Utility of Desorption Electrospray Ionization (DESI) for Mass Spectrometry Imaging
Technické články | 2015 | WatersInstrumentace
Desorption electrospray ionization imaging představuje průlom v zobrazování molekulární distribuce ve vzorcích při atmosférickém tlaku. Metoda minimalizuje přípravu vzorku a umožňuje zachování struktury pro následné zobrazovací či histologické metody. Je zásadní pro výzkum proteomiky, biomarkerů, farmakokinetiky i klinické patologie.
Cílem je popsat využití DESI imagingu ve spojení s časově-oflým hmotnostním spektrometrem (TOF-MS) na platformách SYNAPT G2-Si a Xevo G2-XS. Studie představuje postup sekcionování tkáně, akvizice dat, jejich zpracování a multimodální overlay molekulárních obrazů s histologickým zobrazením.
Vzorky (tloušťka 10–15 µm) se krájí kryostatem Leica a přímo pokládají na skleněný podložní sklíčko. DESI zdroj na 2D lineární pohybové jezdě rasteruje povrch vzorku definovanou oblastí v HDI softwaru. Analýza probíhá v pozitivní i negativní ionizační polaritě s pixelovou velikostí obvykle 50–100 µm. Zpracování a vizualizace dat se provádí v High Definition Imaging (HDI) softwaru, přičemž po MS akvizici lze tytéž sekce barvit hematoxylinem a eosinem.
DESI imaging poskytuje bohaté spektrální informace o malých molekulách a lipidech přímo na povrchu tkání či materiálů. Na příkladech myšího mozku byly získány spatialní obrazy fosfolipidů ve dvou polaritách, jejichž distribuce koreluje s anatomickými strukturami. Ukázalo se, že metoda zachovává integritu vzorku pro histologii. Rovněž byla demonstrována analýza porciní jaterní tkáně (olejová kyselina), otisku prstu, bakteriální kolonie na agaru i humánní nádorové vs. normální tkáně.
■ Minimální příprava vzorku, bez potreby matriční aplikace
■ Analýza při atmosférickém tlaku, šetrné k biologickým vzorkům
■ Multimodální zobrazení – pozitivní i negativní polarita, MALDI i histologie na stejném preparátu
■ Vysoká citlivost na malé molekuly, lipidy a metabolity
■ Široká použitelnost: tkáně, rostlinné materiály, farmaceutické tablety, forenzní stopy, bakteriální kolonie
Očekává se rozšíření prostorového rozlišení na nižší desítky mikrometrů, integrace s dalšími zobrazovacími modalitami (MRI, Ramanova spektroskopie) a pokročilá datová analýza skrze strojové učení. Dále je perspektivní aplikace v intraoperační imagistice a personalizované medicíně.
DESI imaging poskytuje rychlou a neinvazivní alternativu MALDI-MSI pro prostorovou lokalizaci malých molekul a lipidů. Díky minimální přípravě a možnosti následného histologického barvení nabízí komplexní pohled na molekulární složení vzorků při zachování biologické integrity.
MS Imaging, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníVýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Desorption electrospray ionization imaging představuje průlom v zobrazování molekulární distribuce ve vzorcích při atmosférickém tlaku. Metoda minimalizuje přípravu vzorku a umožňuje zachování struktury pro následné zobrazovací či histologické metody. Je zásadní pro výzkum proteomiky, biomarkerů, farmakokinetiky i klinické patologie.
Cíle a přehled studie
Cílem je popsat využití DESI imagingu ve spojení s časově-oflým hmotnostním spektrometrem (TOF-MS) na platformách SYNAPT G2-Si a Xevo G2-XS. Studie představuje postup sekcionování tkáně, akvizice dat, jejich zpracování a multimodální overlay molekulárních obrazů s histologickým zobrazením.
Použitá metodika a instrumentace
Vzorky (tloušťka 10–15 µm) se krájí kryostatem Leica a přímo pokládají na skleněný podložní sklíčko. DESI zdroj na 2D lineární pohybové jezdě rasteruje povrch vzorku definovanou oblastí v HDI softwaru. Analýza probíhá v pozitivní i negativní ionizační polaritě s pixelovou velikostí obvykle 50–100 µm. Zpracování a vizualizace dat se provádí v High Definition Imaging (HDI) softwaru, přičemž po MS akvizici lze tytéž sekce barvit hematoxylinem a eosinem.
- TOF-MS: SYNAPT G2-Si, Xevo G2-XS
- DESI zdroj s rozprachováním solventu (90:10 metanol:voda)
- Živá akvizice v pozitivním i negativním režimu
- Softwarová platforma HDI pro koregistraci a vizualizaci
- Histologické barvení H&E na stejných preparátech
Hlavní výsledky a diskuse
DESI imaging poskytuje bohaté spektrální informace o malých molekulách a lipidech přímo na povrchu tkání či materiálů. Na příkladech myšího mozku byly získány spatialní obrazy fosfolipidů ve dvou polaritách, jejichž distribuce koreluje s anatomickými strukturami. Ukázalo se, že metoda zachovává integritu vzorku pro histologii. Rovněž byla demonstrována analýza porciní jaterní tkáně (olejová kyselina), otisku prstu, bakteriální kolonie na agaru i humánní nádorové vs. normální tkáně.
Přínosy a praktické využití metody
■ Minimální příprava vzorku, bez potreby matriční aplikace
■ Analýza při atmosférickém tlaku, šetrné k biologickým vzorkům
■ Multimodální zobrazení – pozitivní i negativní polarita, MALDI i histologie na stejném preparátu
■ Vysoká citlivost na malé molekuly, lipidy a metabolity
■ Široká použitelnost: tkáně, rostlinné materiály, farmaceutické tablety, forenzní stopy, bakteriální kolonie
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření prostorového rozlišení na nižší desítky mikrometrů, integrace s dalšími zobrazovacími modalitami (MRI, Ramanova spektroskopie) a pokročilá datová analýza skrze strojové učení. Dále je perspektivní aplikace v intraoperační imagistice a personalizované medicíně.
Závěr
DESI imaging poskytuje rychlou a neinvazivní alternativu MALDI-MSI pro prostorovou lokalizaci malých molekul a lipidů. Díky minimální přípravě a možnosti následného histologického barvení nabízí komplexní pohled na molekulární složení vzorků při zachování biologické integrity.
Reference
- 1. Heeren R.M.A., Skraskova K. Maastricht University, Nizozemsko. DESI imaging na myším mozku.
- 2. Malone J., Saalbach G. John Innes Center, UK. Analýza humánních vzorků s etickým schválením NRES (Study ID 1/LO/0686).
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
APPLICATION NOTEBOOK - MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS
2016|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTEBOOK ] MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS 1 This notebook is an excerpt from the larger Waters’ Application Notebook on Metabolomics and Lipidomics #720005245EN TABLE OF CONTENTS 3 Introduction 4 Biomarker Discovery Directly from…
Klíčová slova
imaging, imagingtissue, tissuemaldi, maldidesi, desihdi, hdimobility, mobilitysection, sectiondefinition, definitionion, ionhdms, hdmsbiomarker, biomarkerimage, imagedesorption, desorptionxenograph, xenographionization
Metabolic Phenotyping of Colorectal Tissue Samples by DESI-MSI for Clinical Research
2018|Waters|Aplikace
[ TECHNOLOGY BRIEF ] Metabolic Phenotyping of Colorectal Tissue Samples by DESI-MSI for Clinical Research Anna Mroz,¹ Luisa Doria,¹ Emmanuelle Claude,² and Zoltan Takats¹ ¹Imperial College, London, UK; ²Waters Corporation, Wilmslow, UK The examination of lipid profiles and distributions in…
Klíčová slova
tissue, tissuemsi, msicolorectal, colorectaldesi, desihealthy, healthyimaging, imagingstained, stainedlipid, lipidhdi, hdiimages, imagestypes, typesdistribution, distributionbrief, briefcorresponding, correspondingcancer
Application of Desorption Electrospray Ionization (DESI) for Breast Tissue Imaging in Clinical Research 
2018|Waters|Aplikace
[ TECHNOLOGY BRIEF ] Application of Desorption Electrospray Ionization (DESI) for Breast Tissue Imaging in Clinical Research Dipa Gurung, Imperial College, London, UK; Emmanuelle Claude, Waters Corporation, Wilmslow, UK; and Zoltan Takats, Imperial College, London, UK; DESI imaging provides effective…
Klíčová slova
tissue, tissuedesi, desiimaging, imagingmsi, msibreast, breastrmmc, rmmcionization, ionizationdesorption, desorptionspatial, spatialelectrospray, electrospraydistribution, distributionstained, stainedbrief, brieflocalization, localizationbiomolecules
Multiple, Sequential DESI Images from a Single Tissue Section at Different Spatial Resolution
2015|Waters|Technické články
Multiple, Sequential DESI Images from a Single Tissue Section at Different Spatial Resolution Emmanuelle Claude and Emrys Jones Waters Corporation, Wilmslow, UK G OA L DESI imaging allows multiple analyses of a single To demonstrate that desorption electrospray ionization (DESI)…
Klíčová slova
imaging, imagingdesi, desitissue, tissuesection, sectionspatial, spatialimages, imagesimage, imageliver, liversequential, sequentialsample, samplepixel, pixelporcine, porcinesingle, singleexperiment, experimentcarried