Development of accelerate quantification analysis for hydrophilic metabolites using ionparing chromatography with a high-speed triple quadrupole mass spectrometer
Postery | 2012 | ShimadzuInstrumentace
Metabolomika poskytuje komplexní pohled na množství metabolitů v buňkách či organismech. Analýza hydrofilních metabolitů, mezi které patří cukerné fosfáty, organické kyseliny a nukleotidy, je klíčová pro pochopení centrálních energetických drah a jejich regulace. Vysoká rychlost a kvantitativní schopnosti měření jsou nezbytné pro zefektivnění studií s velkým počtem vzorků a pro dynamické sledování metabolických změn.
Hlavním cílem bylo vyvinout zrychlenou kvantitativní metodu pro hydrofilní metabolity pomocí iontově-párové chromatografie (IPC) spojené s vysokorychlostním triple kvadrupólovým hmotnostním spektrometrem. Autoři porovnali různé chromatografické kolony a optimalizovali chromatografické podmínky i parametry ionizace za účelem dosažení analýzy až 96 analytů během 15 minut.
Metoda umožnila separaci a kvantifikaci 96 hydrofilních metabolitů včetně cukerných fosfátů, organických kyselin, nukleotidů a koenzymů v čase kratším než 15 minut. Optimální volbou kolony L-Column ODS se dosáhlo vyhovujících limitů detekce (v rozmezí sub-nanomolárních až mikromolárních) a lineárního rozsahu přes 4 řády. Reprodukibilita retence i špičkových ploch dosahovala RSD nižší než 15 % (častěji pod 5 %). Testovací model z extraktu kvasinek potvrdil detekci 75 složek v koncentracích od 0,4 do 100 000 nM a lineární odezvu analytické odezvy na ředění.
S integrací automatizace vzorkování a pokročilých datových analýz lze dále zvýšit propustnost a informační hodnotu výsledků. Kombinace IPC-MS/MS s technikami na úrovni lipidomiky a proteomiky umožní komplexní multi-omické studie. Dále je perspektivní vývoj nano- a microflow verzí metodiky pro snížení spotřeby vzorku a zvýšení citlivosti.
Studie představuje robustní a rychlou platformu pro kvantifikaci širokého spektra hydrofilních metabolitů. Vyvinutá IPC-MS/MS metoda na LCMS-8040 významně zrychluje analýzu a splňuje nároky na citlivost, linearitu a reprodukovatelnost, což ji činí vhodnou pro metabolomické aplikace.
LC/MS, LC/MS/MS, LC/QQQ
ZaměřeníMetabolomika
VýrobceShimadzu
Souhrn
Význam tématu
Metabolomika poskytuje komplexní pohled na množství metabolitů v buňkách či organismech. Analýza hydrofilních metabolitů, mezi které patří cukerné fosfáty, organické kyseliny a nukleotidy, je klíčová pro pochopení centrálních energetických drah a jejich regulace. Vysoká rychlost a kvantitativní schopnosti měření jsou nezbytné pro zefektivnění studií s velkým počtem vzorků a pro dynamické sledování metabolických změn.
Cíle a přehled studie
Hlavním cílem bylo vyvinout zrychlenou kvantitativní metodu pro hydrofilní metabolity pomocí iontově-párové chromatografie (IPC) spojené s vysokorychlostním triple kvadrupólovým hmotnostním spektrometrem. Autoři porovnali různé chromatografické kolony a optimalizovali chromatografické podmínky i parametry ionizace za účelem dosažení analýzy až 96 analytů během 15 minut.
Použitá instrumentace
- UHPLC: Shimadzu Nexera
- Chromatografická kolona: L-Column ODSII (2 mm × 150 mm, 3 µm)
- Mobilní fáze: A) 10 mM tri-butylammonium/15 mM kyselina octová (H2O/MeOH 97/3), B) methanol
- Gradient: 0–0,5 min 0 % B, 7,5 min 25 % B, 11–11,5 min 90 % B, 15 min návrat na 0 % B
- Průtok: 0,3 mL/min, teplota kolony 40 °C, injekční objem 3 µL
- MS detektor: Shimadzu LCMS-8040, ESI v negativním módu, teploty DL 250 °C, HB 400 °C, suchý plyn 10 L/min, nebulizační plyn 2 L/min
Hlavní výsledky a diskuse
Metoda umožnila separaci a kvantifikaci 96 hydrofilních metabolitů včetně cukerných fosfátů, organických kyselin, nukleotidů a koenzymů v čase kratším než 15 minut. Optimální volbou kolony L-Column ODS se dosáhlo vyhovujících limitů detekce (v rozmezí sub-nanomolárních až mikromolárních) a lineárního rozsahu přes 4 řády. Reprodukibilita retence i špičkových ploch dosahovala RSD nižší než 15 % (častěji pod 5 %). Testovací model z extraktu kvasinek potvrdil detekci 75 složek v koncentracích od 0,4 do 100 000 nM a lineární odezvu analytické odezvy na ředění.
Přínosy a praktické využití metody
- Zvýšená propustnost analýz: 96 metabolitů za 15 minut
- Vysoká citlivost a široký lineární rozsah umožňují kvantitativní sledování metabolických změn
- Metoda vhodná pro metabolomické studie bakteriálních, kvasinkových a vyšších organismů
- Možnost nasazení v QA/QC laboratořích, farmaceutickém výzkumu a klinických aplikacích
Budoucí trendy a možnosti využití
S integrací automatizace vzorkování a pokročilých datových analýz lze dále zvýšit propustnost a informační hodnotu výsledků. Kombinace IPC-MS/MS s technikami na úrovni lipidomiky a proteomiky umožní komplexní multi-omické studie. Dále je perspektivní vývoj nano- a microflow verzí metodiky pro snížení spotřeby vzorku a zvýšení citlivosti.
Závěr
Studie představuje robustní a rychlou platformu pro kvantifikaci širokého spektra hydrofilních metabolitů. Vyvinutá IPC-MS/MS metoda na LCMS-8040 významně zrychluje analýzu a splňuje nároky na citlivost, linearitu a reprodukovatelnost, což ji činí vhodnou pro metabolomické aplikace.
Podobná PDF
Quantitative analysis of hydrophilic metabolite using ion-paring chromatography with a high-speed triple quadrupole mass spectrometer
2012|Shimadzu|Postery
Quantitative analysis of hydrophilic metabolite using ion-paring chromatography with a high-speed triple quadrupole mass spectrometer ASMS 2012 ThP11-251 Zanariah Hashim1; Yudai Dempo1; Tairo Ogura2; Ichiro Hirano2; Junko Iida2; Takeshi Bamba1; Eiichiro Fukusaki1 1 Dept.Biotech., Grad. Sch. Eng., Osaka Univ., Suita,…
Klíčová slova
paring, paringhydrophilic, hydrophiliccoenzyme, coenzymemetabolite, metaboliteadp, adpquantitative, quantitativespectrometer, spectrometerspeed, speedglycerophosphate, glycerophosphatequadrupole, quadrupoletriple, tripleyeast, yeastion, ionglucose, glucosechromatography
Selection Guide Metabolite Analysis - Metabolomics Product Portfolio
2019|Shimadzu|Brožury a specifikace
C146-E280D Selection Guide Metabolite Analysis Metabolomics Product Portfolio Expanding Metabolomics Metabolomics refers to an array of techniques used to comprehensively detect and analyze various metabolites formed in vivo during biological activity. The qualitative and quantitative changes in metabolites reflect the…
Klíčová slova
acid, acidsba, sbametabolites, metabolitesdatabase, databasepackage, packageacids, acidsmetabolomics, metabolomicsphospholipid, phospholipidanalysis, analysisamino, aminomediators, mediatorsmonophosphate, monophosphatecooh, coohmrm, mrmlcms
Shimadzu Selection Guide Metabolite Analysis - Metabolomics Product Portfolio
2019|Shimadzu|Brožury a specifikace
C146-E280D Selection Guide Metabolite Analysis Metabolomics Product Portfolio Expanding Metabolomics Metabolomics refers to an array of techniques used to comprehensively detect and analyze various metabolites formed in vivo during biological activity. The qualitative and quantitative changes in metabolites reflect the…
Klíčová slova
acid, acidsba, sbametabolites, metabolitesdatabase, databasepackage, packageacids, acidsmetabolomics, metabolomicsanalysis, analysisphospholipid, phospholipidamino, aminomediators, mediatorsmonophosphate, monophosphatecooh, coohmrm, mrmlcms
Native amino acid analysis in wine by HILIC separation and detection with single quadrupole mass spectrometry
2019|Thermo Fisher Scientific|Postery
Native amino acid analysis in wine by HILIC separation and detection with single quadrupole mass spectrometry Soo Hyun Park, Katherine Lovejoy, Sylvia Grosse, Mauro De Pra, Stephan Meding, and Frank Steiner, Thermo Fisher Scientific, Dornierstr.4, Germering, Bavaria, Germany, 82110 ABSTRACT…
Klíčová slova
counts, countsmin, minhyp, hypleu, leunva, nvaexternal, externalile, ilephe, phetrp, trppro, proamino, aminotyr, tyrval, valglu, glumet