Expanded Instrument Control Using the Orbitrap Tribrid IAPI
Postery | 2021 | Thermo Fisher Scientific | ASMSInstrumentace
V dnešní výzkumné a průmyslové praxi je možnost detailní a flexibilní kontroly hmotnostního spektrometru klíčová pro vytváření vlastních akvizičních režimů. Rozšířená IAPI (Instrument Application Programming Interface) přináší novou úroveň volnosti při návrhu metod, optimalizaci poměru signál–šum a zrychlení analýzy specifických látek.
Cílem této práce bylo představit nově zpřístupněné funkce IAPI pro Orbitrap Tribrid systémy, mezi něž patří: kontrola předpovídaného automatického zesílení (pAGC), správa hmotnostních rozsahů, individualizace injekčních časů pro multiplexované okna (MSX SIM) a podpora režimů multistage activation (MSA). Studie demonstruje ověření těchto rozšíření experimenty s využitím FlexMix standardu.
Experimenty probíhaly na softwarově modifikovaném Orbitrap Fusion Lumos Tribrid spektrometru s infuzí FlexMix při průtoku 3–5 μL/min a HESI ionizací. Pro vývoj a testování byl vytvořen vlastní C# objekt využívající nové rozhraní IAPI. Klíčové kroky zahrnovaly přenos definic scanů do IAPI, zachytávání datových událostí a validaci parametrů instrumentální služby.
Byla implementována hierarchická správa scanů, kde uživatelské (IAPI) scany mají prioritu před standardními metodami. Pomocí parametrů IsPAGCScan a PAGCGroupIndex lze řídít pAGC pro až 200 skupin samostatných akvizic. U MSX SIM oken se nyní pro každé okno vypočítává vlastní injekční čas, což zlepšuje signál–šum pro méně zastoupené ionty. Dále byla rozšířena podpora hmotnostních rozsahů až do m/z 6000 v Orbitrap a implementována multistage activation, která přidává další stupeň kolizní aktivace.
Lze očekávat další rozšíření IAPI o strojové učení pro prediktivní volbu parametrů, cloudové řízení instrumentů a integraci s dalšími analytickými postupy. Vývoj podobných API pro ostatní řady spektrometrů a zavádění reálného času zpětné vazby otevře prostor pro autonomní akvizice a optimalizaci metod v on-line režimu.
Představené rozšíření IAPI pro Orbitrap Tribrid systém poskytuje výrazně vyšší flexibilitu při návrhu metod a lepší kontrolu parametrů akvizice. Funkce pAGC, rozšířené hmotnostní režimy a multistage activation přispívají ke zvýšení kvality dat a efektivity analýzy. Tyto inovace podporují rychlý vývoj nových aplikací v oblasti proteomiky, metabolomiky i QA/QC.
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
ZaměřeníOstatní
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
V dnešní výzkumné a průmyslové praxi je možnost detailní a flexibilní kontroly hmotnostního spektrometru klíčová pro vytváření vlastních akvizičních režimů. Rozšířená IAPI (Instrument Application Programming Interface) přináší novou úroveň volnosti při návrhu metod, optimalizaci poměru signál–šum a zrychlení analýzy specifických látek.
Cíle a přehled studie / článku
Cílem této práce bylo představit nově zpřístupněné funkce IAPI pro Orbitrap Tribrid systémy, mezi něž patří: kontrola předpovídaného automatického zesílení (pAGC), správa hmotnostních rozsahů, individualizace injekčních časů pro multiplexované okna (MSX SIM) a podpora režimů multistage activation (MSA). Studie demonstruje ověření těchto rozšíření experimenty s využitím FlexMix standardu.
Použitá metodika a instrumentace
Experimenty probíhaly na softwarově modifikovaném Orbitrap Fusion Lumos Tribrid spektrometru s infuzí FlexMix při průtoku 3–5 μL/min a HESI ionizací. Pro vývoj a testování byl vytvořen vlastní C# objekt využívající nové rozhraní IAPI. Klíčové kroky zahrnovaly přenos definic scanů do IAPI, zachytávání datových událostí a validaci parametrů instrumentální služby.
Hlavní výsledky a diskuse
Byla implementována hierarchická správa scanů, kde uživatelské (IAPI) scany mají prioritu před standardními metodami. Pomocí parametrů IsPAGCScan a PAGCGroupIndex lze řídít pAGC pro až 200 skupin samostatných akvizic. U MSX SIM oken se nyní pro každé okno vypočítává vlastní injekční čas, což zlepšuje signál–šum pro méně zastoupené ionty. Dále byla rozšířena podpora hmotnostních rozsahů až do m/z 6000 v Orbitrap a implementována multistage activation, která přidává další stupeň kolizní aktivace.
Přínosy a praktické využití metody
- Umožňuje navrhovat cílené metody s optimalizovanou citlivostí a selektivitou
- Zvyšuje kvalitu dat díky lepší kontrole automatického zesílení a individualizaci injekčních časů
- Umožňuje rychlejší vývoj nekonvenčních akvizičních režimů v rutiních i výzkumných labouratořích
Budoucí trendy a možnosti využití
Lze očekávat další rozšíření IAPI o strojové učení pro prediktivní volbu parametrů, cloudové řízení instrumentů a integraci s dalšími analytickými postupy. Vývoj podobných API pro ostatní řady spektrometrů a zavádění reálného času zpětné vazby otevře prostor pro autonomní akvizice a optimalizaci metod v on-line režimu.
Závěr
Představené rozšíření IAPI pro Orbitrap Tribrid systém poskytuje výrazně vyšší flexibilitu při návrhu metod a lepší kontrolu parametrů akvizice. Funkce pAGC, rozšířené hmotnostní režimy a multistage activation přispívají ke zvýšení kvality dat a efektivity analýzy. Tyto inovace podporují rychlý vývoj nových aplikací v oblasti proteomiky, metabolomiky i QA/QC.
Reference
- Derek Bailey et al. TP 393, ASMS 2016.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Real-Time Instrument Control of the Orbitrap Tribrid Mass Spectrometer
2016|Thermo Fisher Scientific|Postery
Figu Figure 1. Compatible Mass Spectrometers Orbitrap Fusion Lumos Orbitrap Fusion The IAPI is compatible with both the Thermo Scientific™ Orbitrap™ Fusion™ mass spectrometer and the Thermo Scientific™ Orbitrap™ Fusion Lumos™ mass spectrometer Figure 2. IAPI Architecture • The architecture…
Klíčová slova
iapi, iapifusion, fusionscan, scanrepeating, repeatingabundance, abundancecustom, customorbitrap, orbitrapscans, scansrelative, relativetribrid, tribridraw, rawmethod, methodtune, tuneimassintensity, imassintensityfile
Thermo Scientific Orbitrap Tribrid MS Series: Instrument Control Software v.3.5 and v3.5 SP1 Overview
2022|Thermo Fisher Scientific|Ostatní
Thermo Scientific™ Orbitrap™ Tribrid™ MS Series: Instrument Control Software v.3.5 and v3.5 SP1 Overview January-2022 The world leader in serving science 1 Software Release Flexera 2 Download: Orbitrap Tribrid MS Series ICSW v. 3.5 SP1 and Xcalibur 4.5 Software Software…
Klíčová slova
targets, targetsions, ionshcd, hcdfaims, faimsadditional, additionalnormalized, normalizedcollision, collisionauto, autolibrary, librarycalibration, calibrationrtls, rtlsall, allsearch, searchenergy, energyabsolute
Orbitrap Tribrid MS Series: Instrument Control Software v.3.5 Overview
2021|Thermo Fisher Scientific|Prezentace
Thermo Scientific™ Orbitrap™ Tribrid™ MS Series: Instrument Control Software v.3.5 Overview The world leader in serving science 1 [email protected] | July-2021 Software Release Flexera 2 Download: Orbitrap Tribrid MS Series ICSW v. 3.5 and Xcalibur 4.5 Software [email protected] | July-2021…
Klíčová slova
targets, targetsions, ionshcd, hcdfaims, faimsadditional, additionalnormalized, normalizedlibrary, librarycollision, collisionauto, autocalibration, calibrationrtls, rtlsall, allsearch, searchenergy, energyabsolute
Thermo Scientific™ Orbitrap™ Tribrid™ MS Series: Instrument Control Software v.4.0 Overview
2023|Thermo Fisher Scientific|Prezentace
Thermo Scientific™ Orbitrap™ Tribrid™ MS Series: Instrument Control Software v.4.0 Overview Updated With Defect Fixes in SP1 March-2023 The world leader in serving science 1 Software Release Flexera Orbitrap Tribrid MS Series ICSW 4.0 SP1 is available to customers using…
Klíčová slova
library, libraryorbitrap, orbitrapsearch, searchascend, ascendlibraries, librariesspectral, spectralnew, newauto, autodia, diacalibration, calibrationreal, realion, ionrtls, rtlssettings, settingsready