Mass Spectrometry Imaging Data Analysis Software - IMAGEREVEAL MS

Význam tématu

Mass spectrometry imaging (MSI) představuje moderní nástroj pro mapování prostorového rozložení molekul ve tkáňových řezech. Uplatňuje se v biomedicínském výzkumu, farmaceutickém vývoji i klinické patologii, jelikož nabízí detailní molekulární informace bez nutnosti značení.

Cíle a přehled studie / článku

Popis softwarového řešení IMAGEREVEAL MS od společnosti Shimadzu určeného pro zjednodušení a automatizaci rutinní analýzy MSI dat. Dokument představuje pracovní postup, klíčové funkce, režimy analýzy a příklady aplikací.

Použitá metodika a instrumentace

IMAGEREVEAL MS nabízí následující analytické režimy:

• Collective Analysis: integruje diferenciální, obrazovou a statistickou analýzu v jednom kroku.
• Differential Analysis: identifikace molekul rozdílně distribovaných v regionech zájmu (ROIs) za pomoci PCA a PLS.
• Image Analysis: vyhledávání rozložení podobného k referenčnímu barvenému obrazu (Similar Image Extraction, klasifikace, segmentace).
• Quantitative Analysis: kvantifikace koncetračního rozložení pomocí kalibračních křivek.

Data lze importovat v obecných formátech imzML a Analyze7.5 nebo z konvertované podoby imdx. Konverzi zajišťá IMDX Converter pro přístroje Shimadzu (iMScope QT, iMScope TRIO, MALDI-7090, AXIMA™) a další formáty (Thermo Fisher RAW).

Hlavní výsledky a diskuse

Úspěšné otestování softwaru na analýze NASH modelu (myší játra) ukázalo, že Collective Analysis výrazně zkracuje počet kroků a čas zpracování. Diferenciální analýza odhalila specifické m/z signály pro postiženou tkáň, obrazová analýza nalezla molekuly korelující s histologickým barvením a kvantitativní režim umožnil přesné vyjádření koncentrace léku v místě aplikace.

Přínosy a praktické využití metody

Implementace IMAGEREVEAL MS přináší:

• rychlejší rutinní analýzu a vyšší reprodukovatelnost výsledků,
• možnost paralelního zpracování stovek GB dat bez rozdělování,
• uživatelsky přívětivé prostředí pro experty i provozní laboratoře,
• volbu funkcí podle licencí (základní, imaging, screening, full).

Budoucí trendy a možnosti využití

Očekává se rozšíření integrace s umělou inteligencí pro hlubší data mining, podpora cloud computingu pro sdílení a kolaborativní analýzu dat, rozvoj multimodálních zobrazovacích přístupů (MSI + mikroskopie) a využití v personalizované medicíně a farmakokinetice.

Závěr

IMAGEREVEAL MS představuje komplexní platformu pro efektivní zpracování a interpretaci MSI dat. Díky modulárnímu přístupu a podpoře standardních formátů nabízí flexibilitu pro výzkum i rutinní provoz a otevřenou cestu k dalšímu rozvoji analytických metod.

Reference

• Shimadzu Corporation: IMAGEREVEAL MS User Manual, First Edition December 2020 (C146-E400A).