metoda kombinuje selektivní extrakci thermo-stabilních proteinů z muscle tissue vzorků ryb a jejich následnou analýzu technikou kapilární elektroforézy (CE) hyphenované s top-down hmotnostní spektrometrií (MS/MS).
Použitá metodika a instrumentace
Pro extrakci byly homogenizovány 1 g svaloviny, ze které se po centrifugaci a zahřátí na 70 °C izolovaly thermo-stabilní proteiny.
- Čištění proteinů: stage tips (C18).
- Separace: Agilent 7100 CE systém s cation-coated kapilárou (-30 kV) nebo neutral-coated kapilárou (+30 kV).
- Ionizace: nanoESI interfase se sheath liquid (methanol/voda/kyselina mravenčí) a vlastní ion source s elektro-osmotickým tokem.
- MS/MS: Orbitrap Fusion Lumos Tribrid mass spectrometer vybavený UVPD zdrojem; fragmentation modes: HCD, ETD, EThcD, UVPD (120 000 @ m/z 200).
- Analýza dat: Thermo Xcalibur 4.0, QualBrowser, ProSight Lite.
Hlavní výsledky a diskuse
Analýzou CE-MS/MS byly detekovány a separovány β-parvalbuminy (~11 kDa), hlavní rybí alergeny, včetně isoform β1 a β2. Vznikly unikátní mapy hmotnosti vs. doby migrace pro každý alergen. Isoformy se oddělovaly během 10 min (cation-coated kapilára) nebo 30 min (neutral-coated kapilára). Top-down fragmentace poskytla až 86 % sekvenční pokrytí a <2 ppm chybovost měření. Dvě druhy hejků (Merluccius paradoxus a Merluccius merluccius) byly úspěšně charakterizovány a rozlišeny na základě detailní proteomické analýzy.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda umožňuje rychlou a cílenou detekci rybích alergenů přímo ve zpracovaných potravinách a současně ověření druhu ryby. Vysoká přesnost a selektivita top-down přístupu dává základ pro vývoj miniaturizovaných CE-MS čipů pro rutinní QA/QC v potravinářském průmyslu.
Budoucí trendy a možnosti využití
Další rozvoj miniaturizovaných CE-MS systémů na bázi tzv. lab-on-a-chip zvýší propustnost a automatizaci analýz. Inovace ve fragmentačních zdrojích (rozšířené UVPD, AI-řízená dekonvoluce dat) posílí citlivost a přesnost identifikace alergenů i v komplexních směsích.
Závěr
Vyvinutá strategie spojuje selektivní extrakci thermo-stabilních proteinů a top-down CE-MS/MS na Orbitrap Fusion Lumos s UVPD fragmentací pro rapidní a spolehlivou identifikaci rybích alergenů a autentizaci druhů. Metoda nabízí vysoké pokrytí sekvencí, nízkou chybovost a potenciál pro průmyslové nasazení.
Reference
- CMP Scientific. Ion source pro CE-MS, CMP Scientific, Brooklyn, NY.
- Alcor Bioseparations LLC. Neutral-coated kapiláry, Alcor Bioseparations LLC, Palo Alto, CA.
- Carrera M., Canas B., Gallardo J.M. Rapid top-down proteomic analysis of fish muscle proteins. Journal of Proteomics 2012, 75:3211–3220.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
MSUM: NEW on Thermo Scientific Orbitrap Fusion Lumos Tribrid MS
2016|Thermo Fisher Scientific|Prezentace
NEW on Thermo Scientific™ Orbitrap Fusion™ Lumos™ Tribrid™ MS Stephane Houel, Ph.D. BioPharma Vertical Marketing The world leader in serving science NEW On Thermo Scientific Orbitrap Fusion Lumos MS in 2017 ADVANCED PEAK DETERMINATION ALGORITHM RESULTS IN SIGNIFICANT IMPROVEMENT IN…
Klíčová slova
uvpd, uvpdapd, apdcoverage, coverageunique, uniqueetd, etdexisting, existingnew, newsystems, systemstrap, traplumos, lumosoptional, optionalpeptide, peptideproteomics, proteomicsfragmentation, fragmentationdeamidated
Enhancing Ultraviolet Photodissociation Performance on a Thermo Scientific Orbitrap Fusion Lumos Tribrid Mass Spectrometer for Small Molecule and Protein Analysis
2018|Thermo Fisher Scientific|Postery
Enhancing Ultraviolet Photodissociation Performance on a Thermo Scientific Orbitrap Fusion Lumos Tribrid Mass Spectrometer for Small Molecule and Protein Analysis Dustin D. Holden, Jae C. Schwartz, Thermo Fisher Scientific, 355 River Oaks Parkway, San Jose, CA, USA, 95134 The laser…
Klíčová slova
lpt, lpttrapping, trappinguvpd, uvpdparking, parkinghalf, halflength, lengthflt, fltlife, lifelaser, laserfull, fullactivation, activationphotodissociation, photodissociationpulse, pulseubiquitin, ubiquitinrelative
Top-down Characterization of Monoclonal Antibody on an Orbitrap Fusion Lumos Tribrid Mass Spectrometer
2016|Thermo Fisher Scientific|Postery
Poster Note 64778 Top-down Characterization of Monoclonal Antibody on an Orbitrap Fusion Lumos™ Tribrid Mass Spectrometer Seema Sharma, Stephane Houel, Christopher Mullen, Chad Weisbrod, Romain Huguet, John Syka, Dave Horn, Jonathan Josephs, Jae Schwartz, Vlad Zabrouskov Thermo Fisher Scientific, San…
Klíčová slova
abundance, abundancefragmentation, fragmentationantibody, antibodyintact, intactetd, etdrelative, relativemab, mabtop, topdown, downheavy, heavydeglycosylated, deglycosylatedmonoclonal, monoclonaluvpd, uvpdpulses, pulsessequence
Optimizing Top Down Analysis of Proteins on Orbitrap Fusion Lumos Tribrid Mass Spectrometer
2015|Thermo Fisher Scientific|Postery
Methods Sample Preparation and Liquid Chromatography Protein standards (Ubiquitin, Carbonic anhydrase and Enolase) were purchased from Sigma Aldrich. Proteins were infused at 1pmol/ul at a flow rate 5ul/min for direct infusion experiments. Recombinant Human TROP2 protein (extracellular domain) was purchased…
Klíčová slova
etd, etdlumos, lumosorbitrap, orbitraptop, topdown, downfusion, fusionintact, intactfragmentation, fragmentationproteins, proteinsenolase, enolasecoverage, coveragesequence, sequenceprotein, proteinwere, werecarbonic