Simultaneous Analysis of Hydrophilic Metabolites Using Triple Quadrupole LC/MS/MS
Aplikace | 2014 | ShimadzuInstrumentace
Analýza hydrofilerických primárních metabolitů je zásadní pro pochopení centrálních metabolických drah v buňkách. Díky simultánnímu sledování aminokyselin, sacharidů, nukleotidů a koenzymů lze získat detailní obraz biologických změn v tkáních i biologických vzorcích, což je klíčové pro výzkum, diagnostiku a kontrolu kvality.
Studie představuje metodiku pro současné stanovení více než 50 hydrosolubilních metabolitů pomocí iontově-párové chromatografie v kombinaci s triple kvadrupólovým hmotnostním spektrometrem Shimadzu LCMS-8040. Hlavním cílem bylo demonstrovat separaci a kvantifikaci klíčových metabolitů a ověřit vliv doby přípravy vzorků na analytickou výtěžnost.
Metoda využívá:
KRM chromatogramy ukázaly odlišné chování různých metabolitů během prodlevy před extrakcí. ATP a ADP vykazovaly rapidní pokles, zatímco AMP, jejich degradační produkt, rostl s časem. Naopak glutamát zůstal stabilní. Tyto výsledky potvrzují, že čas přípravy vzorku významně ovlivňuje kvantifikaci nestabilních sloučenin.
Metoda umožňuje:
Vývoj se zaměří na:
Popsaná LC-MS/MS metoda s iontově-párovou chromatografií je efektivní nástroj pro simultánní stanovení širokého spektra hydrofilerických metabolitů. Klíčovým faktorem pro přesnost je rychlá a konzistentní příprava vzorku. Metoda nachází uplatnění v různých oblastech biochemického výzkumu a klinické diagnostiky.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Analýza hydrofilerických primárních metabolitů je zásadní pro pochopení centrálních metabolických drah v buňkách. Díky simultánnímu sledování aminokyselin, sacharidů, nukleotidů a koenzymů lze získat detailní obraz biologických změn v tkáních i biologických vzorcích, což je klíčové pro výzkum, diagnostiku a kontrolu kvality.
Cíle a přehled studie / článku
Studie představuje metodiku pro současné stanovení více než 50 hydrosolubilních metabolitů pomocí iontově-párové chromatografie v kombinaci s triple kvadrupólovým hmotnostním spektrometrem Shimadzu LCMS-8040. Hlavním cílem bylo demonstrovat separaci a kvantifikaci klíčových metabolitů a ověřit vliv doby přípravy vzorků na analytickou výtěžnost.
Použitá metodika a instrumentace
Metoda využívá:
- Reverzní fázi C18; kolona Mastro C18 (2,0 × 150 mm, 3 µm)
- Iontově-párovací činidlo tributylamin v mobilní fázi (15 mmol/l ac. acid, 10 mmol/l tributylamin)
- Mobilní fáze B: methanol; gradientní eluce 0–20 min
- Flow rate 0,3 ml/min, teplota kolony 40 °C, injekční objem 3 µl
- Hmotnostní spektrometr LCMS-8040, ESI v negativním módu, napětí –3,5 kV, plyny: nebulizační 2 l/min, sušicí 10 l/min, DL temp. 250 °C, heat block 400 °C
- MRM (multiple reaction monitoring) pro selektivní detekci 55 metabolitů
- Vzorková příprava: homogenizovaná jaterní tkáň myší, extrakce methanol-chloroformem, test stability po 0, 2 a 10 minutách při RT
Hlavní výsledky a diskuse
KRM chromatogramy ukázaly odlišné chování různých metabolitů během prodlevy před extrakcí. ATP a ADP vykazovaly rapidní pokles, zatímco AMP, jejich degradační produkt, rostl s časem. Naopak glutamát zůstal stabilní. Tyto výsledky potvrzují, že čas přípravy vzorku významně ovlivňuje kvantifikaci nestabilních sloučenin.
Přínosy a praktické využití metody
Metoda umožňuje:
- Komplexní monitorování primárního metabolismu v biologických vzorcích
- Vyšší citlivost a selektivitu díky MRM režimu
- Minimalizaci chyb měřením vlivu přípravy vzorku
- Aplikace v klinickém výzkumu, metabolomice i QA/QC v průmyslové analýze
Budoucí trendy a možnosti využití
Vývoj se zaměří na:
- Automatizaci přípravy vzorků pro zvýšení reprodukovatelnosti
- Rozšíření panelu o labilní nebo nízko-abundantní metabolity
- Integraci s vysokorozlišovacími analyzátory pro neznámé metabolity
- Biomarkerové studie v personalizované medicíně
Závěr
Popsaná LC-MS/MS metoda s iontově-párovou chromatografií je efektivní nástroj pro simultánní stanovení širokého spektra hydrofilerických metabolitů. Klíčovým faktorem pro přesnost je rychlá a konzistentní příprava vzorku. Metoda nachází uplatnění v různých oblastech biochemického výzkumu a klinické diagnostiky.
Reference
- Shimadzu Corporation. LC-MS/MS method package for Primary Metabolites. First Edition: June, 2014.
Podobná PDF
Development of accelerate quantification analysis for hydrophilic metabolites using ionparing chromatography with a high-speed triple quadrupole mass spectrometer
2012|Shimadzu|Postery
PO-CON1229E Development of accelerate quantification analysis for hydrophilic metabolites using ionparing chromatography with a high-speed triple quadrupole mass spectrometer IMSC 2012 PWe-023 Zanariah Hashim1; Yudai Dempo1; Tairo Ogura2; Ichiro Hirano2; Junko Iida2; Takeshi Bamba1; Eiichiro Fukusaki1 1 Dept.Biotech., Grad. Sch.…
Klíčová slova
ionparing, ionparingcoenzyme, coenzymehydrophilic, hydrophilicaccelerate, acceleratemetabolites, metabolitesadp, adpspectrometer, spectrometerglycerophosphate, glycerophosphatespeed, speedquadrupole, quadrupoletriple, tripleyeast, yeastquantification, quantificationglucose, glucosechromatography
Quantitative analysis of hydrophilic metabolite using ion-paring chromatography with a high-speed triple quadrupole mass spectrometer
2012|Shimadzu|Postery
Quantitative analysis of hydrophilic metabolite using ion-paring chromatography with a high-speed triple quadrupole mass spectrometer ASMS 2012 ThP11-251 Zanariah Hashim1; Yudai Dempo1; Tairo Ogura2; Ichiro Hirano2; Junko Iida2; Takeshi Bamba1; Eiichiro Fukusaki1 1 Dept.Biotech., Grad. Sch. Eng., Osaka Univ., Suita,…
Klíčová slova
paring, paringhydrophilic, hydrophiliccoenzyme, coenzymemetabolite, metaboliteadp, adpquantitative, quantitativespectrometer, spectrometerglycerophosphate, glycerophosphatespeed, speedquadrupole, quadrupoletriple, tripleyeast, yeastion, ionglucose, glucosechromatography
Discovery Metabolomics LC/MS Methods Optimized for Polar Metabolites
2019|Agilent Technologies|Aplikace
Application Note Metabolomics Discovery Metabolomics LC/MS Methods Optimized for Polar Metabolites Authors Yuqin Dai and Jordy J. Hsiao Agilent Technologies, Inc. Abstract High pH and low pH hydrophilic interaction chromatography (HILIC) methods were developed to provide comprehensive coverage of many…
Klíčová slova
neg, negseparated, separatedcounts, countspos, posmetabolites, metabolitesnormalized, normalizedacquisition, acquisitionoptimized, optimizeddrying, dryingsheath, sheathajs, ajscoeluted, coelutedmetabolite, metabolitehilic, hilicgas
Comprehensive Analysis of Hydrophilic Metabolites Using Shim-pack™ Mix-HILIC
2024|Shimadzu|Aplikace
High Performance Liquid Chromatograph Mass Spectrometer LCMS-8060NX Application News Comprehensive Analysis of Hydrophilic Metabolites Using Shim-pack™ Mix-HILIC Yutaka Umakoshi User Benefits The Shim-pack Mix-HILIC provides a comprehensive analysis of hydrophilic metabolites. It is applicable to biological samples such…
Klíčová slova
nucleotide, nucleotideamino, aminoacid, acidcoenzyme, coenzymecoa, coaadenine, adeninefad, fadfmn, fmnamp, ampadenosine, adenosinearg, argglu, glunucleobase, nucleobaseadp, adpcytosine