LC/MS Unknown Identifications Using MSMS Libraries Part I: Overview of Software and User-Customized Configurations

Význam tématu

Identifikace neznámých sloučenin pomocí LC/MS a MS/MS knihoven je klíčová pro výzkum v oblasti farmaceutické, environmentální a potravinové analýzy. Umožňuje rychlou strukturální charakterizaci, zajištění kvality a odhalení neznámých kontaminantů či metabolitů.

Cíle a přehled studie / článku

Článek představuje přehled bezplatného NIST MSMS Search softwaru a ukazuje, jak si uživatel může přizpůsobit konfiguraci pro efektivní vyhledávání. Popisuje nástroje pro import dat, nastavení parametrů, zobrazení výsledků a ukládání vlastních způsobů práce.

Použitá metodika a instrumentace

• Softwarová platforma NIST MS Search pro vyhledávání v MS/MS knihovnách
• Import dat z různých výrobců LC/MS/MS přístrojů
• Modul MS Interpreter pro přiřazení fragmentů k substrukturám molekul
• Databáze NIST MSMS knihoven a možnost integrace dalších zdrojů (Wiley, MoNA, uživatelské knihovny)

Hlavní výsledky a diskuse

• Podpora vícero typů vyhledávání: podle spektra, struktury, názvu, CAS, molekulové hmotnosti, fragmentů aj.
• Možnost přizpůsobit rozvržení oken, zobrazované panely obrazu spektra a seznam fragmentů
• Uložení a načtení vlastních konfigurací pro opakované použití
• Rychlý přechod mezi výsledky pomocí šipek nebo myši, filtrování podle polarity, typu ionizace či zdroje spekter
• Automatické generování InChIKey a přímé propojení na PubChem
• Zobrazení přesných molekulových vzorců fragmentů při vysokém rozlišení

Přínosy a praktické využití metody

• Zvýšení efektivity identifikace neznámých sloučenin v rutině i výzkumu
• Univerzální prostředí kompatibilní s různými formáty a dodavateli spektrometrů
• Flexibilní filtrace a přehledné uživatelské rozhraní šetří čas při interpretaci výsledků

Budoucí trendy a možnosti využití

Další části série se zaměří na hybridní vyhledávání, import vlastních spekter, strukturální vyhledávání bez spekter a automatizované zpracování. Očekává se rozšíření integrace cloudových databází, využití strojového učení pro predikci fragmentace a zvýšení kvality vyhledávacích algoritmů.

Závěr

NIST MSMS Search software nabízí širokou paletu nástrojů pro identifikaci neznámých sloučenin pomocí LC/MS/MS. Díky možnosti uživatelských konfigurací, propojení s online zdroji a podpoře více knihoven představuje efektivní řešení pro analytiky v průmyslu i akademii.

Reference

1. James Little Mass Spectral Resource Website
2. Chemical Ionization for MW Determination
3. Trimethylsilyl Derivatives for GC-MS
4. Methyl Ester Derivatives for GC-MS
5. Lipid Matrix Ionization Effects in LC-MS
6. SciFinder/ChemSpider and Accurate Mass LC-MS Data for Unknown ID’s
7. Surfactant Identification
8. NIST Search Software Detailed Manual
9. NIST Tandem Quick Start Guide