Comparison of the SYNAPT XS™ and SELECT SERIES™ Cyclic™ IMS for the Analysis of Human Urine
Technické články | 2022 | WatersInstrumentace
Metabolomické analýzy biologických vzorků, jako je lidská moč, jsou klíčové pro identifikaci biomarkerů v různých onemocněních. Vysoká schopnost separace a citlivost detekce umožňují odhalit i nízce zastoupené metabolity a zvyšují přesnost jejich identifikace.
Studie porovnává dva hyphenované systémy LC–iontové mobility–MS, SYNAPT XS a SELECT SERIES Cyclic IMS, s cílem zjistit jejich schopnost detekovat a anotovat metabolity v extraktu lidské moči.
Vzorek lidské moči byl ředěn vodou a acetonitrilem, protřesen a následně odstředěn. Separace probíhala na systému ACQUITY Premier UPLC s BEH Amide kolonnou při 40 °C a gradientním programu založeném na směsi acetonitril voda s formiátovými pufry. Oba MS přístroje pracovaly v pozitivním ESI režimu, Tof rozsah 50–1200 Da, režim HDMSE s kolizním napětím 20–40 eV. SELECT SERIES Cyclic IMS nabízí prodlouženou dráhu iontové mobility díky možnosti vícenásobných průchodů.
SELECT SERIES Cyclic IMS detekoval průměrně 3,5× více nízkoenergetických iontů než SYNAPT XS a umožnil zaregistrovat o 50 procent více peak-picked features. Mobilitní separace oddělila izobarické složky se stejnou m/z a retenční dobou, což vedlo k čistším fragmentačním spektrům. Při vyhledávání v databázi HMDB bylo možné anotovat o 944 metabolitů více než u dat ze SYNAPT XS.
Díky prodloužené dráze iontové mobility poskytuje SELECT SERIES Cyclic IMS výrazně vyšší kapacitu a kvalitu detekce než SYNAPT XS. Zvýšený počet detekovaných i anotovaných metabolitů zvyšuje přesnost biomarker discovery a rozšiřuje možnosti analytické chemie metabolomiky.
Iontová mobilita, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Metabolomické analýzy biologických vzorků, jako je lidská moč, jsou klíčové pro identifikaci biomarkerů v různých onemocněních. Vysoká schopnost separace a citlivost detekce umožňují odhalit i nízce zastoupené metabolity a zvyšují přesnost jejich identifikace.
Cíle a přehled studie
Studie porovnává dva hyphenované systémy LC–iontové mobility–MS, SYNAPT XS a SELECT SERIES Cyclic IMS, s cílem zjistit jejich schopnost detekovat a anotovat metabolity v extraktu lidské moči.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorek lidské moči byl ředěn vodou a acetonitrilem, protřesen a následně odstředěn. Separace probíhala na systému ACQUITY Premier UPLC s BEH Amide kolonnou při 40 °C a gradientním programu založeném na směsi acetonitril voda s formiátovými pufry. Oba MS přístroje pracovaly v pozitivním ESI režimu, Tof rozsah 50–1200 Da, režim HDMSE s kolizním napětím 20–40 eV. SELECT SERIES Cyclic IMS nabízí prodlouženou dráhu iontové mobility díky možnosti vícenásobných průchodů.
Hlavní výsledky a diskuse
SELECT SERIES Cyclic IMS detekoval průměrně 3,5× více nízkoenergetických iontů než SYNAPT XS a umožnil zaregistrovat o 50 procent více peak-picked features. Mobilitní separace oddělila izobarické složky se stejnou m/z a retenční dobou, což vedlo k čistším fragmentačním spektrům. Při vyhledávání v databázi HMDB bylo možné anotovat o 944 metabolitů více než u dat ze SYNAPT XS.
Přínosy a praktické využití metody
- Zvýšený počet detekovaných metabolitů rozšiřuje možnosti objevování nových biomarkerů.
- Lepší rozlišení izobarických látek zvyšuje spolehlivost identifikace a kvantifikace.
- Vysoký průtok vzorků bez ztráty kvality dat podporuje rutinní aplikace v klinických a průmyslových laboratořích.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Další rozvoj multipasové iontové mobility pro hlubší separaci komplexních vzorků.
- Integrace s dalšími hyphenovanými technikami pro komplexní fenotypování.
- Aplikace v personalizované medicíně a dlouhodobém monitorování metabolických profilů.
Závěr
Díky prodloužené dráze iontové mobility poskytuje SELECT SERIES Cyclic IMS výrazně vyšší kapacitu a kvalitu detekce než SYNAPT XS. Zvýšený počet detekovaných i anotovaných metabolitů zvyšuje přesnost biomarker discovery a rozšiřuje možnosti analytické chemie metabolomiky.
Reference
- Rainville PD, et al. Ion Mobility Spectrometry Combined With Ultra Performance Liquid Chromatography Mass Spectrometry for Metabolic Phenotyping of Urine Anal Chim Acta 2017 982 1–8
- King AM, et al. Rapid Profiling Method for the Analysis of Lipids in Human Plasma Using Ion Mobility enabled Reversed phase Ultra high Performance Liquid Chromatography Mass Spectrometry J Chromatogr A 2020 1611 460597
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Qualitative and Quantitative Performance of Cyclic IMS in Nanoscale Proteomic Experiments
2021|Waters|Aplikace
Application Note Qualitative and Quantitative Performance of Cyclic IMS in Nanoscale Proteomic Experiments Chris Hughes, Lee A. Gethings, Robert S. Plumb Waters Corporation This is an Application Brief and does not contain a detailed Experimental section. For research use only.…
Klíčová slova
nanoscale, nanoscaleims, imscyclic, cyclicproteomic, proteomicqualitative, qualitativeexperiments, experimentsquantitative, quantitativeperformance, performanceqtof, qtofiterations, iterationsspectrometers, spectrometersselect, selectseries, seriesmass, massiteration
HIGHER SENSITIVITY, DATA QUALITY AND THROUGHPUT FOR HYDROGEN DEUTERIUM EXCHANGE EXPERIMENTS WITH EXTENDED ION MOBILITY SEPARATION
2021|Waters|Postery
HIGHER SENSITIVITY, DATA QUALITY AND THROUGHPUT FOR HYDROGEN DEUTERIUM EXCHANGE EXPERIMENTS WITH EXTENDED ION MOBILITY SEPARATION Alexandre F. Gomes[1], Lindsay Morrison[1], Malcolm Anderson[2], Colette Quinn[1] [1] Waters Corporation, 34 Maple St., Milford, MA, 01757, USA [2] Waters Corporation, Stamford Avenue,…
Klíčová slova
hdx, hdxcyclic, cyclicpeptides, peptidesdeuterium, deuteriumims, imssynapt, synaptpeptide, peptidepepsin, pepsincoverage, coveragephosb, phosbadc, adcexperiments, experimentssequence, sequenceleap, leapmobility
DELVING DEEPER INTO THE METABOLOME WITH CYCLIC IMS, SUB PPM MASS ACCURACY AND HIGH RESOLUTION MASS SPECTROMETRY
2022|Waters|Postery
DELVING DEEPER INTO THE METABOLOME WITH CYCLIC IMS, SUB PPM MASS ACCURACY AND HIGH RESOLUTION MASS SPECTROMETRY Adam M King1; Eleanor Matthews2; Matthew E Daly2; Martin Palmer1; Mike McCullagh1; Lee A Gethings1,2; Angela Simpson2; Stephen Fowler2; Timothy Felton2; Robert Plumb3;…
Klíčová slova
mrt, mrtims, imscyclic, cyclicmass, massseries, seriesmetabolomic, metabolomicerror, erroracetylcarnitine, acetylcarnitineselect, selecthilic, hilicplasma, plasmataurochenodeoxycholate, taurochenodeoxycholateresolution, resolutionseparation, separationimsn
The Application of Cyclic Ion Mobility to Non- targeted Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl substances (PFAS) in Environmental Samples
2024|Waters|Aplikace
Application Note The Application of Cyclic Ion Mobility to Nontargeted Analysis of Per- and Polyfluoroalkyl substances (PFAS) in Environmental Samples Sarah Dowd, Kari L. Organtini, Frank L Dorman Waters Corporation Abstract Per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) are a group of…
Klíčová slova
pfas, pfascyclic, cyclicpolyfluoroalkyl, polyfluoroalkylmobility, mobilitysubstances, substancestargeted, targetedenvironmental, environmentalper, pernon, nonion, ionsamples, samplesims, imsapplication, applicationccs, ccseffluent