Analysis of FFPE treated clinical tissue sections obtained from Human Intraocular Malignancy, Uveal Melanoma by Mass Spectrometry Imaging (MSI)
Prezentace | 2016 | WatersInstrumentace
Metoda zobrazování molekul pomocí hmotnostní spektrometrie na FFPE řezech poskytuje přesnou prostorovou mapu distribuce biologicky relevantních látek bez nutnosti barvicích postupů. Uveální melanom jako hlavní intraokulární malignita vyžaduje detailní chemickou charakterizaci pro zlepšení diagnostiky a prognostického posouzení.
Studie si kladla za cíl vyhodnotit využití MSI metod MALDI a DESI pro analýzu parafinem zalitých očních řezů od pacientů s uveálním melanomem. Zaměřila se na zobrazování molekulárních signálů v různých částech oka a na statistickou klasifikaci vzorků podle prognózy.
Metoda MSI doplňuje klasickou histopatologii o chemickou dimenzi bez nutnosti barvicích či fluorescenčních markerů. Umožňuje lokalizaci biomarkerů, podporu prognózování a lze ji využít v translaci do klinické praxe.
MSI na FFPE řezích očí prokázala schopnost rozlišit molekulární profily zdravé tkáně a uveálního melanomu s vysokou prostorovou přesností. Statistická analýza potvrdila třídění vzorků podle prognózy a identifikovala klíčové lipidové biomarkery.
V textu nebyly uvedeny žádné literární zdroje.
MALDI, MS Imaging, LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníKlinická analýza
VýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Metoda zobrazování molekul pomocí hmotnostní spektrometrie na FFPE řezech poskytuje přesnou prostorovou mapu distribuce biologicky relevantních látek bez nutnosti barvicích postupů. Uveální melanom jako hlavní intraokulární malignita vyžaduje detailní chemickou charakterizaci pro zlepšení diagnostiky a prognostického posouzení.
Cíle a přehled studie
Studie si kladla za cíl vyhodnotit využití MSI metod MALDI a DESI pro analýzu parafinem zalitých očních řezů od pacientů s uveálním melanomem. Zaměřila se na zobrazování molekulárních signálů v různých částech oka a na statistickou klasifikaci vzorků podle prognózy.
Použitá metodika a instrumentace
- Příprava vzorku: standardní fixace formalinem, parafinové zalití, řezy 5 µm
- MALDI MSI: nanesení matricového roztoku, ionizace laserem, rozlišení 100×100 µm a 50×50 µm v pozitivním režimu
- DESI MSI: přímá deprotonace molekul v negativním režimu, rozlišení 200×200 µm bez další úpravy
- Hmotnostní spektrometr: SYNAPT (Waters Corporation) ve Sheffieldu
- Datová analýza: PCA a PLS-DA v prostředí MATLAB s PLS Toolbox (Eigenvector)
Hlavní výsledky a diskuse
- Rozdílná lokalizace molekul v různých vrstvách oka: choroid, rohovka, retina, čočka a tumor
- Signály v rozsahu m/z 100–1000 ukázaly odlišné lipidové a metabolitické profily v tumoru vs. zdravé tkání
- PCA jasně oddělila vzorky podle prognózy
- PLS-DA zdůraznila diskriminační signály odpovídající sfingolipidům a lyso-fosfocholinu
Přínosy a praktické využití metody
Metoda MSI doplňuje klasickou histopatologii o chemickou dimenzi bez nutnosti barvicích či fluorescenčních markerů. Umožňuje lokalizaci biomarkerů, podporu prognózování a lze ji využít v translaci do klinické praxe.
Budoucí trendy a možnosti využití
- Zvýšení prostorového rozlišení pod 10 µm a 3D zobrazování
- Integrace s multimodálními zobrazovacími technologiemi a umělou inteligencí pro pokročilou analýzu
- Rozšíření aplikací na další oční onemocnění a biobanky tkání
- Standardizace protokolů pro rutinní klinické nasazení a kontrolu kvality
Závěr
MSI na FFPE řezích očí prokázala schopnost rozlišit molekulární profily zdravé tkáně a uveálního melanomu s vysokou prostorovou přesností. Statistická analýza potvrdila třídění vzorků podle prognózy a identifikovala klíčové lipidové biomarkery.
Reference
V textu nebyly uvedeny žádné literární zdroje.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
APPLICATION NOTEBOOK - MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS
2016|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTEBOOK ] MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS 1 This notebook is an excerpt from the larger Waters’ Application Notebook on Metabolomics and Lipidomics #720005245EN TABLE OF CONTENTS 3 Introduction 4 Biomarker Discovery Directly from…
Klíčová slova
imaging, imagingtissue, tissuemaldi, maldidesi, desihdi, hdimobility, mobilitysection, sectiondefinition, definitionion, ionhdms, hdmsbiomarker, biomarkerimage, imagedesorption, desorptionxenograph, xenographionization
INCREASE IMAGE CLARITY AND SPECIFICITY USING DUAL MSI SOURCES AND MULTI-REFLECTING TIME-OF-FLIGHT ANALYZING METABOLITES IN MOUSE TESTIS 
2022|Waters|Postery
INCREASE IMAGE CLARITY AND SPECIFICITY USING DUAL MSI SOURCES AND MULTI-REFLECTING TIME-OF-FLIGHT ANALYZING METABOLITES IN MOUSE TESTIS Emma Marsden-Edwards1; Martin Palmer1; Sheba Jarvis2; Mark Towers1; Dale Cooper-Shepherd1; Charlotte Bevan2; Emmanuelle Claude1 1 : Waters Corporation, Altrincham Rd, Stamford Avenue, Wilmslow,…
Klíčová slova
desi, desiimaging, imagingtestis, testistissue, tissuemrt, mrtmsi, msimouse, mousemaldi, maldiionisation, ionisationrois, roismass, massexperiments, experimentslipid, lipidreflecting, reflectingflight
INCREASE IMAGE CLARITY AND SPECIFICITY USING DUAL MSI SOURCES AND MULTI-REFLECTING TIME-OF-FLIGHT ANALYZING METABOLITES IN MOUSE TESTIS
2022|Waters|Postery
INCREASE IMAGE CLARITY AND SPECIFICITY USING DUAL MSI SOURCES AND MULTI-REFLECTING TIME-OF-FLIGHT ANALYZING METABOLITES IN MOUSE TESTIS Emma Marsden-Edwards1; Martin Palmer1; Sheba Jarvis2; Mark Towers1; Dale Cooper-Shepherd1; Charlotte Bevan2; Emmanuelle Claude1 1 : Waters Corporation, Altrincham Rd, Stamford Avenue, Wilmslow,…
Klíčová slova
desi, desiimaging, imagingtestis, testistissue, tissuemrt, mrtmsi, msimouse, mousemaldi, maldiionisation, ionisationmass, massrois, roisexperiments, experimentslipid, lipiddesorption, desorptionflight
DESI-Mass Spectrometry Imaging Investigation of Discrete and Cassette Drug Dosed Tissues
2019|Waters|Aplikace
[ TECHNOLOGY BRIEF ] DESI-Mass Spectrometry Imaging Investigation of Discrete and Cassette Drug Dosed Tissues Philippa J Hart,¹ Andreas Danhorn,² Mark Towers,¹ and Emmanuelle Claude¹ ¹Waters Corporation, Wilmslow, UK, ²Imperial College, London, UK Mass spectrometry imaging for the distribution of…
Klíčová slova
desi, desiimaging, imagingdosed, dosedmsi, msidistribution, distributiondrugs, drugswba, wbaendogenous, endogenousvisualization, visualizationcassette, cassettebrief, briefdrug, drugspectrometry, spectrometrylocalization, localizationmetabolites