Real-Time Collisional Energy Optimization on the Orbitrap Fusion Platform for Confident Unknown Identification
Postery | 2018 | Thermo Fisher ScientificInstrumentace
Real-time optimalizace kolizní energie při rozpadu malých molekul v hmotnostní spektrometrii mající architekturu Tribrid umožňuje automatickou volbu nejvhodnějšího energetického nastavení pro každý analyzovaný prekurzor bez nutnosti opakovaných injekcí vzorku. Tato strategie zvyšuje kvalitu záznamu fragmentačních spekter, zlepšuje spolehlivost identifikace neznámých sloučenin a šetří čas i kapacitu analýz.
Studie představuje novou akviziční metodu s názvem Assisted Collision Energy (ACE) ve verzi softwaru 3.1 pro Tribrid platformu Thermo Fisher. Cílem je v reálném čase sledovat úroveň nezreagovaného prekurzoru v iontovém pastu a na základě zvoleného prahu (např. 20 % zbývajícího signálu) určit optimální kolizní energii pro následující analytické FTMS2 spektrum. Metoda je testována na standardních směsích a na extraktu z čínského žen-šenu.
Ultrarychlá kapalinová chromatografie byla prováděna na systému Thermo Vanquish UHPLC s kolonou Thermo Accucore C18 (2,1×100 mm). Detekce probíhala na Orbitrap ID-X Tribrid hmotnostním spektrometru s FTMS1 (60 000 rozlišení), top-speed ddFTMS2 (30 000) a následným FTMS3 (15 000) za použití HCD aktivace. ACE akvizice zahrnuje pět skrytých iontových pastových skenů v úzkém m/z rozsahu kolem prekurzoru (±1 Th), z nichž se generuje pseudo-rozkladová křivka pro volbu ideální energie.
Analýza 5 575 sloučenin v databázi mzCloud ukázala vysokou variabilitu optimálních normalizovaných kolizních energií (průměr 43 ± 27 NCE). Při porovnání režimů stepped HCD a ACE HCD na modelové směsi žen-šenu došlo k průměrnému nárůstu signál-šum (S/N) o ~30 % ve FTMS3 spektru při použití ACE. Dále se ukázalo, že díky paralelnímu provádění iontových pastových testů nedochází k výraznému prodloužení cyklu analýzy, a to i při povolené maximalizaci časů injekce a počtu zkoumaných energií.
Real-time ACE lze rozšířit na další typy aktivací a platformy s paralelním zpracováním, například v kombinaci s iontovou mobilitou. Vývoj strojového učení pro predikci optimální energie předem by mohl dále zefektivnit akvizici. Dále se nabízí využití v komplexních metabolomických a proteomických workflow pro automatické vyladění podmínek v reálném čase.
Assisted Collision Energy představuje robustní a snadno implementovatelnou strategii pro automatickou volbu kolizní energie v hmotnostních spektrometrech Thermo Tribrid. Metoda významně zlepšuje kvalitu a spolehlivost fragmentačních spekter bez podstatného prodloužení doby analýzy a nachází uplatnění při studiu neznámých látek i v rutině QA/QC.
LC/HRMS, LC/MS, LC/MS/MS, LC/Orbitrap
ZaměřeníPotraviny a zemědělství
VýrobceThermo Fisher Scientific
Souhrn
Význam tématu
Real-time optimalizace kolizní energie při rozpadu malých molekul v hmotnostní spektrometrii mající architekturu Tribrid umožňuje automatickou volbu nejvhodnějšího energetického nastavení pro každý analyzovaný prekurzor bez nutnosti opakovaných injekcí vzorku. Tato strategie zvyšuje kvalitu záznamu fragmentačních spekter, zlepšuje spolehlivost identifikace neznámých sloučenin a šetří čas i kapacitu analýz.
Cíle a přehled studie
Studie představuje novou akviziční metodu s názvem Assisted Collision Energy (ACE) ve verzi softwaru 3.1 pro Tribrid platformu Thermo Fisher. Cílem je v reálném čase sledovat úroveň nezreagovaného prekurzoru v iontovém pastu a na základě zvoleného prahu (např. 20 % zbývajícího signálu) určit optimální kolizní energii pro následující analytické FTMS2 spektrum. Metoda je testována na standardních směsích a na extraktu z čínského žen-šenu.
Použitá metodika a instrumentace
Ultrarychlá kapalinová chromatografie byla prováděna na systému Thermo Vanquish UHPLC s kolonou Thermo Accucore C18 (2,1×100 mm). Detekce probíhala na Orbitrap ID-X Tribrid hmotnostním spektrometru s FTMS1 (60 000 rozlišení), top-speed ddFTMS2 (30 000) a následným FTMS3 (15 000) za použití HCD aktivace. ACE akvizice zahrnuje pět skrytých iontových pastových skenů v úzkém m/z rozsahu kolem prekurzoru (±1 Th), z nichž se generuje pseudo-rozkladová křivka pro volbu ideální energie.
Hlavní výsledky a diskuse
Analýza 5 575 sloučenin v databázi mzCloud ukázala vysokou variabilitu optimálních normalizovaných kolizních energií (průměr 43 ± 27 NCE). Při porovnání režimů stepped HCD a ACE HCD na modelové směsi žen-šenu došlo k průměrnému nárůstu signál-šum (S/N) o ~30 % ve FTMS3 spektru při použití ACE. Dále se ukázalo, že díky paralelnímu provádění iontových pastových testů nedochází k výraznému prodloužení cyklu analýzy, a to i při povolené maximalizaci časů injekce a počtu zkoumaných energií.
Přínosy a praktické využití metody
- Vyšší kvalita a bohatší množství fragmentačních iontů pro lepší strukturální charakterizaci.
- Úspora vzorku a času díky eliminaci opakovaných injekcí s různými energiemi.
- Minimální dopad na celkový cyklus měření, kompatibilita se standardními Tribrid metodami.
- Jednoduchá implementace přes grafické uživatelské rozhraní v Method Editoru.
Budoucí trendy a možnosti využití
Real-time ACE lze rozšířit na další typy aktivací a platformy s paralelním zpracováním, například v kombinaci s iontovou mobilitou. Vývoj strojového učení pro predikci optimální energie předem by mohl dále zefektivnit akvizici. Dále se nabízí využití v komplexních metabolomických a proteomických workflow pro automatické vyladění podmínek v reálném čase.
Závěr
Assisted Collision Energy představuje robustní a snadno implementovatelnou strategii pro automatickou volbu kolizní energie v hmotnostních spektrometrech Thermo Tribrid. Metoda významně zlepšuje kvalitu a spolehlivost fragmentačních spekter bez podstatného prodloužení doby analýzy a nachází uplatnění při studiu neznámých látek i v rutině QA/QC.
Reference
- mzCloud Database (www.mzcloud.org)
Obsah byl automaticky vytvořen z originálního PDF dokumentu pomocí AI a může obsahovat nepřesnosti.
Podobná PDF
Thermo Scientific Orbitrap ID-X Tribrid mass spectrometer - PRODUCT SPECIFICATIONS
2018|Thermo Fisher Scientific|Brožury a specifikace
PRODUCT SPECIFICATIONS Orbitrap ID-X Tribrid mass spectrometer Transforming small molecule identification and structure elucidation Keywords Orbitrap ID-X mass spectrometer, AcquireX, small molecule identification, structure elucidation, Tribrid The Thermo Scientific™ Orbitrap ID-X™ Tribrid™ mass spectrometer redefines small molecule identification and characterization…
Klíčová slova
ion, ionorbitrap, orbitrapmass, massinclusion, inclusionexclusion, exclusionmultipole, multipolerouting, routingacquirex, acquirexmsn, msnmolecule, moleculetrap, traptribrid, tribridhcd, hcdanalyzer, analyzerprecursors
Thermo Scientific Orbitrap Tribrid MS Series: Instrument Control Software v.3.5 and v3.5 SP1 Overview
2022|Thermo Fisher Scientific|Ostatní
Thermo Scientific™ Orbitrap™ Tribrid™ MS Series: Instrument Control Software v.3.5 and v3.5 SP1 Overview January-2022 The world leader in serving science 1 Software Release Flexera 2 Download: Orbitrap Tribrid MS Series ICSW v. 3.5 SP1 and Xcalibur 4.5 Software Software…
Klíčová slova
targets, targetsions, ionshcd, hcdfaims, faimsadditional, additionalnormalized, normalizedcollision, collisionauto, autolibrary, librarycalibration, calibrationrtls, rtlsall, allsearch, searchabsolute, absoluteenergy
Orbitrap Tribrid MS Series: Instrument Control Software v.3.5 Overview
2021|Thermo Fisher Scientific|Prezentace
Thermo Scientific™ Orbitrap™ Tribrid™ MS Series: Instrument Control Software v.3.5 Overview The world leader in serving science 1 [email protected] | July-2021 Software Release Flexera 2 Download: Orbitrap Tribrid MS Series ICSW v. 3.5 and Xcalibur 4.5 Software [email protected] | July-2021…
Klíčová slova
targets, targetsions, ionshcd, hcdfaims, faimsadditional, additionalnormalized, normalizedlibrary, librarycollision, collisionauto, autocalibration, calibrationall, allrtls, rtlsabsolute, absolutesearch, searchenergy
Orbitrap IQ-X Tribrid mass spectrometer - PRODUCT SPECIFICATIONS
2021|Thermo Fisher Scientific|Brožury a specifikace
Mass spectrometry PRODUCT SPECIFICATIONS Orbitrap IQ-X Tribrid mass spectrometer Designed to unravel complex chemical structures The Thermo Scientific™ Orbitrap IQ-X™ Tribrid™ mass spectrometer redefines small molecule identification and characterization by leveraging the proven and trusted Tribrid architecture with intelligent MS…
Klíčová slova
ion, ionorbitrap, orbitrapmass, massacquirex, acquirextribrid, tribridthermo, thermoscientific, scientificanalyzer, analyzermolecule, moleculemultipole, multipolerouting, routinginclusion, inclusiontrap, traphcd, hcdfragmentation