DESI MS Imaging Using SONAR™: A Novel Method to Image Precursor Ions and Fragment Ions for Molecular Identification in a Single Experiment
Technické články | 2018 | WatersInstrumentace
Mass spectrometry imaging (MSI) s technikou DESI je klíčovou metodou pro mapování prostorové distribuce přírodních a patologických molekul v biologických tkáních bez destrukce vzorku. Integrace nového datově nezávislého akvizičního režimu SONAR do DESI workflow umožňuje paralelní sběr informací o prekurzorových a fragmentačních iontech v jednom měření, což zkracuje dobu analýzy a zvyšuje spolehlivost identifikace.
Cílem této studie bylo implementovat SONAR režim na hybridní kvadrupól-QTof přístroji Xevo G2-XS a otestovat jeho schopnost současně zobrazit lipidové prekurzory i fragmenty přímo z plátků kryokrájené mozkové tkáně potkana. Studie demonstruje bezproblémový přechod od neřízeného sběru dat k robustní identifikaci biomarkerů lipidy.
Analýzy byly provedeny na kryotemem připravených řezích potenciálně biologicky významné mozkové tkáně potkana. Vzorky se vkládaly do DESI zdroje bez další úpravy. Ionizace probíhala v pozitivním i negativním režimu při průtoku rozpouštědla MeOH: voda (95:5) 2 µl/min a tlaku nebulizačního plynu 5 bar. SONAR režim zajišťuje opakovaný sken kvadrupólu v okně m/z s nízkou a následně vysokou kolizní energií (LE a HE) pro každý pixel (100 × 100 µm). Získaná data se vyhodnocovala v softwaru HDI™ v1.4, MassLynx™ a DriftScope™ a k identifikaci lipidů se využila databáze LipidMaps.
LE spektra odhalila intenzivní lipidové ionty v oblasti m/z 700–900. HE spektra poskytla fragmenty od m/z 100 do 900. Pro lepší interpretaci byly zkoumány 2D a 3D datové kostky v DriftScope, kde bylo možné spočítat vazbu mezi prekurzorem a jeho fragmenty. V HDI se použila dvoukroková korelace: nejprve podle kvadrupólového m/z, poté prostorová korelace pomocí Pearsonova koeficientu pro zvýšení specificity. Identifikována řada lipidů: v pozitivním režimu PC(16:0/16:0)[H]+, PC(16:0_18:1)[K]+, PC(16:0/16:0)[Na]+; v negativním spektru plasmalogeny a glycerofosfolipidy s charakteristickými fragmenty mastných kyselin (FA 16:0, 18:1, 20:4, 22:6).
Očekává se rozšíření SONAR-DESI přístupu na další třídy biomolekul, například metabolity a peptidy, včetně kombinace s iontovou mobilitou. Dále se předpokládá integrace umělé inteligence pro automatizované zpracování vícerozměrných dat a rozšířená aplikace v klinické histopatologii a farmaceutickém vývoji.
Implementace SONAR do DESI MSI výrazně zjednodušuje workflow profilování lipidů v biologických tkáních tím, že umožňuje simultánní sběr prekurzorových i fragmentačních dat. Tato metoda přináší vyšší specifičnost, rychlost a prostorové rozlišení bez nutnosti cílených MS/MS kroků.
1. L. S. Eberlin et al., Non-destructive, Histologically Compatible Tissue Imaging by Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometry; Chembiochem. 2011, 12(14):2129–2132.
2. L. A. Gethings et al., Lipid Profiling of Complex Biological Mixtures by LC/MS Using a Novel Scanning Quadrupole DIA Strategy; Rapid Commun Mass Spectrom. 2017, 31:1599–1606.
LC/TOF, LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS
ZaměřeníVýrobceWaters
Souhrn
Význam tématu
Mass spectrometry imaging (MSI) s technikou DESI je klíčovou metodou pro mapování prostorové distribuce přírodních a patologických molekul v biologických tkáních bez destrukce vzorku. Integrace nového datově nezávislého akvizičního režimu SONAR do DESI workflow umožňuje paralelní sběr informací o prekurzorových a fragmentačních iontech v jednom měření, což zkracuje dobu analýzy a zvyšuje spolehlivost identifikace.
Cíle a přehled studie
Cílem této studie bylo implementovat SONAR režim na hybridní kvadrupól-QTof přístroji Xevo G2-XS a otestovat jeho schopnost současně zobrazit lipidové prekurzory i fragmenty přímo z plátků kryokrájené mozkové tkáně potkana. Studie demonstruje bezproblémový přechod od neřízeného sběru dat k robustní identifikaci biomarkerů lipidy.
Použitá metodika a instrumentace
Analýzy byly provedeny na kryotemem připravených řezích potenciálně biologicky významné mozkové tkáně potkana. Vzorky se vkládaly do DESI zdroje bez další úpravy. Ionizace probíhala v pozitivním i negativním režimu při průtoku rozpouštědla MeOH: voda (95:5) 2 µl/min a tlaku nebulizačního plynu 5 bar. SONAR režim zajišťuje opakovaný sken kvadrupólu v okně m/z s nízkou a následně vysokou kolizní energií (LE a HE) pro každý pixel (100 × 100 µm). Získaná data se vyhodnocovala v softwaru HDI™ v1.4, MassLynx™ a DriftScope™ a k identifikaci lipidů se využila databáze LipidMaps.
Použitá instrumentace
- Xevo G2-XS QTof Mass Spectrometer
- 2D DESI Imaging Stage
- MassLynx Software (SCN 949)
- HDI Software v1.4
- DriftScope Software
Hlavní výsledky a diskuse
LE spektra odhalila intenzivní lipidové ionty v oblasti m/z 700–900. HE spektra poskytla fragmenty od m/z 100 do 900. Pro lepší interpretaci byly zkoumány 2D a 3D datové kostky v DriftScope, kde bylo možné spočítat vazbu mezi prekurzorem a jeho fragmenty. V HDI se použila dvoukroková korelace: nejprve podle kvadrupólového m/z, poté prostorová korelace pomocí Pearsonova koeficientu pro zvýšení specificity. Identifikována řada lipidů: v pozitivním režimu PC(16:0/16:0)[H]+, PC(16:0_18:1)[K]+, PC(16:0/16:0)[Na]+; v negativním spektru plasmalogeny a glycerofosfolipidy s charakteristickými fragmenty mastných kyselin (FA 16:0, 18:1, 20:4, 22:6).
Přínosy a praktické využití metody
- Simultánní zobrazení prekurzorů a fragmentů v jednom měření
- Omezení potřeb manuálních MS/MS experimentů
- Zvýšená přesnost identifikace lipidů v komplexních vzorcích
- Rychlé a netoxické vzorkování biologických tkání
Budoucí trendy a možnosti využití
Očekává se rozšíření SONAR-DESI přístupu na další třídy biomolekul, například metabolity a peptidy, včetně kombinace s iontovou mobilitou. Dále se předpokládá integrace umělé inteligence pro automatizované zpracování vícerozměrných dat a rozšířená aplikace v klinické histopatologii a farmaceutickém vývoji.
Závěr
Implementace SONAR do DESI MSI výrazně zjednodušuje workflow profilování lipidů v biologických tkáních tím, že umožňuje simultánní sběr prekurzorových i fragmentačních dat. Tato metoda přináší vyšší specifičnost, rychlost a prostorové rozlišení bez nutnosti cílených MS/MS kroků.
Reference
1. L. S. Eberlin et al., Non-destructive, Histologically Compatible Tissue Imaging by Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometry; Chembiochem. 2011, 12(14):2129–2132.
2. L. A. Gethings et al., Lipid Profiling of Complex Biological Mixtures by LC/MS Using a Novel Scanning Quadrupole DIA Strategy; Rapid Commun Mass Spectrom. 2017, 31:1599–1606.
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
APPLICATION NOTEBOOK - MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS
2016|Waters|Aplikace
[ APPLICATION NOTEBOOK ] MS IMAGING AND AMBIENT IONIZATION-MS FOR METABOLOMICS AND LIPIDOMICS 1 This notebook is an excerpt from the larger Waters’ Application Notebook on Metabolomics and Lipidomics #720005245EN TABLE OF CONTENTS 3 Introduction 4 Biomarker Discovery Directly from…
Klíčová slova
imaging, imagingtissue, tissuemaldi, maldidesi, desihdi, hdimobility, mobilitysection, sectiondefinition, definitionion, ionhdms, hdmsbiomarker, biomarkerimage, imagedesorption, desorptionxenograph, xenographionization
Using Targeted MRM MS Imaging With DESI to Visually Localize Isobaric And/or Low Abundance Lipids
2025|Waters|Aplikace
Application Note Using Targeted MRM MS Imaging With DESI to Visually Localize Isobaric And/or Low Abundance Lipids Emmanuelle Claude Waters Corporation Abstract DESI technique ionizes small molecules such as lipids, efficiently directly from surfaces such as tissue sections, without any…
Klíčová slova
desi, desilocalize, localizeimaging, imagingmrm, mrmvisually, visuallyisobaric, isobarictargeted, targetedlipids, lipidsabundance, abundancehete, hetelow, lowisomeric, isomerichydroxyeicosatetraenoic, hydroxyeicosatetraenoicusing, usingabsolute
TARGETED DESI IMAGING MS OF DRUG DISTRIBUTION AND DRUG- INDUCED LIVER INJURY (DILI) METABOLITES FROM METHAPYRILENE IN THE MALE WISTAR RAT
2024|Waters|Postery
TARGETED DESI IMAGING MS OF DRUG DISTRIBUTION AND DRUGINDUCED LIVER INJURY (DILI) METABOLITES FROM METHAPYRILENE IN THE MALE WISTAR RAT Anthony Midey,1 Emmanuelle Claude,2 Lisa Reid,2 Bindesh Shrestha,1 Steven K Lai,1 Ian D Wilson,3 Robert S Plumb,1 and Roy Martin1…
Klíčová slova
desi, desiimaging, imagingmethapyrilene, methapyrilenetargeted, targetedlipids, lipidsspatial, spatialdruginduced, druginduceddili, dilivehicle, vehiclewistar, wistarzoom, zoomliver, liverqtof, qtofdosed, dosedrats
SPATIAL MAPPING OF LIPIDS AND NEUROTRANSMITTER IN RAT BRAIN SECTIONS USING DESI ION MOBILITY MASS SPECTROMETRY
2019|Waters|Postery
SPATIAL MAPPING OF LIPIDS AND NEUROTRANSMITTER IN RAT BRAIN SECTIONS USING DESI ION MOBILITY MASS SPECTROMETRY Roy Martin1, Anthony J. Midey1, Hernando J. Olivos1, Emmanuelle Claude2, Bindesh Shrestha1 1 Waters Corporation, Milford, MA, USA and 2 Waters Corporation, Wimslow, United…
Klíčová slova
desi, desisections, sectionslipids, lipidsmobility, mobilityimaging, imagingmsi, msitissue, tissueccs, ccscollisional, collisionalbrain, brainion, ionmass, massmetabolite, metaboliteaided, aidedcross